Comparison of PCR protocols for detecting Histoplasma capsulatum DNA through a multicenter study

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Buitrago, María José
Data de Publicação: 2013
Outros Autores: Canteros, Cristina Elena, Frías de León, Guadalupe, González, Ángel, Marques-Evangelista de Oliveira, Manoel, Muñoz, César O., Ramirez, José Antonio, Toranzo, Adriana Isabel, Zancope-Oliveira, Rosely, Cuenca-Estrella, Manuel
Tipo de documento: Artigo
Idioma: eng
Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/35830
Resumo: Antecedentes: Se realizó un estudio multicéntrico en el que participaron cinco laboratorios miembros de la red MICOMOL a partir del programa CYTED. Los participantes recibieron un panel que contenía muestras de ADN de Histoplasma capsulatum, al igual que paneles con muestras de control negativas y de reacciones cruzadas. Objetivos: El objetivo del presente estudio fue examinar la precisión de los diferentes protocolos de PCR para la detección de ADN de H. capsulatum. Métodos: Se examinaron siete protocolos, todos ellos basados en técnicas de PCR, que empleaban como diana plásmidos unicopia o multicopia. Resultados: la mayoría de estos protocolos (4/7) pudieron detectar las cantidades más pequenas de ADN (10x10 fg/μl). La sensibilidad global fue del 86% y la especificidad del 100%. El protocolo basado en el plásmido unicopia SCAR220 se asoció a la menor sensibilidad (43%) pero a una especificidad del 100%. Los protocolos de PCR en tiempo real fueron muy reproducibles, sensibles y específicos. En ningún caso se detectaron resultados falsos positivos ni reacciones cruzadas.
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spelling Buitrago, María JoséCanteros, Cristina ElenaFrías de León, GuadalupeGonzález, ÁngelMarques-Evangelista de Oliveira, ManoelMuñoz, César O.Ramirez, José AntonioToranzo, Adriana IsabelZancope-Oliveira, RoselyCuenca-Estrella, Manuel2019-09-24T12:24:01Z2019-09-24T12:24:01Z2013BUITRAGO, María José et al. Comparison of PCR protocols for detecting Histoplasma capsulatum DNA through a multicenter study. Revista Iberoamericana de Micología, v. 30, n. 4, p. 256-260.1130-1406https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/3583010.1016/j.riam.2013.03.0042173-9188engElsevierComparison of PCR protocols for detecting Histoplasma capsulatum DNA through a multicenter studyComparación de protocolos de la prueba de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para detección de ADN de Histoplasma capsulatum a través de un estudio multicéntricoinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleAntecedentes: Se realizó un estudio multicéntrico en el que participaron cinco laboratorios miembros de la red MICOMOL a partir del programa CYTED. Los participantes recibieron un panel que contenía muestras de ADN de Histoplasma capsulatum, al igual que paneles con muestras de control negativas y de reacciones cruzadas. Objetivos: El objetivo del presente estudio fue examinar la precisión de los diferentes protocolos de PCR para la detección de ADN de H. capsulatum. Métodos: Se examinaron siete protocolos, todos ellos basados en técnicas de PCR, que empleaban como diana plásmidos unicopia o multicopia. Resultados: la mayoría de estos protocolos (4/7) pudieron detectar las cantidades más pequenas de ADN (10x10 fg/μl). La sensibilidad global fue del 86% y la especificidad del 100%. El protocolo basado en el plásmido unicopia SCAR220 se asoció a la menor sensibilidad (43%) pero a una especificidad del 100%. Los protocolos de PCR en tiempo real fueron muy reproducibles, sensibles y específicos. En ningún caso se detectaron resultados falsos positivos ni reacciones cruzadas.2020-09-24Instituto de Salud Carlos III. Centro Nacional de Microbiología. Servicio de Micología. Majadahonda, Spain.ANLIS “Dr. Carlos G. Malbrán”. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología. Servicio Micosis Profundas. Buenos Aires, Argentina.Hospital Juárez de México. División de Investigación. México D.F., México.Corporación para Investigaciones Biológicas. Unidad de Micología Médica y Experimental. Medellín, Colombia / Universidad de Antioquia. Escuela de Microbiología. Medellín, Colombia.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Pesquisa Clínica Evandro Chagas. Laboratório de Micologia. Setor de Imunodiagnóstico. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Corporación para Investigaciones Biológicas. Unidad de Micología Médica y Experimental. Medellín, Colombia / Universidad de Antioquia. Escuela de Microbiología. Medellín, Colombia.Universidad Nacional Autónoma de México. Departamento de Microbiología y Parasitología. México D.F., México.ANLIS “Dr. Carlos G. Malbrán”. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología. Servicio Micosis Profundas. Buenos Aires, Argentina.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Pesquisa Clínica Evandro Chagas. Laboratório de Micologia. Setor de Imunodiagnóstico. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Instituto de Salud Carlos III. Centro Nacional de Microbiología. Servicio de Micología. Majadahonda, Spain.Background: A multicenter study was conducted. A panel containing DNA from Histoplasma capsulatum, as well as negative and cross-reaction controls, was sent to five different laboratories, members of the MICOMOL network from CYTED Program. Aims: The objective was to assess the accuracy of different PCR protocols to detect H. capsulatum DNA. Methods: Seven different PCR protocols were tested. They were based on PCR techniques and used unicopy and multicopy targets. Results: Most of these protocols (4/7) were able to detect the smallest amounts of fungal DNA (10x10 fg/μl). Overall sensitivity was 86% and specificity was 100%. The protocol based on a unicopy target (SCAR220) presented lower sensitivity (43%) but 100% specificity. The real-time protocols tested were highly reproducible, sensitive, and specific. Neither false positives nor cross-reactions were detected in any protocol. Conclusions: All laboratories were able to amplify H. capsulatum DNA, and real-time PCR seems to be a promising tool to efficiently detect this pathogen in clinical samples.HistoplasmosisMulticenterPCRDiagnosisHistoplasmosisMulticéntricoPCRDiagnósticoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-83104https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/35830/1/license.txt79178e5f2a0eb066867a274556814938MD51ORIGINALve_Buitrago_María_etal_INI_2013.pdfve_Buitrago_María_etal_INI_2013.pdfapplication/pdf396909https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/35830/2/ve_Buitrago_Mar%c3%ada_etal_INI_2013.pdf7ed683ce00df8431aed5407ca49a4e13MD52TEXTve_Buitrago_María_etal_INI_2013.pdf.txtve_Buitrago_María_etal_INI_2013.pdf.txtExtracted 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