Estratégias genético-moleculares visando à detecção do patógeno e à identificação de análogos de genes de resistência associados com a mancha branca de milho.
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2012 |
Tipo de documento: | Tese |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) |
Texto Completo: | http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/950303 |
Resumo: | O milho é um dos cereais de maior importância econômica no mundo, sendo amplamente utilizado na alimentação humana e animal e, recentemente, na produção de biocombustível. Apesar do Brasil ocupar a terceira posição no cenário mundial de produção de milho, essa cultura está sujeita à ocorrência de várias doenças, como a mancha branca que tem causado perdas significativas na produção e na qualidade dos grãos. Apesar da importância dessa doença, existe uma carência de informações sobre o patógeno, que tem sido reportado como a bactéria Pantoea ananatis, e sobre regiões genômicas associadas com a resistência à mancha branca em milho. Assim, os principais objetivos do presente trabalho foram: (i) desenvolver um teste diagnóstico para identificação do patógeno; (ii) avaliar a diversidade genética da bactéria P. ananatis; (iii) mapear QTLs de resistência à mancha branca me milho tropical e (iv) identificar análogos de genes de resistência (RGAs) co-localizados com QTLs de resistência à doença. Uma metodologia rápida, de baixo custo e seletiva baseada em PCR foi implementada para detecção de P. ananatis. Foi verificada uma elevada variabilidade genética entre 18 isolados do gênero Pantoea presentes nas folhas de milho, sorgo e capim-colchão com sintomas da doença que deve ser considerada em programas de melhoramento genético de milho visando à geração de cultivares resistentes. Entretanto, isolados de P. ananatis de milho, sorgo e capim-colchão foram reunidos em um mesmo grupo, reforçando a existência de possíveis hospedeiros alternativos do patógeno. Adicionalmente, foram mapeados em milho oito QTLs nos cromossomos 1,2,3,4 e 8, explicando, aproximadamente, 90% da variância genotípica da resistência à mancha branca em dois ambientes, Sete Lagoas e Uberlândia. Uma busca por meio de ferramentas de bioinformática utilizando 93 genes de resistência de plantas permitiu a identificação de 939 RGAs no genoma do milho, dos quais 123 foram co-localizados in silico com os QTLs de resistência à mancha branca. Dentre estes, os genes candidatos Pto20, Pto99 e Xa26.151.4 foram geneticamente co-localizados com QTLs nos cromossomos 4 e 8, apresentando um padrão super-expressão na linhagem resistente. Assim, os resultados gerados neste trabalho terão uma contribuição fundamental para o delineamento de estratégias de controle epidemiológico e genético da mancha branca em milho. |
id |
EMBR_479e06ae4eb54e82aadfa893adb71b87 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:www.alice.cnptia.embrapa.br:doc/950303 |
network_acronym_str |
EMBR |
network_name_str |
Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) |
repository_id_str |
2154 |
spelling |
Estratégias genético-moleculares visando à detecção do patógeno e à identificação de análogos de genes de resistência associados com a mancha branca de milho.Diversidade genéticaZea maysDoença de plantaMancha brancaGenéticaPantoea ananatisO milho é um dos cereais de maior importância econômica no mundo, sendo amplamente utilizado na alimentação humana e animal e, recentemente, na produção de biocombustível. Apesar do Brasil ocupar a terceira posição no cenário mundial de produção de milho, essa cultura está sujeita à ocorrência de várias doenças, como a mancha branca que tem causado perdas significativas na produção e na qualidade dos grãos. Apesar da importância dessa doença, existe uma carência de informações sobre o patógeno, que tem sido reportado como a bactéria Pantoea ananatis, e sobre regiões genômicas associadas com a resistência à mancha branca em milho. Assim, os principais objetivos do presente trabalho foram: (i) desenvolver um teste diagnóstico para identificação do patógeno; (ii) avaliar a diversidade genética da bactéria P. ananatis; (iii) mapear QTLs de resistência à mancha branca me milho tropical e (iv) identificar análogos de genes de resistência (RGAs) co-localizados com QTLs de resistência à doença. Uma metodologia rápida, de baixo custo e seletiva baseada em PCR foi implementada para detecção de P. ananatis. Foi verificada uma elevada variabilidade genética entre 18 isolados do gênero Pantoea presentes nas folhas de milho, sorgo e capim-colchão com sintomas da doença que deve ser considerada em programas de melhoramento genético de milho visando à geração de cultivares resistentes. Entretanto, isolados de P. ananatis de milho, sorgo e capim-colchão foram reunidos em um mesmo grupo, reforçando a existência de possíveis hospedeiros alternativos do patógeno. Adicionalmente, foram mapeados em milho oito QTLs nos cromossomos 1,2,3,4 e 8, explicando, aproximadamente, 90% da variância genotípica da resistência à mancha branca em dois ambientes, Sete Lagoas e Uberlândia. Uma busca por meio de ferramentas de bioinformática utilizando 93 genes de resistência de plantas permitiu a identificação de 939 RGAs no genoma do milho, dos quais 123 foram co-localizados in silico com os QTLs de resistência à mancha branca. Dentre estes, os genes candidatos Pto20, Pto99 e Xa26.151.4 foram geneticamente co-localizados com QTLs nos cromossomos 4 e 8, apresentando um padrão super-expressão na linhagem resistente. Assim, os resultados gerados neste trabalho terão uma contribuição fundamental para o delineamento de estratégias de controle epidemiológico e genético da mancha branca em milho.Tese (Doutorado em Genética) - Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte. Orientadora: Cláudia Teixeira Guimarães. Co-orientador: Jurandir Vieira de Magalhães.UBIRACI GOMES DE PAULA LANA.LANA, U. G. de P.2019-03-14T00:29:10Z2019-03-14T00:29:10Z2013-02-2120122019-03-14T00:29:10Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis104 f.2012http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/950303porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice)instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)instacron:EMBRAPA2019-03-14T00:29:16Zoai:www.alice.cnptia.embrapa.br:doc/950303Repositório InstitucionalPUBhttps://www.alice.cnptia.embrapa.br/oai/requestopendoar:21542019-03-14T00:29:16falseRepositório InstitucionalPUBhttps://www.alice.cnptia.embrapa.br/oai/requestcg-riaa@embrapa.bropendoar:21542019-03-14T00:29:16Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)false |
