Bioprospecção de genes SpvB de fagos WO em artrópodes coletados nos municípios de Manaus e Presidente Figueiredo no estado do Amazonas-Brasil.
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Data de Publicação: | 2023 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
Texto Completo: | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/60157 |
Resumo: | Recentemente, sequencias com homologia a proteínas inseticidas (SpvB) foram encontrados ocorrendo nos genomas de alguns fagos (WO) de Wolbachia, infectando artrópodes. A identificação dessas proteínas com esse potencial desperta o interesse na procura de fontes naturais de novos compostos para o controle de vetores e pragas agrícolas com a possibilidade de bioprospecção de moléculas com propriedades de toxinas inseticidas. Diante disso este estudo visa a Amazonia como um “hotspots” de biodiversidade do mundo, com o objetivo da obtenção e caracterização de sequencias SpvB de origem WO em uma variedade artrópodes, dos municípios de Manaus e Presidente Figueiredo no estado do Amazonas – Brasil, por médio de um estudo ecológico exploratório. Como resultado foi isolado e caracterizado de um inseto do gênero Crisoperla sp., o gene do domínio SpvB pertencentes a um fago WO_Sr1 integrado no genoma de uma Wolbachia do supergrupo B e foram analisadas sequencias de fagos de Wolbachia contendo genes SpvB_WO como pertencentes a família de fagos Sr1_WO de depósitos do GenBank. Com este estudo foi desenvolvida uma metodologia para a detecção molecular de genes SpvB de fagos WO, além de comprovar que os genes SpvB detectada no inseto do gênero Crisoperla sp., e as sequencias identificadas nos bancos de dados são associados exclusivamente a fagos contendo o segmento de serina recombinasse 1 (Sr1), inserido nos genomas de Wolbachia. Este estudo abre a possibilidade para que novas pesquisas possam explorar as propriedades bioquímicas e biológicas, assim como a maneira em como esses genes SpvB podem afetar seus hospedeiros. |
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Vesga, Kelly Natalia RomeroCortes, Jose Joaquim CarvajalCaragata, Eric PearceFerreira, Francisco Augusto da SilvaCrainey, James Lee2023-08-18T14:02:22Z2023-08-18T14:02:22Z2023VESGA, Kelly Natalia Romero. Bioprospecção de genes SpvB de fagos WO em artrópodes coletados nos municípios de Manaus e Presidente Figueiredo no estado do Amazonas-Brasil. 2023. 73 f. Dissertação (Mestrado em Biologia da Interação Patógeno-Hospedeiro) - Instituto Leônidas e Maria Deane, Fundação Oswaldo Cruz, Manaus, 2023.