The PDTIS bioinformatics platform: from sequence to function

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Otto, Thomas Dan
Data de Publicação: 2007
Outros Autores: Catanho, Marcos Paulo, Degrave, Wim Maurits Sylvain, de Miranda, Antonio Basílio
Tipo de documento: Artigo
Idioma: por
eng
Título da fonte: RECIIS (Online)
Texto Completo: https://www.reciis.icict.fiocruz.br/index.php/reciis/article/view/920
Resumo: Since the eighties, Bioinformatics has acquired a growing importance in the biological sciences. Due to the complexity of hardware and software tools, and the need for a specialized management of network infrastructure, data processing and storage, many research institutions organized a bioinformatics core facility. In this work, we describe typical bioinformatics activities and the organization of a bioinformatics core with institutional support. Since the end of the 80s, FIOCRUZ has contributed for the development and establishment of Bioinformatics in Rio de Janeiro, through different initiatives. Starting with sequence analysis courses, today our institution has a permanent Bioinformatics service, integrated with other strategic activities through a thematic network of technological platforms imbedded in the Program for Technological Development of Health Products (PDTIS), where the main attributions of such platforms are concentrated in support, establishment of new methodologies and active participation in research projects and technological development. In this paper we present the PDTIS Bioinformatics Platform, its scope, resources and its support, teaching and research activities. Bioinformatics has emerged as a new scientific area and a short history of its development at FIOCRUZ is also summarized.
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spelling The PDTIS bioinformatics platform: from sequence to functionA plataforma PDTIS de bioinformática: da seqüência à funçãoBioinformaticscomputational biologydatabasesgenomesequence analysisBioinformáticabiologia computacionalbanco de dadosgenomaanálise de seqüênciasSince the eighties, Bioinformatics has acquired a growing importance in the biological sciences. Due to the complexity of hardware and software tools, and the need for a specialized management of network infrastructure, data processing and storage, many research institutions organized a bioinformatics core facility. In this work, we describe typical bioinformatics activities and the organization of a bioinformatics core with institutional support. Since the end of the 80s, FIOCRUZ has contributed for the development and establishment of Bioinformatics in Rio de Janeiro, through different initiatives. Starting with sequence analysis courses, today our institution has a permanent Bioinformatics service, integrated with other strategic activities through a thematic network of technological platforms imbedded in the Program for Technological Development of Health Products (PDTIS), where the main attributions of such platforms are concentrated in support, establishment of new methodologies and active participation in research projects and technological development. In this paper we present the PDTIS Bioinformatics Platform, its scope, resources and its support, teaching and research activities. Bioinformatics has emerged as a new scientific area and a short history of its development at FIOCRUZ is also summarized.Desde os anos 1980, a Bioinformática tem adquirido uma importância crescente nas ciências biológicas. Devido à complexidade de ferramentas tanto de hardware quanto de software, e a necessidade de ter-se um gerenciamento especializado de infra-estruturas de rede, processamento e armazenamento de dados, muitas instituições de pesquisa organizaram um núcleo de bioinformática (core facility, CPD, Centro de (Bio)informática etc.). Neste artigo, descrevemos uma evolução típica de atividades na área de bioinformática e a organização de um núcleo mínimo com suporte institucional. Desde o final da década de 1980, a Fiocruz tem contribuído para o estabelecimento e desenvolvimento da Bioinformática no Rio de Janeiro, através de diferentes iniciativas. Iniciando com cursos de análise de seqüências ministrados na Fiocruz, hoje a instituição conta com um serviço permanente de Bioinformática, integrado a outras atividades estratégicas desenvolvidas, através de uma rede temática de plataformas com suporte de um Programa de Desenvolvimento Tecnológico em Insumos para a Saúde (PDTIS), cujas principais atribuições concentram-se no suporte, no estabelecimento de novas metodologias e na participação ativa em projetos de desenvolvimento tecnológico. Neste artigo, descrevemos a Plataforma PDTIS de Bioinformática, o seu escopo, os seus recursos e as suas atividades de suporte, ensino e pesquisa, considerando que muitos outros centros de pesquisa encontram-se em situação similar O surgimento da Bioinformática como uma nova área do conhecimento e um histórico de seu desenvolvimento na Fiocruz também são apresentados, de forma resumida.Instituto de Comunicação e Informação Científica e Tecnológica em Saúde (Icict/Fiocruz)2007-12-31info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionAvaliado pelos paresapplication/pdfapplication/pdfhttps://www.reciis.icict.fiocruz.br/index.php/reciis/article/view/92010.3395/reciis.v1i2.920Revista Eletrônica de Comunicação, Informação & Inovação em Saúde; Vol. 1 No. 2 (2007): Suplemento - Bioinformática e SaúdeRevista Eletrônica de Comunicação, Informação e Inovação em Saúde; Vol. 1 Núm. 2 (2007): Suplemento - Bioinformática e SaúdeRevue de la Communication, de l'Information et de l'Innovation en santé; Vol. 1 No 2 (2007): Suplemento - Bioinformática e SaúdeRevista Eletrônica de Comunicação, Informação & Inovação em Saúde; v. 1 n. 2 (2007): Suplemento - Bioinformática e Saúde1981-6278reponame:RECIIS (Online)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZporenghttps://www.reciis.icict.fiocruz.br/index.php/reciis/article/view/920/1565https://www.reciis.icict.fiocruz.br/index.php/reciis/article/view/920/1621Copyright (c) 2018 Revista Eletrônica de Comunicação, Informação & Inovação em Saúdeinfo:eu-repo/semantics/openAccessOtto, Thomas DanCatanho, Marcos PauloDegrave, Wim Maurits Sylvainde Miranda, Antonio Basílio2022-08-11T14:24:57Zoai:www.reciis.icict.fiocruz.br:article/920Revistahttps://www.reciis.icict.fiocruz.br/index.php/reciishttps://www.reciis.icict.fiocruz.br/index.php/reciis/oaireciis@icict.fiocruz.br1981-62781981-6278opendoar:2022-08-11T14:24:57RECIIS (Online) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false
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