Isolation of microsatellite loci in the Amazon sailfin catfish Pterygoplichlhys pardalis (Castelneau, 1855) (Teleostei: Loricariidae).

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: PEREIRA, R. P.
Data de Publicação: 2012
Outros Autores: SANTOS, C. H. dos A. dos, NASCIMENTO, P. R. M., CLÍMACO, G. T., SOUSA, A. C. B., CAMPOS, T. de, VERGUEIRO-JÚNIOR, A. M. K., PAULA-SILVA, M. N., ALMEIDA-VAL, V. M. F.
Tipo de documento: Artigo
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice)
Texto Completo: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/941411
Resumo: Pterygoplichlhys pardalis is an important freshwater ornamental fish in the Amazon Basin. Studies involving populations of P. pardalis are of great importance for the conservation and management of this species. We developed nine microsatellite loci and applied them to investigate the genetic variation of 20 wild individuals from floodplain lakes of the Solimões river. The number of alleles per locus ranged from 2 to 12, with an average of 6.6. The observed and expected heterozygosity values ranged from 0.400 to 0.923 (average 0.706) and from 0.358 to 0.895 (average 0.692), respectively. The value of f ranged from -0.532 to 0.467 (average 0.032). One locus (Pp07) significantly deviated from Hardy-Weinberg equilibrium after Bonferroni correction (P: (5 %)\0.006). No significant linkage disequilibrium was detected. These microsatellite loci will contribute towards studies of genetic diversity and conservation of P. pardalis.
id EMBR_d35554c30228d23fab7e2d321d73c6a9
oai_identifier_str oai:www.alice.cnptia.embrapa.br:doc/941411
network_acronym_str EMBR
network_name_str Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice)
repository_id_str 2154
spelling Isolation of microsatellite loci in the Amazon sailfin catfish Pterygoplichlhys pardalis (Castelneau, 1855) (Teleostei: Loricariidae).Peixe gato da índiaPterygoplichlhys pardalisMarcador microssatéliteBacia AmazônicaMelhorameno genético animalVariación genéticaPeces ornamentalesRepeticiones de microsatéliteVariação genéticaMarcador genéticoGenética AnimalPeixe OrnamentalAnimal geneticsOrnamental fishMicrosatellite repeatsGenetic variationPterygoplichlhys pardalis is an important freshwater ornamental fish in the Amazon Basin. Studies involving populations of P. pardalis are of great importance for the conservation and management of this species. We developed nine microsatellite loci and applied them to investigate the genetic variation of 20 wild individuals from floodplain lakes of the Solimões river. The number of alleles per locus ranged from 2 to 12, with an average of 6.6. The observed and expected heterozygosity values ranged from 0.400 to 0.923 (average 0.706) and from 0.358 to 0.895 (average 0.692), respectively. The value of f ranged from -0.532 to 0.467 (average 0.032). One locus (Pp07) significantly deviated from Hardy-Weinberg equilibrium after Bonferroni correction (P: (5 %)\0.006). No significant linkage disequilibrium was detected. These microsatellite loci will contribute towards studies of genetic diversity and conservation of P. pardalis.ROSALINA P. PEREIRA, INPA; CARLOS HENRIQUE DOS A. DOS SANTOS, INPA; PRISCILA ROBERTA M. DO NASCIMENTO, INPA; GISELE T. CLÍMACO, INPA; ADNA CRISTINA B. SOUSA, Universidade do Estado da Bahia; TATIANA DE CAMPOS, CPAF-AC; ALEXANDRE MANOEL K. VERGUEIRO-JÚNIOR, INPA; MARIA N. PAULA-SILVA, INPA; VERA MARIA F. ALMEIDA-VAL, INPA.PEREIRA, R. P.SANTOS, C. H. dos A. dosNASCIMENTO, P. R. M.CLÍMACO, G. T.SOUSA, A. C. B.CAMPOS, T. deVERGUEIRO-JÚNIOR, A. M. K.PAULA-SILVA, M. N.ALMEIDA-VAL, V. M. F.2012-12-05T11:11:11Z2012-12-05T11:11:11Z2012-12-0520122019-01-10T11:11:11Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleConservation Genetics Resources, United Kingdom, v. 4, n. 4, p. 889-891, Dec. 2012.http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/94141110.1007/s12686-012-9666-xporinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice)instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)instacron:EMBRAPA2017-08-16T04:24:45Zoai:www.alice.cnptia.embrapa.br:doc/941411Repositório InstitucionalPUBhttps://www.alice.cnptia.embrapa.br/oai/requestopendoar:21542017-08-16T04:24:45falseRepositório InstitucionalPUBhttps://www.alice.cnptia.embrapa.br/oai/requestcg-riaa@embrapa.bropendoar:21542017-08-16T04:24:45Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)false
dc.title.none.fl_str_mv Isolation of microsatellite loci in the Amazon sailfin catfish Pterygoplichlhys pardalis (Castelneau, 1855) (Teleostei: Loricariidae).
title Isolation of microsatellite loci in the Amazon sailfin catfish Pterygoplichlhys pardalis (Castelneau, 1855) (Teleostei: Loricariidae).
spellingShingle Isolation of microsatellite loci in the Amazon sailfin catfish Pterygoplichlhys pardalis (Castelneau, 1855) (Teleostei: Loricariidae).
PEREIRA, R. P.
