Diversidade de cepas de Stenotrophomonas maltophilia isoladas entre 1958 e 2021 e genotipadas por multilocus sequence typing

• Autor(a) principal: Lage, Rebeca Vitória da Silva
• Data de Publicação: 2021
• Outros Autores: Costa, Paula Vasconcelos, Costa, Luciana Veloso da, Vasconcellos, Luiza, Silva, Samara Verley da, Villas-Bôas, Maria Helena Simões, Brandão, Marcelo Luiz Lima
• Tipo de documento: Artigo
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
• Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/53624
• topic: Epidemiologia; MLST; Caracterização molecular; Stenotrophomonas maltophilia; Epidemiology; MLST; Molecular characterization; Stenotrophomonas maltophilia; Epidemiología; MLST; Caracterización molecular; Stenotrophomonas maltophilia; Epidemiologia; Homólogo LST8 da Proteína Associada a MTOR; Stenotrophomonas maltophilia

O objetivo deste estudo foi avaliar os dados in silico de cepas de S. maltophilia (n=974) caracterizadas por Multilocus Sequence Typing (MLST) disponíveis no banco PubMLST isoladas entre 1958 e 2020. As cepas com perfil alélico completo (n=972) foram analisadas utilizando a árvore filogenética neighbor-joining, a ferramenta minimum spanning tree e o algoritmo eBURST. O índice de Simpson foi aplicado para calcular o poder de resolução do MLST para tipificação. A maioria das cepas depositadas são de origem clínica (87,6%) e oriundas da Ásia (47,1%). As cepas de S. maltophilia apresentaram alta diversidade genética quando avaliadas, sendo identificadas em 679 ST distintos, uma taxa de ~1,4 cepa/ST. O índice de Simpson calculado foi de 0,99. O Brasil possui 10 cepas depositadas classificadas em sete ST distintos, sendo quatro isolados de infecções em humanos. Em conclusão, o MLST apresentou-se como uma ferramenta poderosa para investigações epidemiológicas de cepas de S. maltophilia.