A potential SARS-CoV-2 variant of interest (VOI) harboring mutation E484K in the Spike protein was identified within lineage B.1.1.33 circulating in Brazil (preprint)
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Resumo: | A Rede Genômica Fiocruz é formada por especialistas de todas as unidades da Fundação no país e de institutos parceiros que se empenham diariamente em gerar dados mais robustos sobre o comportamento do SARS-Cov-2 e contribuir para um melhor preparo do país no enfrentamento da pandemia em termos de diagnóstico mais precisos e vacinas eficazes. Saiba mais sobre a Rede Genômica Fiocruz em: http://www.genomahcov.fiocruz.br/ |
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A potential SARS-CoV-2 variant of interest (VOI) harboring mutation E484K in the Spike protein was identified within lineage B.1.1.33 circulating in Brazil. bioRxiv, p. 1-9, 13 Mar. 2021.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/4711410.1101/2021.03.12.434969A Rede Genômica Fiocruz é formada por especialistas de todas as unidades da Fundação no país e de institutos parceiros que se empenham diariamente em gerar dados mais robustos sobre o comportamento do SARS-Cov-2 e contribuir para um melhor preparo do país no enfrentamento da pandemia em termos de diagnóstico mais precisos e vacinas eficazes. Saiba mais sobre a Rede Genômica Fiocruz em: http://www.genomahcov.fiocruz.br/FAPEAM (PCTI-EmergeSaude/AM call 005/2020 and Rede Genômica de Vigilância em Saúde - REGESAM)Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (grant 403276/2020-9)Inova Fiocruz/Fundação Oswaldo Cruz (Grant VPPCB-007-FIO-18-2-30 - Geração de conhecimento)Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Plataforma de Vigilância Molecular. Salvador, BA, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Maranhão. São Luís, MA, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Plataforma de Vigilância Molecular. Salvador, BA, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Enfermidades Infecciosas Transmitidas por Vetores. Salvador, BA, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Plataforma de Vigilância Molecular. Salvador, BA, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Enfermidades Infecciosas Transmitidas por Vetores. Salvador, BA, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Plataforma de Vigilância Molecular. Salvador, BA, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Patologia e Biologia Molecular. Salvador, BA, Brasil.Universidade Federal da Paraíba. João Pessoa, PB, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado da Paraiba. João Pessoa, PB, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Paraná. Curitiba, PR, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Paraná. Curitiba, PR, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Espírito Santo. Vitória, ES, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Alagoas. Maceió, AL, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Sergipe. Aracajú, SE, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Rio Grande do Sul. Porto Alegre, RS, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Santa Catarina. Florianópolis, SC, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Ceará. Eusébio, CE, Brasil.Instituto Adolfo Lutz. São Paulo, SP, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Amazonas. Manaus, AM, Brasil.Fundação de Vigilância em Saúde do Amazonas. Manaus, AM, Brasil.Universidade Federal do Espírito Santo. Centro de Ciências Exatas, Naturais e da Saúde. Departamento de Biologia. Alegre, ES, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Manaus, AM, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de AIDS e Imunologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.The SARS-CoV-2 epidemic in Brazil was dominated by two lineages designated as B.1.1.28 and B.1.1.33. Two SARS-CoV-2 variants harboring mutations at the receptor-binding domain of the Spike (S) protein, designated as lineages P.1 and P.2, evolved within lineage B.1.1.28 and are rapidly spreading in Brazil. Lineage P.1 is considered a Variant of Concern (VOC) because of the presence of multiple mutations in the S protein (including K417T, E484K, N501Y), while lineage P.2 only harbors mutation S:E484K and is considered a Variant of Interest (VOI). Here we report the identification of a new SARS-CoV-2 VOI within lineage B.1.1.33 that also harbors mutation S:E484K and was detected in Brazil between November 2020 and February 2021. This VOI displayed four non-synonymous lineage-defining mutations (NSP3:A1711V, NSP6:F36L, S:E484K, and NS7b:E33A) and was designated as lineage N.9. The VOI N.9 probably emerged in August 2020 and has spread across different Brazilian states from the Southeast, South, North and Northeast regions.engbioRxivhttps://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/52621SARS-CoV-2BetacoronavirusEpidemiasMutaçãoBrasilRede Genômica FiocruzGENOMAHCOVSARS-CoV-2BetacoronavirusEpidemicsMutationBrazilA potential SARS-CoV-2 variant of interest (VOI) harboring mutation E484K in the Spike protein was identified within lineage B.1.1.33 circulating in Brazil (preprint)info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleNãoSiminfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-83097https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/47114/1/license.txt36b51ef91c52b5338d9d29ba0cc807bcMD51ORIGINALResende, Paola Cristina A potential SARS-CoV-2 ....pdfResende, Paola Cristina A potential SARS-CoV-2 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