Avaliação da técnica Nested-PCR no diagnóstico de Schistosoma mansoni em caramujos e amostras biológicas humanas
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Data de Publicação: | 2017 |
Tipo de documento: | Tese |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
Texto Completo: | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/28585 |
Resumo: | As técnicas diagnósticas para a esquistossomose apresentam baixa acurácia, tornando-se necessárias novas técnicas para seu diagnóstico. O objetivo do estudo foi avaliar o desempenho de dois sistemas Nested PCR (NPCR) para o diagnóstico de S. mansoni em caramujos e amostras humanas. Foram otimizados quatro ensaios de PCRs simples testando diferentes concentrações de primers e magnésio. Em seguida, esses sistemas foram combinados em duas NPCRs. A sensibilidade dos sistemas foi avaliada nas concentrações entre 1ng e 0,1fg de DNA genômico de S. mansoni e a especificidade com DNA de cercária ave. Nas amostras humanas, a NPCR1 foi avaliada apenas em DNA extraído de amostras de LCR (n=50) de pacientes com ou sem neuroesquistossomose. A NPCR2 foi avaliada em amostras de sangue e urina de indivíduos infectados (n=99) e não infectados (n=21). Para os caramujos, o sistema NPCR2 foi avaliado por mimetismo da infecção em lotes de B. glabrata (n=50), adicionando diferentes concentrações de DNA (1ng, 10pg e 10fg) antes da extração, e através de lotes contendo diferentes quantidades de caramujos infectados em laboratório. A NPCR2 foi cem vezes mais sensível que a NPCR1 amplificando 0,1fg de DNA. Os dois sistemas amplificaram o DNA da cercaria de ave, mas apenas a NPCR2 conseguiu distinção entre as bandas. A NPCR1 apresentou 80% de sensibilidade, 100% de especificidade e valor preditivo positivo, 88% de valor preditivo negativo e 92% de acurácia no LCR. Já a NPCR2 apresentou uma melhor sensibilidade para as amostras de urina, apresentando baixa acurácia no sangue. Para o mimetismo em caramujos, o sistema de NPCR2 amplificou 1ng de DNA, e o lote contendo 1 caramujo com 5 dias de infecção. Conclui-se que a técnica permite o diagnóstico da doença em caramujos e amostras humanas, principalmente em pacientes com neuroesquistossomose. |
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Foram otimizados quatro ensaios de PCRs simples testando diferentes concentrações de primers e magnésio. Em seguida, esses sistemas foram combinados em duas NPCRs. A sensibilidade dos sistemas foi avaliada nas concentrações entre 1ng e 0,1fg de DNA genômico de S. mansoni e a especificidade com DNA de cercária ave. Nas amostras humanas, a NPCR1 foi avaliada apenas em DNA extraído de amostras de LCR (n=50) de pacientes com ou sem neuroesquistossomose. A NPCR2 foi avaliada em amostras de sangue e urina de indivíduos infectados (n=99) e não infectados (n=21). Para os caramujos, o sistema NPCR2 foi avaliado por mimetismo da infecção em lotes de B. glabrata (n=50), adicionando diferentes concentrações de DNA (1ng, 10pg e 10fg) antes da extração, e através de lotes contendo diferentes quantidades de caramujos infectados em laboratório. A NPCR2 foi cem vezes mais sensível que a NPCR1 amplificando 0,1fg de DNA. Os dois sistemas amplificaram o DNA da cercaria de ave, mas apenas a NPCR2 conseguiu distinção entre as bandas. A NPCR1 apresentou 80% de sensibilidade, 100% de especificidade e valor preditivo positivo, 88% de valor preditivo negativo e 92% de acurácia no LCR. Já a NPCR2 apresentou uma melhor sensibilidade para as amostras de urina, apresentando baixa acurácia no sangue. Para o mimetismo em caramujos, o sistema de NPCR2 amplificou 1ng de DNA, e o lote contendo 1 caramujo com 5 dias de infecção. Conclui-se que a técnica permite o diagnóstico da doença em caramujos e amostras humanas, principalmente em pacientes com neuroesquistossomose.Diagnostic techniques for schistosomiasis present low accuracy and new techniques for diagnosis are necessary. The objective of this study was to evaluate the performance of two Nested PCR (NPCR) for the diagnosis of S. mansoni in snails and human samples. Four PCRs protocols were optimized by testing different concentrations of primers and magnesium. These systems were then combined into two NPCRs. The sensitivity of the systems was evaluated at concentrations between 1ng and 0.1fg of S. mansoni genomic DNA and specificity with avian cercariae DNA. In human samples, NPCR1 was evaluated only in DNA extracted from CSF samples (n = 50) from patients with or without neuroschistosomiasis. NPCR2 was evaluated in blood and urine samples from infected (n = 99) and non-infected (n = 21) individuals. For snails, the NPCR2 system was evaluated by mimicking the B. glabrata (n = 50) batch infection, adding different concentrations of DNA (1ng, 10pg and 10fg) prior to extraction, and by lots containing different amounts of snails infected in the laboratory. NPCR2 was one hundred times more sensitive than NPCR1 by amplifying 0.1fg of DNA. The two systems amplified the DNA of the avian cercaria, but only the NPCR2 managed to distinguish between the bands. NPCR1 showed 80% sensitivity, 100% specificity and positive predictive value, 88% negative predictive value and 92% accuracy in CSF samples. On the other hand, the NPCR2 presented a better sensitivity for the urine samples, presenting low accuracy in the blood. For mimicry in snails, the NPCR2 system amplified 1ng of DNA, and the batch containing 1 snail with 5 days of infection. It is concluded that the technique allows the diagnosis of the disease in snails and human samples, mainly in patients with neuroschistosomiasis.CAPES e FACEPEFundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil.porSchistosoma mansoniDiagnósticoReação em Cadeia de PolimeraseSchistosoma mansoniDiagnosticPolymerase Chain ReactionEsquistossomose mansoni/diagnósticoReação em Cadeia da Polimerase/métodosSchistosoma mansoni/isolamento & purificaçäoDNA de helmintos/genéticaSensibilidade e EspecificidadeBenchmarking/métodosEstudos de avaliaçãoHumanosAvaliação da técnica Nested-PCR no diagnóstico de Schistosoma mansoni em caramujos e amostras biológicas humanasNested-PCR evaluation for the diagnosis of Schistosoma mansoni in snails and human biological samplesinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis2016-10-31Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães.Recife/PEPrograma de Pós-Graduação em Biociências e Biotecnologia em Saúdeinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-83092https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/28585/1/license.txt447f2497af1ef5cf99b5c07f6fa18dceMD51ORIGINAL2017wanderley-lb.pdf2017wanderley-lb.pdfapplication/pdf1410453https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/28585/2/2017wanderley-lb.pdfbca38f0acaa915c481b67fd75d4fa556MD52TEXT2017wanderley-lb.pdf.txt2017wanderley-lb.pdf.txtExtracted texttext/plain170089https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/28585/3/2017wanderley-lb.pdf.txt5a7f9479ddb3194bc7c9622da978ecb3MD53icict/285852018-11-24 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