Epidemiologia molecular do HIV-1 no Estado do Ceará, Brasil

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Gadelha, Sandra Rocha
Data de Publicação: 2002
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/33962
Resumo: No Brasil, o HIV-1 é representado predominantemente por vírus do subtipo B, embora um aumento no número de vírus não Bs e recombinantes tem sido registrado. O HM A, baseado no gene env, tem sido muito usado neste país como ferramenta para monitorar a distribuição dos subtipos. Como a recombinação intersubtipo é uma importante fonte de variação genética do HIV-1 é de fundamental importância ampliar a subtipagem por HMA para duas regiões distintas do genoma do HIV: env e ga^. O principal objetivo deste trabalho é identificar subtipos circulantes do HIV-1 no estado do Ceará. Este estado está localizado na região Nordeste do Brasil, onde o turismo sexual e a prostituição infantil são fatores que favorecem a disseminação da epidemia do HIV. As amostras foram coletadas no Hospital São José, que é o maior hospital para HIV/AIDS no Ceará. Células mononucleares do sangue periférico foram separadas pela metodologia de Ficol-Hipaque e o DNA genômico extraído através da digestão com proteinase K, seguido de purificação com fenol- clorofórmio. O DNA genômico foi usado para amplificar fragmentos dos genes env e gag através de PCR. Foi utilizada a técnica de HMA para identificar os subtipos circulantes nessa população. Amostras correspondentes à variante brasileira do subtipo B (motivo GWGR) foram identificadas por RFLP usando a enzima de restrição FokI. Foram analisamos 149 amostras positivas para HIV-1 coletadas no ano 2000. Os subtipos B, F e B/F foram identificados. A prevalência do subtipo B foi de 94% e a prevalência de ambos subtipo F e recombinante B/F de 3%. Baseado na análise com a enzima Fokl, 34% das amostras foram identificadas como a variante brasileira do subtipo B (motivo GWGR). Foi demonstrado, nesse estudo, uma predominância de subtipo B semelhante a estudos anteriores realizados com amostras da região sudeste do Brasil. Além disso, foi demonstrado, pela primeira vez, a presença de subtipo F e recombinante B/F no estado Ceará. Estes resultados contribuem para um conhecimento geral da epidemia do HIV no Brasil, fornecendo informações importantes para o planejamento de estratégias relevantes para a saúde pública em nosso país.
id CRUZ_a5f0571da01034a9fd7d53b81c94bee9
oai_identifier_str oai:www.arca.fiocruz.br:icict/33962
network_acronym_str CRUZ
network_name_str Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
repository_id_str 2135
spelling Gadelha, Sandra RochaBrígido, Luíz Fernando de MacedoReis, Mitermayer Galvão dosCastro Filho, Bernardo GalvãoCastro Filho, Bernardo GalvãoShindo, Nice2019-07-10T18:05:08Z2019-07-10T18:05:08Z2002GADELHA, Sandra Rocha. Epidemiologia molecular do HIV-1 no Estado do Ceará, Brasil. 2002. 107 f. Dissertação (Mestrado em Patologia) - Universidade Federal da Bahia. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação Oswaldo Cruz, Salvador, 2002.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/33962No Brasil, o HIV-1 é representado predominantemente por vírus do subtipo B, embora um aumento no número de vírus não Bs e recombinantes tem sido registrado. O HM A, baseado no gene env, tem sido muito usado neste país como ferramenta para monitorar a distribuição dos subtipos. Como a recombinação intersubtipo é uma importante fonte de variação genética do HIV-1 é de fundamental importância ampliar a subtipagem por HMA para duas regiões distintas do genoma do HIV: env e ga^. O principal objetivo deste trabalho é identificar subtipos circulantes do HIV-1 no estado do Ceará. Este estado está localizado na região Nordeste do Brasil, onde o turismo sexual e a prostituição infantil são fatores que favorecem a disseminação da epidemia do HIV. As amostras foram coletadas no Hospital São José, que é o maior hospital para HIV/AIDS no Ceará. Células mononucleares do sangue periférico foram separadas pela metodologia de Ficol-Hipaque e o DNA genômico extraído através da digestão com proteinase K, seguido de purificação com fenol- clorofórmio. O DNA genômico foi usado para amplificar fragmentos dos genes env e gag através de PCR. Foi utilizada a técnica de HMA para identificar os subtipos circulantes nessa população. Amostras correspondentes à variante brasileira do subtipo B (motivo GWGR) foram identificadas por RFLP usando a enzima de restrição FokI. Foram analisamos 149 amostras positivas para HIV-1 coletadas no ano 2000. Os subtipos B, F e B/F foram identificados. A prevalência do subtipo B foi de 94% e a prevalência de ambos subtipo F e recombinante B/F de 3%. Baseado na