A potential SARS-CoV-2 variant of interest (VOI) harboring mutation E484K in the spike protein was identified within lineage B.1.1.33 circulating in Brazil

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Resende, Paola Cristina
Data de Publicação: 2021
Outros Autores: Gräf, Tiago, Paixão, Anna Carolina Dias, Appolinario, Luciana, Lopes, Renata Serrano, Mendonça, Ana Carolina da Fonseca, Rocha, Alice Sampaio Barreto da, Motta, Fernando Couto, Neto, Lidio Gonçalves Lima, Khouri, Ricardo, Oliveira, Camila I. de, Muccillo, Pedro Santos, Bezerra, João Felipe, Teixeira, Dalane Loudal Florentino, Riediger, Irina, Debur, Maria do Carmo, Rodrigues, Rodrigo Ribeiro, Leite, Anderson Brandão, Santos, Cliomar Alves do, Gregianini, Tatiana Schäffer, Fernandes, Sandra Bianchini, Bernardes, André Felipe Leal, Cavalcanti, Andrea Cony, Miyajima, Fábio, Sachhi, Claudio, Mattos, Tirza, Costa, Cristiano Fernandes da, Delatorre, Edson, Wallau, Gabriel L., Naveca, Felipe G., Bello, Gonzalo, Siqueira, Marilda Mendonça
Tipo de documento: Artigo
Idioma: eng
Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/52621
Resumo: Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas (FAPEAM). Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq). CNPq/Ministério da Ciência, Tecnologia, Inovações e Comunicações/Ministério da Saúde (MS/FNDCT/SCTIE/Decit). Inova Fiocruz/Fundação Oswaldo Cruz. Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro (FAPERJ).
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Viruses, v. 13, n. 5, p. 1-7, 2021.1999-4915https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/5262110.3390/v13050724Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas (FAPEAM). Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq). CNPq/Ministério da Ciência, Tecnologia, Inovações e Comunicações/Ministério da Saúde (MS/FNDCT/SCTIE/Decit). Inova Fiocruz/Fundação Oswaldo Cruz. Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro (FAPERJ).Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Rede de Vigilância Genômica Fiocruz COVID-19. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios e Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Rede de Vigilância Genômica Fiocruz COVID-19. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Plataforma de Vigilância Molecular. Salvador, BA, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. 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São José dos Pinhais, PR, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Espírito Santo. Vitoria, ES, Brasil / Universidade Federal do Espírito Santo. Núcleo de Doenças Infecciosas. Vitoria, ES, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Alagoas. Maceió, AL, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Sergipe. Aracaju, SE, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Rio Grande do Sul. Porto Alegre, RS, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Santa Catarina. Florianópolis, SC, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Horizonte, MG, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Rede de Vigilância Genômica Fiocruz COVID-19. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Ceará. Eusébio, CE, Brasil.Instituto Adolfo Lutz. 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Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de AIDS e Imunologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Rede de Vigilância Genômica Fiocruz COVID-19. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios e Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.The severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) epidemic in Brazil was dominated by two lineages designated as B.1.1.28 and B.1.1.33. The two SARS-CoV-2 variants harboring mutations at the receptor-binding domain of the Spike (S) protein, designated as lineages P.1 and P.2, evolved from lineage B.1.1.28 and are rapidly spreading in Brazil. Lineage P.1 is considered a Variant of Concern (VOC) because of the presence of multiple mutations in the S protein (including K417T, E484K, N501Y), while lineage P.2 only harbors mutation S:E484K and is considered a Variant of Interest (VOI). On the other hand, epidemiologically relevant B.1.1.33 deriving lineages have not been described so far. Here we report the identification of a new SARS-CoV-2 VOI within lineage B.1.1.33 that also harbors mutation S:E484K and was detected in Brazil between November 2020 and February 2021. This VOI displayed four non-synonymous lineage-defining mutations (NSP3:A1711V, NSP6:F36L, S:E484K, and NS7b:E33A) and was designated as lineage N.9. The VOI N.9 probably emerged in August 2020 and has spread across different Brazilian states from the Southeast, South, North, and Northeast regions.engMDPIhttps://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/47114SARS-CoV-2E484KVariante de interesseEpidemiologia genômicaBrasilSARS-CoV-2E484KVariant of InterestGenomic epidemiologyBrazilSARS-CoV-2E484KVariante de interésEpidemiología genómicaBrasilSRAS-CoV-2E484KVariante d'intérêtÉpidémiologie génomiqueBrésilA potential SARS-CoV-2 variant of interest (VOI) harboring mutation E484K in the spike protein was identified within lineage B.1.1.33 circulating in Brazilinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82991https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/52621/1/license.txt5a560609d32a3863062d77ff32785d58MD51ORIGINALResende Paola - A Potential SARS-CoV-2.pdfResende Paola - 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Paixão, Anna Carolina Dias
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Lopes, Renata Serrano
Mendonça, Ana Carolina da Fonseca
Rocha, Alice Sampaio Barreto da
Motta, Fernando Couto
Neto, Lidio Gonçalves Lima
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Oliveira, Camila I. de
Muccillo, Pedro Santos
Bezerra, João Felipe
Teixeira, Dalane Loudal Florentino
Riediger, Irina
Debur, Maria do Carmo
Rodrigues, Rodrigo Ribeiro
Leite, Anderson Brandão
Santos, Cliomar Alves do
Gregianini, Tatiana Schäffer
Fernandes, Sandra Bianchini
Bernardes, André Felipe Leal
Cavalcanti, Andrea Cony
Miyajima, Fábio
Sachhi, Claudio
Mattos, Tirza
Costa, Cristiano Fernandes da
Delatorre, Edson
Wallau, Gabriel L.
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Bello, Gonzalo
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