Detecção e caracterização molecular de astrovírus e norovírus em casos de gastroenterite aguda em crianças hospitalizadas no município do Rio de Janeiro
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Data de Publicação: | 2006 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
Texto Completo: | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/35814 |
Resumo: | A análise de 318 amostras fecais provenientes de crianças com gastroenterite aguda hospitalizadas no município do Rio de Janeiro teve como objetivo a determinação da prevalência de infecções por astrovírus humanos (HAstV) e norovírus (NV) e a caracterização molecular destes agentes. As amostras foram obtidas durante o ano de 2004 em três Hospitais da Rede Municipal (Hospital Jesus, Salles Neto e Souza Aguiar), tendo sido previamente investigadas para detecção de Rotavírus (RV) e Adenovírus entéricos (AdV). Os diferentes protocolos de reação em cadeia pela polimerase precedida pela transcrição reversa (RT-PCR) detectaram um percentual de positividade de 19,8% (63/318) e 13,5% (43/318) para NV e HAstV, respectivamente. Um total de 30 (9.4%) co-infecções foram identificadas, sendo 18 HAstV e RV, oito NV e RV, três HAstV e NV e uma tri-infecção (HAstV, NV, RV). As infecções por HAstV e NV foram detectadas em todas as faixas etárias estudadas, com cerca de 80% das infecções ocorridas em crianças de até 24 meses, sendo que um maior número de casos foi observado em crianças pertencentes à faixa etária de 0-6 e 6-12 meses de idade, respectivamente. As infecções por HAstV apresentaram um pico de positividade durante o período de março a maio, quando observou-se uma queda na temperatura média e nas precipitações. Foram observados dois períodos de maior ocorrência de casos de NV, março-maio e setembro-outubro, sendo evidenciada uma relação inversamente proporcional entre a freqüência de detecção dos NV e as precipitações associando os NV com períodos secos. Vômito, tosse e febre foram as manifestações clínicas mais frequentemente observadas A genotipagem de 35 amostras de HAstV pelo seqüenciamento parcial da fase aberta de leitura 2 (ORF2) caracterizou 25 HAstV-1 (71,4%), 6 HAstV tipo 2 (17,1%), 3 HAstV tipo 8 (8,6%) e 1 HAstV tipo 4 (2,9%). O seqüenciamento parcial da região de 28 amostras que codifica a polimerase dos Norovírus identificou uma amostra como pertencente ao genogrupo I, Grupo Genético GI/2, e as restantes como Genogrupo II. A região analisada não permitiu a caracterização dos grupos genéticos das amostras pertencentes ao Genogrupo GII. Os dados obtidos neste trabalho demonstram a importância dos NV e dos HAstV como importantes agentes da gastroenterite infantil aguda. A implantação do diagnóstico destes vírus poderia auxiliar nos cuidados aos pacientes pela redução no uso desnecessário de antibióticos, principalmente quando o diagnóstico de rotavírus é descartado. |
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Montero, Matías VictoriaLeite, José Paulo GagliardiMiagostovich, Marize Pereira2019-09-23T18:19:41Z2019-09-23T18:19:41Z2006MONTERO, Matías Victoria. Detecção e caracterização molecular de astrovírus e norovírus em casos de gastroenterite aguda em crianças hospitalizadas no município do Rio de Janeiro. 2006. 117 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Parasitária)-Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2006.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/35814A análise de 318 amostras fecais provenientes de crianças com gastroenterite aguda hospitalizadas no município do Rio de Janeiro teve como objetivo a determinação da prevalência de infecções por astrovírus humanos (HAstV) e norovírus (NV) e a caracterização molecular destes agentes. As amostras foram obtidas durante o ano de 2004 em três Hospitais da Rede Municipal (Hospital Jesus, Salles Neto e Souza Aguiar), tendo sido previamente investigadas para detecção de Rotavírus (RV) e Adenovírus entéricos (AdV). Os diferentes protocolos de reação em cadeia pela polimerase precedida pela transcrição reversa (RT-PCR) detectaram um percentual de positividade de 19,8% (63/318) e 13,5% (43/318) para NV e HAstV, respectivamente. Um total de 30 (9.4%) co-infecções foram identificadas, sendo 18 HAstV e RV, oito NV e RV, três HAstV e NV e uma tri-infecção (HAstV, NV, RV). As infecções por HAstV e NV foram detectadas em todas as faixas etárias estudadas, com cerca de 80% das infecções ocorridas em crianças de até 24 meses, sendo que um maior número de casos foi observado em crianças pertencentes à faixa etária de 0-6 e 6-12 meses de idade, respectivamente. As infecções por HAstV apresentaram um pico de positividade durante o período de março a maio, quando observou-se uma queda na temperatura média