Estratégia genômica para controle epidemiológico de neisseria meningitidis por meio de tipificação genética baseada no pefil de dissociação de dna de alta resolução e sequenciamento genômico : implicações nas ações de vigilância em saúde de doenças infecciosas

• Autor(a) principal: Santos, Debora Ribeiro de Souza
• Data de Publicação: 2022
• Tipo de documento: Tese
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
• Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/60092
• topic: Neisseria meningitidis; Genoma; genética; Neisseria meningitidis; Genoma; genética

Neisseria meningitidis (Nm) ou meningococo é o agente causador da doença meningocócica. Diferenças na composição da sua cápsula polissacarídica permitem a classificação da Nm em 12 sorogrupos distintos. A caracterização genética de isolados de meningococos é extremamente importante para o monitoramento epidemiológico da doença meningocócica (DM), através da identificação de clones epidêmicos circulantes, a fim de subsidiar ações específicas de Vigilância Sanitária para contenção de surtos. Esse monitoramento epidemiológico é realizado em diferentes países através da técnica de Multilocus Sequence Typing (MLST). No Brasil, o MLST não é realizado rotineiramente devido ao seu custo elevado. No entanto, métodos baseados na qPCR podem ser utilizados para o mesmo fim, com redução dos custos e maior facilidade de processamento quando comparados ao sequenciamento de DNA. O objetivo desse estudo é estabelecer uma estratégia para o controle epidemiológico da Nm através da detecção de assinaturas genéticas em genes do MLST pelo método de high-resolution DNA melting analysis (HRM) para identificar os principais clones hipervirulentos circulantes no país. No total, 920 reações de qPCR-HRM foram realizadas no termociclador Thermo Fisher QuantStudioTM 5 Real-Time PCR Systems e 1.082 reações foram realizadas no QuantStudioTM 7 Flex Real-Time PCR Systems. Os genes testados foram abcZ, adk, aroE, fumC, gdh e pdhC e os resultados obtidos foram semelhantes nos dois equipamentos. A porcentagem na detecção dos alelos testados para cada complexo clonal ficou entre 77% e 100% de acerto. Após busca ativa no PubMLST verificou-se que ao inserir nesse banco de dados resultados de ao menos quatro alelos, foi possível determinar o complexo clonal em 99% a 100% das amostras depositadas no banco. Os resultados obtidos neste estudo sugerem que é possível identificar os complexos clonais de Nm através da análise da temperatura das curvas de melting (TM) geradas por HRM. Também foi realizado o sequenciamento do genoma de três cepas do cc11/ET15 e duas do sorogrupo W a fim de avaliar os genes de virulência apresentados por essas cepas. Os resultados encontrados revelam a presença de fatores de resistência, elementos genéticos móveis e fatores de virulência não encontrados em cepas não ET-15 que poderiam explicar as altas taxas de letalidade atribuídas a essa variante e também ao sorogrupo W. Essas informações podem auxiliar na vigilância epidemiológica e nas estratégias de vacinação para evitar a disseminação de novos clones hipervirulentos