análise com a enzima Fokl, 34% das amostras foram identificadas como a variante brasileira do subtipo B (motivo GWGR). Foi demonstrado, nesse estudo, uma predominância de subtipo B semelhante a estudos anteriores realizados com amostras da região sudeste do Brasil. Além disso, foi demonstrado, pela primeira vez, a presença de subtipo F e recombinante B/F no estado Ceará. Estes resultados contribuem para um conhecimento geral da epidemia do HIV no Brasil, fornecendo informações importantes para o planejamento de estratégias relevantes para a saúde pública em nosso país.In Brazil HlV-1 is predominantly represented by subtype B viruses nevertheless an increasing number of non-B and few recombinants have being reported. HMA based on the env gene has been largely used in Brazil as a tool for monitoring subtype distribution. Since intersubtype recombination is an impoiiant sourcc of HIV-1 genetic variation it is of paramount importance to extend HMA subtyping using two distinct HIV regions; env e gag. The main goal of the present work is to identify circulating IIIV-I subtypes in Ceará State using env and gag HMA. Ceará state is located in the Northeast region of Brazil, where social problems such as sexual tourism and child prostitution represent enhancing factors to the spreading of HIV epidemics. Samples were collected at São José Hospital, which is the major hospital for HIV/AIDS in Ceará. PBMCs were separated by Ficol-Hypaque method and genomic i)NA extracted using protein-K digestion followed by phenol-chloroform purification. Genomic DNA was used to amplify fragments of the env and gag gene through PCR. These fragments were used in order to identify the circulating HIV-1 subtypes in this population using HMA. Samples corresponding to the typical Brazilian subtype B variant were further identified by RFLP using FokI restriction enzyme. We analyzed 149 HIV-1 positive samples collected along the year 2000. Subypes: B, F and B/l ’ were identified. The prevalence of subtype B was 94% and the prevalence of both subtype F and B/F recombinants were 3%. Based on FokI RFLP, 34% of the subtype B samples were ideaufied as corresponding to the typical Brazilian subtype B. We demonstrated a predominance of subtype B similar to previous results from studies done with samples from the southeast region of Brazil. In the present study we show for first time the presence of HIV-1 subtype F and B/F in Ceará State. Our results contribute to the overall knowledge of the HIV epidemics in Brazil Providing important information to support future planning for good public health care in our country.CNPq - processo n° 521128/98-6. CNDST/AIDS/ Ministério da Saúde. FIOCRUZ - bolsa de estudo no período de março de 2000 a fevereiro de 2002.Universidade Federal da Bahia. Faculdade de Medicina. Salvador, BA, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil.porCentro de Pesquisas Gonçalo MonizEpidemiologia MolecularHIV-1Molecular EpidemiologyHIV-1Epidemiologia molecular do HIV-1 no Estado do Ceará, Brasilinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2002Coordenação de EnsinoUniversidade Federal da Bahia. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz.Mestrado AcadêmicoSalvador/BAPós-Graduação em Patologiainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/33962/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINALSandra Rocha Gadelha Epidemiologia...2002.pdfSandra Rocha Gadelha Epidemiologia...2002.pdfapplication/pdf9433847https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/33962/2/Sandra%20Rocha%20Gadelha%20Epidemiologia...2002.pdfe0aa4857b92134960e903c383404b6a4MD52TEXTSandra Rocha Gadelha Epidemiologia...2002.pdf.txtSandra Rocha Gadelha Epidemiologia...2002.pdf.txtExtracted texttext/plain139143https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/33962/3/Sandra%20Rocha%20Gadelha%20Epidemiologia...2002.pdf.txt4d8246b187e3473e91f2cf9708e21465MD53icict/339622019-07-11 02:17:18.92oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352019-07-11T05:17:18Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Epidemiologia molecular do HIV-1 no Estado do Ceará, Brasil
title Epidemiologia molecular do HIV-1 no Estado do Ceará, Brasil
spellingShingle Epidemiologia molecular do HIV-1 no Estado do Ceará, Brasil
Gadelha, Sandra Rocha
Epidemiologia Molecular
HIV-1
Molecular Epidemiology
HIV-1
title_short Epidemiologia molecular do HIV-1 no Estado do Ceará, Brasil
title_full Epidemiologia molecular do HIV-1 no Estado do Ceará, Brasil
title_fullStr Epidemiologia molecular do HIV-1 no Estado do Ceará, Brasil
title_full_unstemmed Epidemiologia molecular do HIV-1 no Estado do Ceará, Brasil
title_sort Epidemiologia molecular do HIV-1 no Estado do Ceará, Brasil
