Genetic diversity and structure of Anacardium humile (Anacardiaceae) populations

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Souza, Josimar Morais de
Data de Publicação: 2023
Outros Autores: Telles, Mariana Pires de Campos, Pinto, Jefferson Fernando Naves, Reis, Edésio Fialho dos
Tipo de documento: Artigo
Idioma: eng
Título da fonte: Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)
Texto Completo: https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/27522
Resumo: The objective of this work was to describe and compare the patterns of genetic variation in 19 populations of Anacardium humile from the Cerrado biome of the Brazilian Midwestern region. The ex situ germplasm collection of Universidade Federal de Jataí, in the state of Goiás, Brazil, was used for the study. To quantify the genetic variability of A. humile, 529 plants from 17 populations in Goiás from 2 in the state of Mato Grosso were studied, from which nine microsatellite loci were genotyped by capillary electrophoresis. The populations showed high levels of genetic diversity, with an average value of 0.830, and high inbreeding values, which suggests a deficit of heterozygotes. The genetic differentiation value between populations was 0.065. The greatest variability, which is moderately structured, was observed within populations. There is a significant inbreeding within the A. humile population in the Cerrado biome of the Brazilian Midwestern region. The A. humile populations are divided into two groups.
id EMBRAPA-4_dfbe227c1edc8f4a4be33f4fd4be468b
oai_identifier_str oai:ojs.seer.sct.embrapa.br:article/27522
network_acronym_str EMBRAPA-4
network_name_str Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)
repository_id_str
spelling Genetic diversity and structure of Anacardium humile (Anacardiaceae) populationsDiversidade genética e estrutura de populações de Anacardium humile (Anacardiaceae)cajuzinho-do-cerrado; gene flow; Mantel’s test; microsatellite markerscajuzinho-do-cerrado; fluxo gênico; teste de Mantel; marcadores microssatélitesThe objective of this work was to describe and compare the patterns of genetic variation in 19 populations of Anacardium humile from the Cerrado biome of the Brazilian Midwestern region. The ex situ germplasm collection of Universidade Federal de Jataí, in the state of Goiás, Brazil, was used for the study. To quantify the genetic variability of A. humile, 529 plants from 17 populations in Goiás from 2 in the state of Mato Grosso were studied, from which nine microsatellite loci were genotyped by capillary electrophoresis. The populations showed high levels of genetic diversity, with an average value of 0.830, and high inbreeding values, which suggests a deficit of heterozygotes. The genetic differentiation value between populations was 0.065. The greatest variability, which is moderately structured, was observed within populations. There is a significant inbreeding within the A. humile population in the Cerrado biome of the Brazilian Midwestern region. The A. humile populations are divided into two groups.O objetivo deste trabalho foi descrever e comparar os padrões de variação genética em 19 populações de Anacardium humile do bioma Cerrado da região Centro-Oeste brasileira. A coleção ex situ de germoplasma da Universidade Federal de Jataí, no estado de Goiás, Brasil, foi utilizada para o estudo. Para quantificar a variabilidade genética de A. humile, 529 plantas oriundas de 17 populações de Goiás e de 2 do estado de Mato Grosso foram estudadas, das quais nove loci microssatélites foram genotipados por eletroforese capilar. As populações apresentaram altos níveis de diversidade genética, com valor médio de 0,830, e altos valores de endogamia, o que sugere um déficit de heterozigotos. O valor de diferenciação genética entre as populações foi de 0,065. Já a maior variabilidade, estruturada de forma moderada, foi observada dentro das populações. Há endogamia significativa na população de A. humile no bioma Cerrado da região Centro-Oeste brasileira. As populações de A. humile estão divididas em dois grupos.Pesquisa Agropecuaria BrasileiraPesquisa Agropecuária BrasileiraSouza, Josimar Morais deTelles, Mariana Pires de CamposPinto, Jefferson Fernando NavesReis, Edésio Fialho dos2023-12-14info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfhttps://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/27522Pesquisa Agropecuaria Brasileira; V.58, Jan./Dec., 2023: Publicação contínua em volume anual; e03186Pesquisa Agropecuária Brasileira; V.58, Jan./Dec., 2023: Publicação contínua em volume anual; e031861678-39210100-104xreponame:Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)instacron:EMBRAPAenghttps://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/27522/15256Direitos autorais 2023 Pesquisa Agropecuária Brasileirainfo:eu-repo/semantics/openAccess2023-12-14T19:04:58Zoai:ojs.seer.sct.embrapa.br:article/27522Revistahttp://seer.sct.embrapa.br/index.php/pabPRIhttps://old.scielo.br/oai/scielo-oai.phppab@sct.embrapa.br || sct.pab@embrapa.br1678-39210100-204Xopendoar:2023-12-14T19:04:58Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)false
