Caracterização de isolados de Klebsiella oriundos de fezes de crianças com diarréia

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Lopes, Natália de Souza Ribeiro
Data de Publicação: 2019
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/37016
Resumo: A Klebsiella pneumoniae é conhecida mundialmente pelo aparecimento de cepas multirresistentes, trazendo preocupação à comunidade médica e prejuízos à saúde pública com casos significativos de morbidade e mortalidade. Com novas ferramentas de biologia molecular foi possível diferenciar a K.pneumoniae em três grupos filogenéticos, quesão: Klebsiella pneumoniae, Klebsiella variicola e Klebsiella quasipneumoniae. Esta última subdividida em duas subspécies similipneumoniae e quasipneumoniae. Tanto a K. quasipneumoniae como a K. variicola são constantemente confundidas por serem estreitamente semelhantes filogenéticamente com a K.pneumoniae. Para obtermos dados epidemiológicos de enteropatógenos na região Norte do Brasil, iniciamos um estudo que compreendeu isolados de fezes diarreicas de crianças de 0-12 anos dos estados do Amazonas e Rondônia nos anos de 2007 a 2012. Um screening molecular das amostras foi realizado utilizando o gene SHV-Kvar, evidenciando o gênero Klebsiella sp. em 23 isolados. Quanto as espécies, K.quasipneumoniae foi a mais identificada (n=11), seguida de K.variicola (n=5), K.pneumoniae (n=2), e Klebsiella sp. (n=5). Quando analisadosos fenótipos de virulência, a presença de formação de biofilme foi identificado em 20 isolados em diferentes graus de intensidade. Como o biofilme também é pode interferir na antibioticoterapia, estes isolados foram submetidos ao teste de susceptibilidade a antimicrobianos onde, a exceção do isolado 158B, todos os isolados de K. quasipneumoniae apresentaram resistência a pelo menos um antibiótico testado. Os isolados K. quasipneumoniae 125 (Manaus) e PV142 e PV146 (Porto Velho) apresentaram fenótipo de multirresistência MDR e altas taxas de aderência em célula HeLa. Na epidemiologia molecular, 4 grupos (A-D) com forte relação clonal foram identificados. Destacam-se a K. quasipneumoniae PV10800 e K. quasipneumoniae 138D pois estas amostras são diferentes estados da região Norte coletadas em períodos distintos. Com a facilidade que a bactéria Klebsiella possui em transferir plasmídeos de resistência este dado é alarmante, e ressalta a necessidade de uma vigilância epidemiológica ativa e eficaz, com a capacidade de identificação correta de enteropatógenos de maneira clássica e, principalmente, molecular, antes de administração de antibioticoterapia.
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Tanto a K. quasipneumoniae como a K. variicola são constantemente confundidas por serem estreitamente semelhantes filogenéticamente com a K.pneumoniae. Para obtermos dados epidemiológicos de enteropatógenos na região Norte do Brasil, iniciamos um estudo que compreendeu isolados de fezes diarreicas de crianças de 0-12 anos dos estados do Amazonas e Rondônia nos anos de 2007 a 2012. Um screening molecular das amostras foi realizado utilizando o gene SHV-Kvar, evidenciando o gênero Klebsiella sp. em 23 isolados. Quanto as espécies, K.quasipneumoniae foi a mais identificada (n=11), seguida de K.variicola (n=5), K.pneumoniae (n=2), e Klebsiella sp. (n=5). Quando analisadosos fenótipos de virulência, a presença de formação de biofilme foi identificado em 20 isolados em diferentes graus de intensidade. Como o biofilme também é pode interferir na antibioticoterapia, estes isolados foram submetidos ao teste de susceptibilidade a antimicrobianos onde, a exceção do isolado 158B, todos os isolados de K. quasipneumoniae apresentaram resistência a pelo menos um antibiótico testado. Os isolados K. quasipneumoniae 125 (Manaus) e PV142 e PV146 (Porto Velho) apresentaram fenótipo de multirresistência MDR e altas taxas de aderência em célula HeLa. Na epidemiologia molecular, 4 grupos (A-D) com forte relação clonal foram identificados. Destacam-se a