Mapping quantitative trait loci for performance traits on pig chromosome 6 (SSC6).

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: PIRES, A. V.
Data de Publicação: 2007
Outros Autores: LOPES, P. S., GUIMARAES, C. T., GUIMARAES, S. E. F.
Tipo de documento: Artigo
Idioma: eng
Título da fonte: Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice)
Texto Completo: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/490790
Resumo: The objective of this study was to perform QTL mapping associated with performance traits on swine chromosome 6 (SSC6). The F2 population was produced by outcrossing using two native Brazilian breed Piau sires and 18 commercial dams. A total of 617 F2 animals were genotyped for 13 microsatellite markers. The traits evaluated in the F2 population were teat number (TN), birth weight (BW), weight at 21, 42, 63, 77 and 105 days of age (W21, W42, W63, W77, W105), weight at slaughter (WS), and average daily gain (ADG), feed intake (FI) and feed/gain ratio (FG) from 77 to 105 days of age. Data were analyzed by multiple regression developed for analysis of crosses between outbred lines, using the QTL Express software. A significant QTL was detected for FI at 99 cM. A suggestive QTL was detected for W42 located at 55 cM. A locus located at 100 cM seems to affect the traits FI and ADG. Evidence for loci affecting weight at the other ages not was not found. O objetivo deste estudo foi obter o mapeamento de QTL no cromossomo 6 suíno (SSC6) associado a características de desempenho. A população F2 foi produzida utilizando o cruzamento divergente de dois reprodutores da raça nativa brasileira Piau e 18 fêmeas comerciais. Um total de 617 animais F2 foram genotipados para 13 marcadores microssatélites. As características avaliadas na população F2 foram: número de tetas (TN), peso ao nascimento (BW), peso aos 21, 42, 63, 77 e 105 dias de idade (W21, W42, W63, W77, W105), peso ao abate (WS), e ganho de peso médio diário (ADG), consumo de ração (FI) e conversão alimentar (FG) dos 77 aos 105 dias de idade. Os dados foram analisados usando a metodologia de regressão múltipla desenvolvida para análises de cruzamentos entre linhas divergentes, usando o software QTL Express. Um QTL significativo foi detectado para FI em 99 cM. Um QTL sugestivo foi detectado para W42 localizado em 55cM. As características FI e ADG parecem estar sob a influência de um loco situado em torno de 100 cM no cromossomo estudado. Não foram encontrados QTLs para peso em as outras diferentes idades.
id EMBR_359054e223c2986d04dbf7d58ab8ab46
oai_identifier_str oai:www.alice.cnptia.embrapa.br:doc/490790
network_acronym_str EMBR
network_name_str Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice)
repository_id_str 2154
spelling Mapping quantitative trait loci for performance traits on pig chromosome 6 (SSC6).Marcadores molecularesCruzamento divergenteQTLMelhoramento AnimalSus scrofaThe objective of this study was to perform QTL mapping associated with performance traits on swine chromosome 6 (SSC6). The F2 population was produced by outcrossing using two native Brazilian breed Piau sires and 18 commercial dams. A total of 617 F2 animals were genotyped for 13 microsatellite markers. The traits evaluated in the F2 population were teat number (TN), birth weight (BW), weight at 21, 42, 63, 77 and 105 days of age (W21, W42, W63, W77, W105), weight at slaughter (WS), and average daily gain (ADG), feed intake (FI) and feed/gain ratio (FG) from 77 to 105 days of age. Data were analyzed by multiple regression developed for analysis of crosses between outbred lines, using the QTL Express software. A significant QTL was detected for FI at 99 cM. A suggestive QTL was detected for W42 located at 55 cM. A locus located at 100 cM seems to affect the traits FI and ADG. Evidence for loci affecting weight at the other ages not was not found. O objetivo deste estudo foi obter o mapeamento de QTL no cromossomo 6 suíno (SSC6) associado a características de desempenho. A população F2 foi produzida utilizando o cruzamento divergente de dois reprodutores da raça nativa brasileira Piau e 18 fêmeas comerciais. Um total de 617 animais F2 foram genotipados para 13 marcadores microssatélites. As características avaliadas na população F2 foram: número de tetas (TN), peso ao nascimento (BW), peso aos 21, 42, 63, 77 e 105 dias de idade (W21, W42, W63, W77, W105), peso ao abate (WS), e ganho de peso médio diário (ADG), consumo de ração (FI) e conversão alimentar (FG) dos 77 aos 105 dias de idade. Os dados foram analisados usando a metodologia de regressão múltipla desenvolvida para análises de cruzamentos entre linhas divergentes, usando o software QTL Express. Um QTL significativo foi detectado para FI em 99 cM. Um QTL sugestivo foi detectado para W42 localizado em 55cM. As características FI e ADG parecem estar sob a influência de um loco situado em torno de 100 cM no cromossomo estudado. Não foram encontrados QTLs para peso em as outras diferentes idades.A. Vieira Pires, UFVJM; P. Sávio Lopes, UFV; CLAUDIA TEIXEIRA GUIMARAES, CNPMS; S. E. Facioni Guimarães, UFV.PIRES, A. V.LOPES, P. S.GUIMARAES, C. T.GUIMARAES, S. E. F.2017-06-08T00:02:14Z2017-06-08T00:02:14Z2007-10-1720072018-05-25T11:11:11Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleArchivos Latinoamericanos de Producción Animal, Maracaibo, v. 15, n. 1, p. 25-32, 2007.http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/490790enginfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice)instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)instacron:EMBRAPA2017-08-16T04:31:10Zoai:www.alice.cnptia.embrapa.br:doc/490790Repositório InstitucionalPUBhttps://www.alice.cnptia.embrapa.br/oai/requestopendoar:21542017-08-16T04:31:10falseRepositório InstitucionalPUBhttps://www.alice.cnptia.embrapa.br/oai/requestcg-riaa@embrapa.bropendoar:21542017-08-16T04:31:10Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)false
dc.title.none.fl_str_mv Mapping quantitative trait loci for performance traits on pig chromosome 6 (SSC6).