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/60157Recentemente, sequencias com homologia a proteínas inseticidas (SpvB) foram encontrados ocorrendo nos genomas de alguns fagos (WO) de Wolbachia, infectando artrópodes. A identificação dessas proteínas com esse potencial desperta o interesse na procura de fontes naturais de novos compostos para o controle de vetores e pragas agrícolas com a possibilidade de bioprospecção de moléculas com propriedades de toxinas inseticidas. Diante disso este estudo visa a Amazonia como um “hotspots” de biodiversidade do mundo, com o objetivo da obtenção e caracterização de sequencias SpvB de origem WO em uma variedade artrópodes, dos municípios de Manaus e Presidente Figueiredo no estado do Amazonas – Brasil, por médio de um estudo ecológico exploratório. Como resultado foi isolado e caracterizado de um inseto do gênero Crisoperla sp., o gene do domínio SpvB pertencentes a um fago WO_Sr1 integrado no genoma de uma Wolbachia do supergrupo B e foram analisadas sequencias de fagos de Wolbachia contendo genes SpvB_WO como pertencentes a família de fagos Sr1_WO de depósitos do GenBank. Com este estudo foi desenvolvida uma metodologia para a detecção molecular de genes SpvB de fagos WO, além de comprovar que os genes SpvB detectada no inseto do gênero Crisoperla sp., e as sequencias identificadas nos bancos de dados são associados exclusivamente a fagos contendo o segmento de serina recombinasse 1 (Sr1), inserido nos genomas de Wolbachia. Este estudo abre a possibilidade para que novas pesquisas possam explorar as propriedades bioquímicas e biológicas, assim como a maneira em como esses genes SpvB podem afetar seus hospedeiros.Recently, sequences with homology to insecticidal proteins (SpvB) were found to occur in the genomes of some Wolbachia (WO) phages, infecting arthropods. The identification of these proteins with this potential raises the interest in the search for natural sources of new compounds for the control of vectors and agricultural pests with the possibility of bioprospecting molecules with properties of insecticidal toxins. In view of this, this study aims at the Amazon as a "hotspot" of biodiversity in the world, with the objective of obtaining and characterizing SpvB sequences of WO origin in a variety of arthropods, from the municipalities of Manaus and Presidente Figueiredo in the state of Amazonas-Brazil, by average of an exploratory ecological study. As a result, the SpvB domain gene belonging to a WO_Sr1 phage integrated into the genome of a Wolbachia supergroup B was isolated and characterized from an insect of the genus Crisoperla sp., and Wolbachia phage sequences containing SpvB_WO genes as belonging to the family of Sr1_WO phages from GenBank deposits. With this study, a methodology was developed for the molecular detection of SpvB genes from WO phages, in addition to proving that the SpvB genes detected in the insect of the genus Crisoperla sp., and the sequences identified in the databases are exclusively associated with phages containing the segment serine reassortant 1 (Sr1), inserted into Wolbachia genomes. This study opens the possibility for further research to explore the biochemical and biological properties, as well as the way in which these SpvB genes can affect their hosts.