K. quasipneumoniae PV10800 e K. quasipneumoniae 138D pois estas amostras são diferentes estados da região Norte coletadas em períodos distintos. Com a facilidade que a bactéria Klebsiella possui em transferir plasmídeos de resistência este dado é alarmante, e ressalta a necessidade de uma vigilância epidemiológica ativa e eficaz, com a capacidade de identificação correta de enteropatógenos de maneira clássica e, principalmente, molecular, antes de administração de antibioticoterapia.Klebsiella pneumoniae is known worldwide for multiresistant strains appearance, bringing concern to medical community and damage to public health with significant cases of morbidity and mortality. With new molecular biology tools it was possible to differentiate K. pneumoniae into three phylogenetic groups: Klebsiella pneumoniae, Klebsiella variicola and Klebsiella quasipneumoniae. The last one was subdivided into two subspecies similipneumoniae and quasipneumoniae both K. quasipneumoniae and K. variicola are constantly missidentified due its closely phylogenetically similarity to K. pneumoniae. In order to obtain epidemiological enteropathogens data the north ernregion of Brazil, we initiated a study that comprised diarrheal stool isolates from children aged 0-12 years from the states of Amazonas and Rondônia during 2007 to 2012. A molecular screening of the samples was performed using SHV-Kvar gene, highlighting the genus Klebsiella sp. in 23 isolates. Regarding species, K. quasipneumoniae was the most identified (n=11), followed by K. variicola (n=5), K. pneumoniae (n=2), and Klebsiella sp. (n = 5). When analyzed virulence phenotypes, the presence of biofilm formation was identified in 20 isolates at different intensity degrees. As biofilm formation can also interfere in antibiotic therapy, these isolates underwent antimicrobial susceptibility testing where, with the exception of 158B isolate, all K. quasipneumoniae isolates were resistant to at least one antibiotic tested. The isolates K. quasipneumoniae 125 (Manaus) and PV142 and PV146 (PortoVelho) showed multiresistance phenotype (MDR) and high HeLa cell adhesion rates. In molecular epidemiology, 4 groups (A-D) with strong clonal relationship were identified. We highlight K. quasipneumoniae PV10800 and K. quasipneumoniae 138D once these samples are from different states of the northern region and, collected at different time periods. With the ability of transferring resistance plasmids, this data is alarming and emphasizes the need for active and effective epidemiological surveillance, with the ability to correctly identify enteropathogens in a classical and molecular manner before antibiotic therapy administration.2020-05-07Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Pesquisas Leônidas e Maria Deane. Manaus, AM, Brasil.porEpidemiologia molecularFenótipos de virulênciaAdesão celularKlebsiellaMolecular epidemiologyVirulence PhenotypesCellular AdhesionKlebsiellaCaracterização de isolados de Klebsiella oriundos de fezes de crianças com diarréiainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2019-08-09Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria DeaneMestrado AcadêmicoManaus, AMPrograma de Pós-Graduação em Biologia da Interação Patógeno-Hospedeiroinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-83082https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/37016/1/license.txt43cf57123dace9a28c9f6b2c996fa81bMD51ORIGINALDissertação Natália Lopes.pdfDissertação Natália Lopes.pdfapplication/pdf2363384https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/37016/2/Disserta%c3%a7%c3%a3o%20Nat%c3%a1lia%20Lopes.pdf81f952a4435082928a0d2c766adcddf4MD52TEXTDissertação Natália Lopes.pdf.txtDissertação Natália Lopes.pdf.txtExtracted texttext/plain119990https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/37016/3/Disserta%c3%a7%c3%a3o%20Nat%c3%a1lia%20Lopes.pdf.txtf05366c0ef662398a16e34ff26fbfe36MD53icict/370162021-06-21 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