A potential SARS-CoV-2 variant of interest (VOI) harboring mutation E484K in the spike protein was identified within lineage B.1.1.33 circulating in Brazil
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Resumo: | Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas (FAPEAM). Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq). CNPq/Ministério da Ciência, Tecnologia, Inovações e Comunicações/Ministério da Saúde (MS/FNDCT/SCTIE/Decit). Inova Fiocruz/Fundação Oswaldo Cruz. Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro (FAPERJ). |
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Viruses, v. 13, n. 5, p. 1-7, 2021.1999-4915https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/5262110.3390/v13050724Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas (FAPEAM). Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq). CNPq/Ministério da Ciência, Tecnologia, Inovações e Comunicações/Ministério da Saúde (MS/FNDCT/SCTIE/Decit). Inova Fiocruz/Fundação Oswaldo Cruz. Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro (FAPERJ).Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Rede de Vigilância Genômica Fiocruz COVID-19. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios e Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Rede de Vigilância Genômica Fiocruz COVID-19. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Plataforma de Vigilância Molecular. Salvador, BA, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. 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São José dos Pinhais, PR, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Espírito Santo. Vitoria, ES, Brasil / Universidade Federal do Espírito Santo. Núcleo de Doenças Infecciosas. Vitoria, ES, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Alagoas. Maceió, AL, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Sergipe. Aracaju, SE, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Rio Grande do Sul. Porto Alegre, RS, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Santa Catarina. Florianópolis, SC, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Horizonte, MG, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Rede de Vigilância Genômica Fiocruz COVID-19. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Ceará. Eusébio, CE, Brasil.Instituto Adolfo Lutz. São Paulo, SP, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Amazonas, Manaus, AM, Brasil.Fundação de Vigilância em Saúde do Amazonas. Manaus. AM, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Rede de Vigilância Genômica Fiocruz COVID-19. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Espírito Santo. Departamento de Biologia. Centro de Ciências Exatas, Naturais e da Saúde. Alegre, ES, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Rede de Vigilância Genômica Fiocruz COVID-19. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Entomologia e Núcleo de Bioinformática. Recife, PE, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Rede de Vigilância Genômica Fiocruz COVID-19. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório de Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Manaus, AM, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Rede de Vigilância Genômica Fiocruz COVID-19. 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On the other hand, epidemiologically relevant B.1.1.33 deriving lineages have not been described so far. Here we report the identification of a new SARS-CoV-2 VOI within lineage B.1.1.33 that also harbors mutation S:E484K and was detected in Brazil between November 2020 and February 2021. This VOI displayed four non-synonymous lineage-defining mutations (NSP3:A1711V, NSP6:F36L, S:E484K, and NS7b:E33A) and was designated as lineage N.9. The VOI N.9 probably emerged in August 2020 and has spread across different Brazilian states from the Southeast, South, North, and Northeast regions.engMDPIhttps://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/47114SARS-CoV-2E484KVariante de interesseEpidemiologia genômicaBrasilSARS-CoV-2E484KVariant of InterestGenomic epidemiologyBrazilSARS-CoV-2E484KVariante de interésEpidemiología genómicaBrasilSRAS-CoV-2E484KVariante d'intérêtÉpidémiologie génomiqueBrésilA potential SARS-CoV-2 variant of interest (VOI) harboring mutation E484K in the spike protein was identified within lineage B.1.1.33 circulating in Brazilinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82991https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/52621/1/license.txt5a560609d32a3863062d77ff32785d58MD51ORIGINALResende Paola - A Potential SARS-CoV-2.pdfResende Paola - 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