dc.title.none.fl_str_mv |
Estratégias genético-moleculares visando à detecção do patógeno e à identificação de análogos de genes de resistência associados com a mancha branca de milho. |
title |
Estratégias genético-moleculares visando à detecção do patógeno e à identificação de análogos de genes de resistência associados com a mancha branca de milho. |
spellingShingle |
Estratégias genético-moleculares visando à detecção do patógeno e à identificação de análogos de genes de resistência associados com a mancha branca de milho. LANA, U. G. de P. Diversidade genética Zea mays Doença de planta Mancha branca Genética Pantoea ananatis |
title_short |
Estratégias genético-moleculares visando à detecção do patógeno e à identificação de análogos de genes de resistência associados com a mancha branca de milho. |
title_full |
Estratégias genético-moleculares visando à detecção do patógeno e à identificação de análogos de genes de resistência associados com a mancha branca de milho. |
title_fullStr |
Estratégias genético-moleculares visando à detecção do patógeno e à identificação de análogos de genes de resistência associados com a mancha branca de milho. |
title_full_unstemmed |
Estratégias genético-moleculares visando à detecção do patógeno e à identificação de análogos de genes de resistência associados com a mancha branca de milho. |
title_sort |
Estratégias genético-moleculares visando à detecção do patógeno e à identificação de análogos de genes de resistência associados com a mancha branca de milho. |
author |
LANA, U. G. de P. |
author_facet |
LANA, U. G. de P. |
author_role |
author |
dc.contributor.none.fl_str_mv |
UBIRACI GOMES DE PAULA LANA. |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
LANA, U. G. de P. |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Diversidade genética Zea mays Doença de planta Mancha branca Genética Pantoea ananatis |
topic |
Diversidade genética Zea mays Doença de planta Mancha branca Genética Pantoea ananatis |
description |
O milho é um dos cereais de maior importância econômica no mundo, sendo amplamente utilizado na alimentação humana e animal e, recentemente, na produção de biocombustível. Apesar do Brasil ocupar a terceira posição no cenário mundial de produção de milho, essa cultura está sujeita à ocorrência de várias doenças, como a mancha branca que tem causado perdas significativas na produção e na qualidade dos grãos. Apesar da importância dessa doença, existe uma carência de informações sobre o patógeno, que tem sido reportado como a bactéria Pantoea ananatis, e sobre regiões genômicas associadas com a resistência à mancha branca em milho. Assim, os principais objetivos do presente trabalho foram: (i) desenvolver um teste diagnóstico para identificação do patógeno; (ii) avaliar a diversidade genética da bactéria P. ananatis; (iii) mapear QTLs de resistência à mancha branca me milho tropical e (iv) identificar análogos de genes de resistência (RGAs) co-localizados com QTLs de resistência à doença. Uma metodologia rápida, de baixo custo e seletiva baseada em PCR foi implementada para detecção de P. ananatis. Foi verificada uma elevada variabilidade genética entre 18 isolados do gênero Pantoea presentes nas folhas de milho, sorgo e capim-colchão com sintomas da doença que deve ser considerada em programas de melhoramento genético de milho visando à geração de cultivares resistentes. Entretanto, isolados de P. ananatis de milho, sorgo e capim-colchão foram reunidos em um mesmo grupo, reforçando a existência de possíveis hospedeiros alternativos do patógeno. Adicionalmente, foram mapeados em milho oito QTLs nos cromossomos 1,2,3,4 e 8, explicando, aproximadamente, 90% da variância genotípica da resistência à mancha branca em dois ambientes, Sete Lagoas e Uberlândia. Uma busca por meio de ferramentas de bioinformática utilizando 93 genes de resistência de plantas permitiu a identificação de 939 RGAs no genoma do milho, dos quais 123 foram co-localizados in silico com os QTLs de resistência à mancha branca. Dentre estes, os genes candidatos Pto20, Pto99 e Xa26.151.4 foram geneticamente co-localizados com QTLs nos cromossomos 4 e 8, apresentando um padrão super-expressão na linhagem resistente. Assim, os resultados gerados neste trabalho terão uma contribuição fundamental para o delineamento de estratégias de controle epidemiológico e genético da mancha branca em milho. |
publishDate |
2012 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2012 2013-02-21 2019-03-14T00:29:10Z 2019-03-14T00:29:10Z 2019-03-14T00:29:10Z |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
format |
doctoralThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
2012 http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/950303 |
identifier_str_mv |
2012 |
url |
http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/950303 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
104 f. |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) instacron:EMBRAPA |
instname_str |
Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) |
instacron_str |
EMBRAPA |
institution |
EMBRAPA |
reponame_str |
Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) |
collection |
Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) |
repository.mail.fl_str_mv |
cg-riaa@embrapa.br |
_version_ |
1794503473010573312 |