Genética reversa de arbovírus: chikungunya, febre amarela e dengue

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Silva Júnior, José Valter Joaquim
Data de Publicação: 2018
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/28045
Resumo: Epidemias e endemias causadas pelos vírus chikungunya (Chikungunya virus, CHIKV), febre amarela (Yellow fever virus, YFV) e dengue (Dengue virus, DENV) têm resultado em elevadas taxas de morbidade e mortalidade, principalmente em regiões tropicais e subtropicais. Atualmente, não há fármacos licenciados contra CHIKV, YFV e DENV e as vacinas aprovadas contra YFV e DENV são restritas quanto à distribuição e público-alvo. Nesse contexto, plataformas de genética reversa viral têm sido demandadas principalmente para o desenvolvimento de vacinas e avaliação em larga escala de compostos antivirais. Os sistemas de genética reversa disponíveis para CHIKV e YFV, no entanto, usam protocolos onerosos e laboriosos de clonagem em Escherichia coli. Em adição, genomas de alguns flavivírus, a exemplo do DENV, frequentemente apresentam considerável instabilidade quando mantidos em bactérias. Para contornar esses vieses, o presente trabalho objetivou a construção e caracterização de sistemas de genética reversa por recombinação homóloga em levedura para CHIKV, YFV e DENV. O sistema de genética reversa para CHIKV gerou o vírus recombinante IC-CHIKV-99659 e também foi usado para o desenvolvimento da linhagem celular BHK-21-GLuc-nsP-CHIKV-99659, essa expressando o gene repórter da Gaussia luciferase (GLuc) sob o comando do subgenoma do CHIKV-99659. O IC-CHIKV-99659 se mostrou infectivo e replicativo e a linhagem BHK-21-GLuc-nsP-CHIKV-99659 apresentouse estável para a expressão dos genes heterólogos. Em relação à genética reversa para YFV e DENV, os vírus YFV-GLuc e pSVJS01-DENV2, previamente obtidos por recombinação homóloga em levedura, foram caracterizados genetica- e fenotipicamente. O YFV-GLuc conservou o gene GLuc íntegro ao longo de seis passagens e apresentou cinética de replicação correlacionada à expressão do gene repórter. O pSVJS01-DENV2 apresentou cinética de replicação semelhantes ao vírus parental e ausência de mutação na região do envelope. Assim, ao desenvolver e caracterizar sistemas estáveis de genética reversa em levedura para CHIKV, YFV e DENV, o presente trabalho fornece uma plataforma alternativa à desenvolvida em bactéria para a manipulação de diferentes genomas virais.
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Nesse contexto, plataformas de genética reversa viral têm sido demandadas principalmente para o desenvolvimento de vacinas e avaliação em larga escala de compostos antivirais. Os sistemas de genética reversa disponíveis para CHIKV e YFV, no entanto, usam protocolos onerosos e laboriosos de clonagem em Escherichia coli. Em adição, genomas de alguns flavivírus, a exemplo do DENV, frequentemente apresentam considerável instabilidade quando mantidos em bactérias. Para contornar esses vieses, o presente trabalho objetivou a construção e caracterização de sistemas de genética reversa por recombinação homóloga em levedura para CHIKV, YFV e DENV. O sistema de genética reversa para CHIKV gerou o vírus recombinante IC-CHIKV-99659 e também foi usado para o desenvolvimento da linhagem celular BHK-21-GLuc-nsP-CHIKV-99659, essa expressando o gene repórter da Gaussia luciferase (GLuc) sob o comando do subgenoma do CHIKV-99659. 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Assim, ao desenvolver e caracterizar sistemas estáveis de genética reversa em levedura para CHIKV, YFV e DENV, o presente trabalho fornece uma plataforma alternativa à desenvolvida em bactéria para a manipulação de diferentes genomas virais.Epidemics and endemics caused by Chikungunya (CHIKV), Yellow fever (YFV) and Dengue (DENV) viruses have resulted in high rates of morbidity and mortality, mainly in tropical and subtropical regions. Currently, there are no licensed drugs against CHIKV, YFV and DENV, and vaccines available for YFV and DENV are restricted in terms of distribution and target audience. In this context, viral reverse genetics platforms have been demanded especially for the development of vaccines and high-throughput assay for screening of antiviral compounds. The reverse genetics systems available for CHIKV and YFV, however, use costly and apply laborious cloning protocols in Escherichia coli. Moreover, flavivirus genoma, such as DENV, are often unstable when maintained in bacteria. To overcome these biases, the present study aimed the construction and characterization of reverse genetics systems by homologous recombination in yeast for CHIKV, YFV and DENV. The reverse genetics system for CHIKV generated the recombinant virus IC-CHIKV-99659 and was also used for the development of the BHK-21-GLuc-nsP-CHIKV-99659 cell line, which expressed the Gaussia luciferase reporter gene (GLuc) under CHIKV subgenome. IC-CHIKV-99659 was shown to be infective and replicative, and the BHK-21-GLuc-nsP-CHIKV-99659 cell line was stable for expression of heterologous genes. Regarding the reverse genetics for YFV and DENV, the YFV-GLuc and pSVJS01-DENV2 viruses, previously obtained by homologous recombination in yeast, were genetically and phenotypically characterized. The YFV-GLuc retained intact the GLuc gene over six cell passages and exhibited replication kinetics correlated to reporter gene expression. The pSVJS01-DENV2 showed replication kinetics similar to the parental virus and lack of mutation in the envelope region. Finally, the present work developed and characterized stable systems of reverse genetics in yeast for CHIKV, YFV and DENV, providing an alternative platform to that developed in bacteria for the manipulation of different viral genomes.CAPES2019-06-21Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil.porVírus ChikungunyaVírus da Febre AmarelaVírus da DengueGenética ReversaChikungunya virusYellow fever virusDengueReverse GeneticsVírus Chikungunya/genéticaVírus da Febre Amarela/genéticaVírus da Dengue/genéticaGenética Reversa/métodosLevedurasGenoma ViralRecombinação HomólogaReplicação ViralLuciferasesGenética reversa de arbovírus: chikungunya, febre amarela e dengueReverse genetics of arbovirus: chikungunya, yellow fever and dengue virusesinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis2018-01-30Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães.Recife/PEPrograma de Pós-Graduação em Biociências e Biotecnologia em Saúdeinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-83092https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/28045/1/license.txt447f2497af1ef5cf99b5c07f6fa18dceMD51ORIGINAL2018silva-junior-jvj.pdf2018silva-junior-jvj.pdfapplication/pdf6706317https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/28045/2/2018silva-junior-jvj.pdfadc268751d8c50d624dc0651a3b3012cMD52TEXT2018silva-junior-jvj.pdf.txt2018silva-junior-jvj.pdf.txtExtracted texttext/plain440316https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/28045/3/2018silva-junior-jvj.pdf.txtca33f892e54090d9fcd9ff9e3112ed64MD53icict/280452021-03-24 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