title Mapping quantitative trait loci for performance traits on pig chromosome 6 (SSC6).
spellingShingle Mapping quantitative trait loci for performance traits on pig chromosome 6 (SSC6).
PIRES, A. V.
Marcadores moleculares
Cruzamento divergente
QTL
Melhoramento Animal
Sus scrofa
title_short Mapping quantitative trait loci for performance traits on pig chromosome 6 (SSC6).
title_full Mapping quantitative trait loci for performance traits on pig chromosome 6 (SSC6).
title_fullStr Mapping quantitative trait loci for performance traits on pig chromosome 6 (SSC6).
title_full_unstemmed Mapping quantitative trait loci for performance traits on pig chromosome 6 (SSC6).
title_sort Mapping quantitative trait loci for performance traits on pig chromosome 6 (SSC6).
author PIRES, A. V.
author_facet PIRES, A. V.
LOPES, P. S.
GUIMARAES, C. T.
GUIMARAES, S. E. F.
author_role author
author2 LOPES, P. S.
GUIMARAES, C. T.
GUIMARAES, S. E. F.
author2_role author
author
author
dc.contributor.none.fl_str_mv A. Vieira Pires, UFVJM; P. Sávio Lopes, UFV; CLAUDIA TEIXEIRA GUIMARAES, CNPMS; S. E. Facioni Guimarães, UFV.
dc.contributor.author.fl_str_mv PIRES, A. V.
LOPES, P. S.
GUIMARAES, C. T.
GUIMARAES, S. E. F.
dc.subject.por.fl_str_mv Marcadores moleculares
Cruzamento divergente
QTL
Melhoramento Animal
Sus scrofa
topic Marcadores moleculares
Cruzamento divergente
QTL
Melhoramento Animal
Sus scrofa
description The objective of this study was to perform QTL mapping associated with performance traits on swine chromosome 6 (SSC6). The F2 population was produced by outcrossing using two native Brazilian breed Piau sires and 18 commercial dams. A total of 617 F2 animals were genotyped for 13 microsatellite markers. The traits evaluated in the F2 population were teat number (TN), birth weight (BW), weight at 21, 42, 63, 77 and 105 days of age (W21, W42, W63, W77, W105), weight at slaughter (WS), and average daily gain (ADG), feed intake (FI) and feed/gain ratio (FG) from 77 to 105 days of age. Data were analyzed by multiple regression developed for analysis of crosses between outbred lines, using the QTL Express software. A significant QTL was detected for FI at 99 cM. A suggestive QTL was detected for W42 located at 55 cM. A locus located at 100 cM seems to affect the traits FI and ADG. Evidence for loci affecting weight at the other ages not was not found. O objetivo deste estudo foi obter o mapeamento de QTL no cromossomo 6 suíno (SSC6) associado a características de desempenho. A população F2 foi produzida utilizando o cruzamento divergente de dois reprodutores da raça nativa brasileira Piau e 18 fêmeas comerciais. Um total de 617 animais F2 foram genotipados para 13 marcadores microssatélites. As características avaliadas na população F2 foram: número de tetas (TN), peso ao nascimento (BW), peso aos 21, 42, 63, 77 e 105 dias de idade (W21, W42, W63, W77, W105), peso ao abate (WS), e ganho de peso médio diário (ADG), consumo de ração (FI) e conversão alimentar (FG) dos 77 aos 105 dias de idade. Os dados foram analisados usando a metodologia de regressão múltipla desenvolvida para análises de cruzamentos entre linhas divergentes, usando o software QTL Express. Um QTL significativo foi detectado para FI em 99 cM. Um QTL sugestivo foi detectado para W42 localizado em 55cM. As características FI e ADG parecem estar sob a influência de um loco situado em torno de 100 cM no cromossomo estudado. Não foram encontrados QTLs para peso em as outras diferentes idades.
publishDate 2007
dc.date.none.fl_str_mv 2007-10-17
2007
2017-06-08T00:02:14Z
2017-06-08T00:02:14Z
2018-05-25T11:11:11Z
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
info:eu-repo/semantics/article
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv Archivos Latinoamericanos de Producción Animal, Maracaibo, v. 15, n. 1, p. 25-32, 2007.
http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/490790
identifier_str_mv Archivos Latinoamericanos de Producción Animal, Maracaibo, v. 15, n. 1, p. 25-32, 2007.
url http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/490790
dc.language.iso.fl_str_mv eng
language eng
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice)
instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)
instacron:EMBRAPA
instname_str Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)
instacron_str EMBRAPA
institution EMBRAPA
reponame_str Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice)
collection Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice)
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)
repository.mail.fl_str_mv cg-riaa@embrapa.br
_version_ 1794503437597016064