dc.title.none.fl_str_mv Genetic diversity and structure of Anacardium humile (Anacardiaceae) populations
Diversidade genética e estrutura de populações de Anacardium humile (Anacardiaceae)
title Genetic diversity and structure of Anacardium humile (Anacardiaceae) populations
spellingShingle Genetic diversity and structure of Anacardium humile (Anacardiaceae) populations
Souza, Josimar Morais de
cajuzinho-do-cerrado; gene flow; Mantel’s test; microsatellite markers
cajuzinho-do-cerrado; fluxo gênico; teste de Mantel; marcadores microssatélites
title_short Genetic diversity and structure of Anacardium humile (Anacardiaceae) populations
title_full Genetic diversity and structure of Anacardium humile (Anacardiaceae) populations
title_fullStr Genetic diversity and structure of Anacardium humile (Anacardiaceae) populations
title_full_unstemmed Genetic diversity and structure of Anacardium humile (Anacardiaceae) populations
title_sort Genetic diversity and structure of Anacardium humile (Anacardiaceae) populations
author Souza, Josimar Morais de
author_facet Souza, Josimar Morais de
Telles, Mariana Pires de Campos
Pinto, Jefferson Fernando Naves
Reis, Edésio Fialho dos
author_role author
author2 Telles, Mariana Pires de Campos
Pinto, Jefferson Fernando Naves
Reis, Edésio Fialho dos
author2_role author
author
author
dc.contributor.none.fl_str_mv

dc.contributor.author.fl_str_mv Souza, Josimar Morais de
Telles, Mariana Pires de Campos
Pinto, Jefferson Fernando Naves
Reis, Edésio Fialho dos
dc.subject.por.fl_str_mv cajuzinho-do-cerrado; gene flow; Mantel’s test; microsatellite markers
cajuzinho-do-cerrado; fluxo gênico; teste de Mantel; marcadores microssatélites
topic cajuzinho-do-cerrado; gene flow; Mantel’s test; microsatellite markers
cajuzinho-do-cerrado; fluxo gênico; teste de Mantel; marcadores microssatélites
description The objective of this work was to describe and compare the patterns of genetic variation in 19 populations of Anacardium humile from the Cerrado biome of the Brazilian Midwestern region. The ex situ germplasm collection of Universidade Federal de Jataí, in the state of Goiás, Brazil, was used for the study. To quantify the genetic variability of A. humile, 529 plants from 17 populations in Goiás from 2 in the state of Mato Grosso were studied, from which nine microsatellite loci were genotyped by capillary electrophoresis. The populations showed high levels of genetic diversity, with an average value of 0.830, and high inbreeding values, which suggests a deficit of heterozygotes. The genetic differentiation value between populations was 0.065. The greatest variability, which is moderately structured, was observed within populations. There is a significant inbreeding within the A. humile population in the Cerrado biome of the Brazilian Midwestern region. The A. humile populations are divided into two groups.
publishDate 2023
dc.date.none.fl_str_mv 2023-12-14
dc.type.none.fl_str_mv
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/27522
url https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/27522
dc.language.iso.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.none.fl_str_mv https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/27522/15256
dc.rights.driver.fl_str_mv Direitos autorais 2023 Pesquisa Agropecuária Brasileira
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Direitos autorais 2023 Pesquisa Agropecuária Brasileira
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Pesquisa Agropecuaria Brasileira
Pesquisa Agropecuária Brasileira
publisher.none.fl_str_mv Pesquisa Agropecuaria Brasileira
Pesquisa Agropecuária Brasileira
dc.source.none.fl_str_mv Pesquisa Agropecuaria Brasileira; V.58, Jan./Dec., 2023: Publicação contínua em volume anual; e03186
Pesquisa Agropecuária Brasileira; V.58, Jan./Dec., 2023: Publicação contínua em volume anual; e03186
1678-3921
0100-104x
reponame:Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)
instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)
instacron:EMBRAPA
instname_str Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)
instacron_str EMBRAPA
institution EMBRAPA
reponame_str Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)
collection Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)
repository.name.fl_str_mv Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)
repository.mail.fl_str_mv pab@sct.embrapa.br || sct.pab@embrapa.br
_version_ 1793416699566882816