e nas precipitações. Foram observados dois períodos de maior ocorrência de casos de NV, março-maio e setembro-outubro, sendo evidenciada uma relação inversamente proporcional entre a freqüência de detecção dos NV e as precipitações associando os NV com períodos secos. Vômito, tosse e febre foram as manifestações clínicas mais frequentemente observadas A genotipagem de 35 amostras de HAstV pelo seqüenciamento parcial da fase aberta de leitura 2 (ORF2) caracterizou 25 HAstV-1 (71,4%), 6 HAstV tipo 2 (17,1%), 3 HAstV tipo 8 (8,6%) e 1 HAstV tipo 4 (2,9%). O seqüenciamento parcial da região de 28 amostras que codifica a polimerase dos Norovírus identificou uma amostra como pertencente ao genogrupo I, Grupo Genético GI/2, e as restantes como Genogrupo II. A região analisada não permitiu a caracterização dos grupos genéticos das amostras pertencentes ao Genogrupo GII. Os dados obtidos neste trabalho demonstram a importância dos NV e dos HAstV como importantes agentes da gastroenterite infantil aguda. A implantação do diagnóstico destes vírus poderia auxiliar nos cuidados aos pacientes pela redução no uso desnecessário de antibióticos, principalmente quando o diagnóstico de rotavírus é descartado.Acute viral gastroenteritis is responsible for significant morbidity and mortality among children and human astrovirus (HAstV) and norovirus (NV) have been identified increasingly worldwide as agents of those infections. The goals of this study were to determine the prevalence and molecular characterization of HAstV and NV by reverse-transcription polymerase chain reaction and partial sequencing in 318 fecal samples from children with acute gastroenteritis hospitalized in the municipality of Rio de Janeiro. The samples were obtained in 2004 from three hospitals (Hospital Jesus, Salles Neto and Souza Aguiar) and were previously investigated for the presence of Rotavirus (RV) and enteric Adenovirus (AdV). The viral RNA of NV and HAstV were detected in 20.4% (65) and 13.5% (43) of the samples, respectively. A total of 30 (9.4%) co-infections were identified, where 16 were by HAstV – RV, 8 by NV – RV, 3 by HAstV – NV and 3 mixed infections by HAstV – NV – RV. The infections by HAstV and NV were detected in all age groups, with nearly 80% of the cases occurring in children until 2 years-old, with a higher percentage observed in children under 12 months-old. HAstV infections were more prevalent from March to May of that year, when temperature and rainfall are lower. On the other hand, NV cases were not only detected from March to May but also during September-October, suggesting an association of NV infections with dry season. Vomiting, cough and fever were the main clinical manifestations observed on those cases. The partial sequencing of the open reading frame 2 (ORF2) of 35 HAstV strains characterized 25 (71.4%) as genotype 1 (HAstV-1), 6 (17.1%) HAstV-2, 3 (8.6%) HAstV-8 and 1 (2.9%) HAstV-4. One out of 28 NV was characterized as belonging to Genogroup (G) I, Genetic Cluster 2 by the partial sequencing of the polymerase region gene whereas the others as GII. However, we were unable to cluster the latter G by using this region. The data obtained from this study have demonstrated the importance of NV and HAstV as agents causing acute infantile gastroenteritis and that the diagnostic implementation of those viruses could contribute with patients care, reducing the unnecessary use of antibiotics, mainly when the RV diagnostic is negative.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porGastroenteriteReação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase ReversaEpidemiologia MolecularDetecção e caracterização molecular de astrovírus e norovírus em casos de gastroenterite aguda em crianças hospitalizadas no município do Rio de Janeiroinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2006Instituto Oswaldo CruzFundação Oswaldo CruzRio de JaneiroPrograma de Pós-Graduação em Biologia Parasitáriainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/35814/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINALmatias_monteiro_ioc_mest_2006.pdfapplication/pdf1411717https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/35814/2/matias_monteiro_ioc_mest_2006.pdff88496f660038d493aa01d88d2f5652dMD52TEXTmatias_monteiro_ioc_mest_2006.pdf.txtmatias_monteiro_ioc_mest_2006.pdf.txtExtracted texttext/plain174111https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/35814/3/matias_monteiro_ioc_mest_2006.pdf.txt76f488112abee04035b0d861a7dd3c14MD53icict/358142019-09-24 02:03:57.652oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352019-09-24T05:03:57Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false |
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