Peixe gato da índia
Pterygoplichlhys pardalis
Marcador microssatélite
Bacia Amazônica
Melhorameno genético animal
Variación genética
Peces ornamentales
Repeticiones de microsatélite
Variação genética
Marcador genético
Genética Animal
Peixe Ornamental
Animal genetics
Ornamental fish
Microsatellite repeats
Genetic variation
title_short Isolation of microsatellite loci in the Amazon sailfin catfish Pterygoplichlhys pardalis (Castelneau, 1855) (Teleostei: Loricariidae).
title_full Isolation of microsatellite loci in the Amazon sailfin catfish Pterygoplichlhys pardalis (Castelneau, 1855) (Teleostei: Loricariidae).
title_fullStr Isolation of microsatellite loci in the Amazon sailfin catfish Pterygoplichlhys pardalis (Castelneau, 1855) (Teleostei: Loricariidae).
title_full_unstemmed Isolation of microsatellite loci in the Amazon sailfin catfish Pterygoplichlhys pardalis (Castelneau, 1855) (Teleostei: Loricariidae).
title_sort Isolation of microsatellite loci in the Amazon sailfin catfish Pterygoplichlhys pardalis (Castelneau, 1855) (Teleostei: Loricariidae).
author PEREIRA, R. P.
author_facet PEREIRA, R. P.
SANTOS, C. H. dos A. dos
NASCIMENTO, P. R. M.
CLÍMACO, G. T.
SOUSA, A. C. B.
CAMPOS, T. de
VERGUEIRO-JÚNIOR, A. M. K.
PAULA-SILVA, M. N.
ALMEIDA-VAL, V. M. F.
author_role author
author2 SANTOS, C. H. dos A. dos
NASCIMENTO, P. R. M.
CLÍMACO, G. T.
SOUSA, A. C. B.
CAMPOS, T. de
VERGUEIRO-JÚNIOR, A. M. K.
PAULA-SILVA, M. N.
ALMEIDA-VAL, V. M. F.
author2_role author
author
author
author
author
author
author
author
dc.contributor.none.fl_str_mv ROSALINA P. PEREIRA, INPA; CARLOS HENRIQUE DOS A. DOS SANTOS, INPA; PRISCILA ROBERTA M. DO NASCIMENTO, INPA; GISELE T. CLÍMACO, INPA; ADNA CRISTINA B. SOUSA, Universidade do Estado da Bahia; TATIANA DE CAMPOS, CPAF-AC; ALEXANDRE MANOEL K. VERGUEIRO-JÚNIOR, INPA; MARIA N. PAULA-SILVA, INPA; VERA MARIA F. ALMEIDA-VAL, INPA.
dc.contributor.author.fl_str_mv PEREIRA, R. P.
SANTOS, C. H. dos A. dos
NASCIMENTO, P. R. M.
CLÍMACO, G. T.
SOUSA, A. C. B.
CAMPOS, T. de
VERGUEIRO-JÚNIOR, A. M. K.
PAULA-SILVA, M. N.
ALMEIDA-VAL, V. M. F.
dc.subject.por.fl_str_mv Peixe gato da índia
Pterygoplichlhys pardalis
Marcador microssatélite
Bacia Amazônica
Melhorameno genético animal
Variación genética
Peces ornamentales
Repeticiones de microsatélite
Variação genética
Marcador genético
Genética Animal
Peixe Ornamental
Animal genetics
Ornamental fish
Microsatellite repeats
Genetic variation
topic Peixe gato da índia
Pterygoplichlhys pardalis
Marcador microssatélite
Bacia Amazônica
Melhorameno genético animal
Variación genética
Peces ornamentales
Repeticiones de microsatélite
Variação genética
Marcador genético
Genética Animal
Peixe Ornamental
Animal genetics
Ornamental fish
Microsatellite repeats
Genetic variation
description Pterygoplichlhys pardalis is an important freshwater ornamental fish in the Amazon Basin. Studies involving populations of P. pardalis are of great importance for the conservation and management of this species. We developed nine microsatellite loci and applied them to investigate the genetic variation of 20 wild individuals from floodplain lakes of the Solimões river. The number of alleles per locus ranged from 2 to 12, with an average of 6.6. The observed and expected heterozygosity values ranged from 0.400 to 0.923 (average 0.706) and from 0.358 to 0.895 (average 0.692), respectively. The value of f ranged from -0.532 to 0.467 (average 0.032). One locus (Pp07) significantly deviated from Hardy-Weinberg equilibrium after Bonferroni correction (P: (5 %)\0.006). No significant linkage disequilibrium was detected. These microsatellite loci will contribute towards studies of genetic diversity and conservation of P. pardalis.
publishDate 2012
dc.date.none.fl_str_mv 2012-12-05T11:11:11Z
2012-12-05T11:11:11Z
2012-12-05
2012
2019-01-10T11:11:11Z
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
info:eu-repo/semantics/article
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv Conservation Genetics Resources, United Kingdom, v. 4, n. 4, p. 889-891, Dec. 2012.
http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/941411
10.1007/s12686-012-9666-x
identifier_str_mv Conservation Genetics Resources, United Kingdom, v. 4, n. 4, p. 889-891, Dec. 2012.
10.1007/s12686-012-9666-x
url http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/941411
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice)
instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)
instacron:EMBRAPA
instname_str Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)
instacron_str EMBRAPA
institution EMBRAPA
reponame_str Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice)
collection Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice)
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)
repository.mail.fl_str_mv cg-riaa@embrapa.br
_version_ 1794503400344256512