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Manaus, AM, Brasil.porProteínas SpvB;fagos WO;Wolbachia;serina recombinasse 1 (Sr1).SpvB proteins;WO phage;Wolbachia;serine recombination 1 (Sr1).Bioprospecção de genes SpvB de fagos WO em artrópodes coletados nos municípios de Manaus e Presidente Figueiredo no estado do Amazonas-Brasil.info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2023-07-04Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria DeaneMestrado AcadêmicoManaus-AMPrograma de Pós-Graduação em Biologia da Interação Patógeno-Hospedeiroinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZORIGINALDissertação Kelly Natalia Romero Vesga.pdfDissertação Kelly Natalia Romero Vesga.pdfapplication/pdf2159938https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/60157/2/Disserta%c3%a7%c3%a3o%20Kelly%20Natalia%20Romero%20Vesga.pdfec9f897e1de118a614202972becca20dMD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82991https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/60157/1/license.txt5a560609d32a3863062d77ff32785d58MD51icict/601572023-08-18 11:02:23.286oai:www.arca.fiocruz.br:icict/60157Q0VTU8ODTyBOw4NPIEVYQ0xVU0lWQSBERSBESVJFSVRPUyBBVVRPUkFJUwoKQW8gYWNlaXRhciBvcyBURVJNT1MgZSBDT05EScOHw5VFUyBkZXN0YSBDRVNTw4NPLCBvIEFVVE9SIGUvb3UgVElUVUxBUiBkZSBkaXJlaXRvcwphdXRvcmFpcyBzb2JyZSBhIE9CUkEgZGUgcXVlIHRyYXRhIGVzdGUgZG9jdW1lbnRvOgoKKDEpIENFREUgZSBUUkFOU0ZFUkUsIHRvdGFsIGUgZ3JhdHVpdGFtZW50ZSwgw6AgRklPQ1JVWiAtIEZVTkRBw4fDg08gT1NXQUxETyBDUlVaLCBlbQpjYXLDoXRlciBwZXJtYW5lbnRlLCBpcnJldm9nw6F2ZWwgZSBOw4NPIEVYQ0xVU0lWTywgdG9kb3Mgb3MgZGlyZWl0b3MgcGF0cmltb25pYWlzIE7Dg08KQ09NRVJDSUFJUyBkZSB1dGlsaXphw6fDo28gZGEgT0JSQSBhcnTDrXN0aWNhIGUvb3UgY2llbnTDrWZpY2EgaW5kaWNhZGEgYWNpbWEsIGluY2x1c2l2ZSBvcyBkaXJlaXRvcwpkZSB2b3ogZSBpbWFnZW0gdmluY3VsYWRvcyDDoCBPQlJBLCBkdXJhbnRlIHRvZG8gbyBwcmF6byBkZSBkdXJhw6fDo28gZG9zIGRpcmVpdG9zIGF1dG9yYWlzLCBlbQpxdWFscXVlciBpZGlvbWEgZSBlbSB0b2RvcyBvcyBwYcOtc2VzOwoKKDIpIEFDRUlUQSBxdWUgYSBjZXNzw6NvIHRvdGFsIG7Do28gZXhjbHVzaXZhLCBwZXJtYW5lbnRlIGUgaXJyZXZvZ8OhdmVsIGRvcyBkaXJlaXRvcyBhdXRvcmFpcwpwYXRyaW1vbmlhaXMgbsOjbyBjb21lcmNpYWlzIGRlIHV0aWxpemHDp8OjbyBkZSBxdWUgdHJhdGEgZXN0ZSBkb2N1bWVudG8gaW5jbHVpLCBleGVtcGxpZmljYXRpdmFtZW50ZSwKb3MgZGlyZWl0b3MgZGUgZGlzcG9uaWJpbGl6YcOnw6NvIGUgY29tdW5pY2HDp8OjbyBww7pibGljYSBkYSBPQlJBLCBlbSBxdWFscXVlciBtZWlvIG91IHZlw61jdWxvLAppbmNsdXNpdmUgZW0gUmVwb3NpdMOzcmlvcyBEaWdpdGFpcywgYmVtIGNvbW8gb3MgZGlyZWl0b3MgZGUgcmVwcm9kdcOnw6NvLCBleGliacOnw6NvLCBleGVjdcOnw6NvLApkZWNsYW1hw6fDo28sIHJlY2l0YcOnw6NvLCBleHBvc2nDp8OjbywgYXJxdWl2YW1lbnRvLCBpbmNsdXPDo28gZW0gYmFuY28gZGUgZGFkb3MsIHByZXNlcnZhw6fDo28sIGRpZnVzw6NvLApkaXN0cmlidWnDp8OjbywgZGl2dWxnYcOnw6NvLCBlbXByw6lzdGltbywgdHJhZHXDp8OjbywgZHVibGFnZW0sIGxlZ2VuZGFnZW0sIGluY2x1c8OjbyBlbSBub3ZhcyBvYnJhcyBvdQpjb2xldMOibmVhcywgcmV1dGlsaXphw6fDo28sIGVkacOnw6NvLCBwcm9kdcOnw6NvIGRlIG1hdGVyaWFsIGRpZMOhdGljbyBlIGN1cnNvcyBvdSBxdWFscXVlciBmb3JtYSBkZQp1dGlsaXphw6fDo28gbsOjbyBjb21lcmNpYWw7CgooMykgUkVDT05IRUNFIHF1ZSBhIGNlc3PDo28gYXF1aSBlc3BlY2lmaWNhZGEgY29uY2VkZSDDoCBGSU9DUlVaIC0gRlVOREHDh8ODTyBPU1dBTERPCkNSVVogbyBkaXJlaXRvIGRlIGF1dG9yaXphciBxdWFscXVlciBwZXNzb2Eg4oCTIGbDrXNpY2Egb3UganVyw61kaWNhLCBww7pibGljYSBvdSBwcml2YWRhLCBuYWNpb25hbCBvdQplc3RyYW5nZWlyYSDigJMgYSBhY2Vzc2FyIGUgdXRpbGl6YXIgYW1wbGFtZW50ZSBhIE9CUkEsIHNlbSBleGNsdXNpdmlkYWRlLCBwYXJhIHF1YWlzcXVlcgpmaW5hbGlkYWRlcyBuw6NvIGNvbWVyY2lhaXM7CgooNCkgREVDTEFSQSBxdWUgYSBvYnJhIMOpIGNyaWHDp8OjbyBvcmlnaW5hbCBlIHF1ZSDDqSBvIHRpdHVsYXIgZG9zIGRpcmVpdG9zIGFxdWkgY2VkaWRvcyBlIGF1dG9yaXphZG9zLApyZXNwb25zYWJpbGl6YW5kby1zZSBpbnRlZ3JhbG1lbnRlIHBlbG8gY29udGXDumRvIGUgb3V0cm9zIGVsZW1lbnRvcyBxdWUgZmF6ZW0gcGFydGUgZGEgT0JSQSwKaW5jbHVzaXZlIG9zIGRpcmVpdG9zIGRlIHZveiBlIGltYWdlbSB2aW5jdWxhZG9zIMOgIE9CUkEsIG9icmlnYW5kby1zZSBhIGluZGVuaXphciB0ZXJjZWlyb3MgcG9yCmRhbm9zLCBiZW0gY29tbyBpbmRlbml6YXIgZSByZXNzYXJjaXIgYSBGSU9DUlVaIC0gRlVOREHDh8ODTyBPU1dBTERPIENSVVogZGUKZXZlbnR1YWlzIGRlc3Blc2FzIHF1ZSB2aWVyZW0gYSBzdXBvcnRhciwgZW0gcmF6w6NvIGRlIHF1YWxxdWVyIG9mZW5zYSBhIGRpcmVpdG9zIGF1dG9yYWlzIG91CmRpcmVpdG9zIGRlIHZveiBvdSBpbWFnZW0sIHByaW5jaXBhbG1lbnRlIG5vIHF1ZSBkaXogcmVzcGVpdG8gYSBwbMOhZ2lvIGUgdmlvbGHDp8O1ZXMgZGUgZGlyZWl0b3M7CgooNSkgQUZJUk1BIHF1ZSBjb25oZWNlIGEgUG9sw610aWNhIEluc3RpdHVjaW9uYWwgZGUgQWNlc3NvIEFiZXJ0byBkYSBGSU9DUlVaIC0gRlVOREHDh8ODTwpPU1dBTERPIENSVVogZSBhcyBkaXJldHJpemVzIHBhcmEgbyBmdW5jaW9uYW1lbnRvIGRvIHJlcG9zaXTDs3JpbyBpbnN0aXR1Y2lvbmFsIEFSQ0EuCgpBIFBvbMOtdGljYSBJbnN0aXR1Y2lvbmFsIGRlIEFjZXNzbyBBYmVydG8gZGEgRklPQ1JVWiAtIEZVTkRBw4fDg08gT1NXQUxETyBDUlVaIHJlc2VydmEKZXhjbHVzaXZhbWVudGUgYW8gQVVUT1Igb3MgZGlyZWl0b3MgbW9yYWlzIGUgb3MgdXNvcyBjb21lcmNpYWlzIHNvYnJlIGFzIG9icmFzIGRlIHN1YSBhdXRvcmlhCmUvb3UgdGl0dWxhcmlkYWRlLCBzZW5kbyBvcyB0ZXJjZWlyb3MgdXN1w6FyaW9zIHJlc3BvbnPDoXZlaXMgcGVsYSBhdHJpYnVpw6fDo28gZGUgYXV0b3JpYSBlIG1hbnV0ZW7Dp8OjbwpkYSBpbnRlZ3JpZGFkZSBkYSBPQlJBIGVtIHF1YWxxdWVyIHV0aWxpemHDp8Ojby4KCkEgUG9sw610aWNhIEluc3RpdHVjaW9uYWwgZGUgQWNlc3NvIEFiZXJ0byBkYSBGSU9DUlVaIC0gRlVOREHDh8ODTyBPU1dBTERPIENSVVoKcmVzcGVpdGEgb3MgY29udHJhdG9zIGUgYWNvcmRvcyBwcmVleGlzdGVudGVzIGRvcyBBdXRvcmVzIGNvbSB0ZXJjZWlyb3MsIGNhYmVuZG8gYW9zIEF1dG9yZXMKaW5mb3JtYXIgw6AgSW5zdGl0dWnDp8OjbyBhcyBjb25kacOnw7VlcyBlIG91dHJhcyByZXN0cmnDp8O1ZXMgaW1wb3N0YXMgcG9yIGVzdGVzIGluc3RydW1lbnRvcy4KRepositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352023-08-18T14:02:23Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false |
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