author Gadelha, Sandra Rocha
author_facet Gadelha, Sandra Rocha
author_role author
dc.contributor.member.none.fl_str_mv Brígido, Luíz Fernando de Macedo
Reis, Mitermayer Galvão dos
Castro Filho, Bernardo Galvão
dc.contributor.author.fl_str_mv Gadelha, Sandra Rocha
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Castro Filho, Bernardo Galvão
Shindo, Nice
contributor_str_mv Castro Filho, Bernardo Galvão
Shindo, Nice
dc.subject.other.pt_BR.fl_str_mv Epidemiologia Molecular
HIV-1
topic Epidemiologia Molecular
HIV-1
Molecular Epidemiology
HIV-1
dc.subject.en.pt_BR.fl_str_mv Molecular Epidemiology
HIV-1
description No Brasil, o HIV-1 é representado predominantemente por vírus do subtipo B, embora um aumento no número de vírus não Bs e recombinantes tem sido registrado. O HM A, baseado no gene env, tem sido muito usado neste país como ferramenta para monitorar a distribuição dos subtipos. Como a recombinação intersubtipo é uma importante fonte de variação genética do HIV-1 é de fundamental importância ampliar a subtipagem por HMA para duas regiões distintas do genoma do HIV: env e ga^. O principal objetivo deste trabalho é identificar subtipos circulantes do HIV-1 no estado do Ceará. Este estado está localizado na região Nordeste do Brasil, onde o turismo sexual e a prostituição infantil são fatores que favorecem a disseminação da epidemia do HIV. As amostras foram coletadas no Hospital São José, que é o maior hospital para HIV/AIDS no Ceará. Células mononucleares do sangue periférico foram separadas pela metodologia de Ficol-Hipaque e o DNA genômico extraído através da digestão com proteinase K, seguido de purificação com fenol- clorofórmio. O DNA genômico foi usado para amplificar fragmentos dos genes env e gag através de PCR. Foi utilizada a técnica de HMA para identificar os subtipos circulantes nessa população. Amostras correspondentes à variante brasileira do subtipo B (motivo GWGR) foram identificadas por RFLP usando a enzima de restrição FokI. Foram analisamos 149 amostras positivas para HIV-1 coletadas no ano 2000. Os subtipos B, F e B/F foram identificados. A prevalência do subtipo B foi de 94% e a prevalência de ambos subtipo F e recombinante B/F de 3%. Baseado na análise com a enzima Fokl, 34% das amostras foram identificadas como a variante brasileira do subtipo B (motivo GWGR). Foi demonstrado, nesse estudo, uma predominância de subtipo B semelhante a estudos anteriores realizados com amostras da região sudeste do Brasil. Além disso, foi demonstrado, pela primeira vez, a presença de subtipo F e recombinante B/F no estado Ceará. Estes resultados contribuem para um conhecimento geral da epidemia do HIV no Brasil, fornecendo informações importantes para o planejamento de estratégias relevantes para a saúde pública em nosso país.
publishDate 2002
dc.date.issued.fl_str_mv 2002
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2019-07-10T18:05:08Z
dc.date.available.fl_str_mv 2019-07-10T18:05:08Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv GADELHA, Sandra Rocha. Epidemiologia molecular do HIV-1 no Estado do Ceará, Brasil. 2002. 107 f. Dissertação (Mestrado em Patologia) - Universidade Federal da Bahia. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação Oswaldo Cruz, Salvador, 2002.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/33962
identifier_str_mv GADELHA, Sandra Rocha. Epidemiologia molecular do HIV-1 no Estado do Ceará, Brasil. 2002. 107 f. Dissertação (Mestrado em Patologia) - Universidade Federal da Bahia. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação Oswaldo Cruz, Salvador, 2002.
url https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/33962
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz
publisher.none.fl_str_mv Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
instacron:FIOCRUZ
instname_str Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
instacron_str FIOCRUZ
institution FIOCRUZ
reponame_str Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
collection Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
bitstream.url.fl_str_mv https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/33962/1/license.txt
https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/33962/2/Sandra%20Rocha%20Gadelha%20Epidemiologia...2002.pdf
https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/33962/3/Sandra%20Rocha%20Gadelha%20Epidemiologia...2002.pdf.txt
bitstream.checksum.fl_str_mv 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33
e0aa4857b92134960e903c383404b6a4
4d8246b187e3473e91f2cf9708e21465
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
repository.mail.fl_str_mv repositorio.arca@fiocruz.br
_version_ 1813008986323025920