Genotypic analysis of Helicobacter pylori by Multiple-Locus Variable-Number Tandem-Repeats method in southern Brazil

• Autor(a) principal: Halicki, Priscila Cristina Bartolomeu
• Data de Publicação: 2016
• Outros Autores: Ramis, Ivy Bastos, Vianna, Júlia Silveira, Gautério, Thaísa Bozzetti, Groll, Andrea Von, Silva, Pedro Eduardo Almeida da
• Tipo de documento: Artigo
• Idioma: eng
• Título da fonte: Repositório Institucional da FURG (RI FURG)
• Texto Completo: http://repositorio.furg.br/handle/1/7107; http://dx.doi.org/10.17058/reci.v6i4.8043
• topic: Diversidade genética; Helicobacter pylori; Variable number of Tandem Repeats; Genetic diversity

Justificativa e Objetivos: Apesar de ser utilizado como um método de genotipagem para diferentes microrganismos, poucos estudos relatam a utilização de Multiple-Locus Variable Number of Tandem Repeats Analysis (MLVA) para análise da diversidade clonal do Helicobacter pylori. O objetivo deste estudo foi determinar a variabilidade genética de cepas de H. pylori pelo MLVA no sul do Brasil. Métodos: 95 amostras de DNA de H. pylori foram obtidas a partir de biópsias gástricas de pacientes H. pylori-positivos provenientes de duas cidades do sul do Brasil e a diversidade genética das cepas foi avaliada pelo método MLVA utilizando eletroforese em gel de agarose. Para a seleção dos loci a serem analisados neste estudo, foi realizada uma análise in silico de 12 loci previamente descritos na literatura. Resultados: A partir da análise in silico, apenas quatro loci foram considerados viáveis para a análise genotípica das cepas, resultando em 90 cepas distribuídas em oito grupos diferentes e cinco cepas órfãs. Conclusões: Apesar de o método MLVA permitir fazer inferências acerca da diversidade genética de uma população, nossos resultados mostraram que os métodos de genotipagem do H. pylori devem ser criticamente avaliados antes de serem utilizados nessa região do Brasil.