Prospecção de moléculas com potenciais inibidores da serino protease do vírus da hepatite

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Silva, Alessandra Pereira da
Data de Publicação: 2021
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Digital do Instituto Evandro Chagas (Patuá)
Texto Completo: https://patua.iec.gov.br/handle/iec/6693
Resumo: A hepatite viral é uma grande preocupação de saúde pública, apresentando mais de 400 mil infectados no Brasil entre 2009 e 2018. Com o início da nova era de tratamento da hepatite C houve um aumento da taxa de resposta virológica sustentável ao longo dos anos. Porém, o HCV possui alta taxa de mutação e pode se tornar resistente aos fármacos já existentes. Por isso, é importante desenvolver novas alternativas para o tratamento dessa enfermidade. Para atingir este objetivo, primeiramente confirmamos o HCV como tipo de maior circulação no Brasil e selecionamos a proteína NS3 dos genótipos 1b, 2a, e 3a como alvo para descoberta de potenciais inibidores. Foi realizado um ensaio virtual com modelo cristalográfico construído pelo Modeller com um banco de moléculas naturais provenientes do ZINC12 usando o programa Autodock Vina que se baseia no algoritmo genético Lamarckiano. Observe-se que o resultado do modelo gerado pelo Modeller do domínio catalítico apresentou para os genótipos 1b, 2a e 3a respectivamente 94,5%, 94,9% e 94,9% dos resíduos previstos dentro da região favorável. Os valores de RMSD obtido para os modelos dos genótipos 1b, 2a e 3a do domínio catalítico foram de 0,259Å, 0,259Å e 0,295Å. Dos 1.239 compostos testados virtualmente, 10 foram selecionados para investigação. O composto ZINC 08382390 estabelece várias interações de van der Waals e ligações de hidrogênio com o sítio de ligação da serina protease apresentando uma energia de -8,1 Kcal.mol-1. O composto ZINC 04104651 comparado aos demais possui baixa afinidade pelo receptor proteico da hidrolase. Ao contrário do composto ZINC 85340695 que possui um menor valor de energia de afinidade (-8,3 Kcal.mol-1), logo tem mais interação com o alvo e mais estável termodinamicamente. Relacionando os resultados in silico ADME e docagem molecular, notou-se que o composto ZINC 04556808 apresentou perfil ideal para disponibilidade e interação com o alvo proteico que sugere um grande potencial terapêutico estimulando a realização dos ensaios para comprovação das atividades biológicas. Desta forma, o trabalho contribui com a identificação de potenciais novos fármacos que auxiliam na terapia contra a hepatite C.
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Para atingir este objetivo, primeiramente confirmamos o HCV como tipo de maior circulação no Brasil e selecionamos a proteína NS3 dos genótipos 1b, 2a, e 3a como alvo para descoberta de potenciais inibidores. Foi realizado um ensaio virtual com modelo cristalográfico construído pelo Modeller com um banco de moléculas naturais provenientes do ZINC12 usando o programa Autodock Vina que se baseia no algoritmo genético Lamarckiano. Observe-se que o resultado do modelo gerado pelo Modeller do domínio catalítico apresentou para os genótipos 1b, 2a e 3a respectivamente 94,5%, 94,9% e 94,9% dos resíduos previstos dentro da região favorável. Os valores de RMSD obtido para os modelos dos genótipos 1b, 2a e 3a do domínio catalítico foram de 0,259Å, 0,259Å e 0,295Å. Dos 1.239 compostos testados virtualmente, 10 foram selecionados para investigação. 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Programa de Pós-Graduação em Virologia. Ananindeua, PA, Brasil.porProspecção de moléculas com potenciais inibidores da serino protease do vírus da hepatiteinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis2021-09-27Núcleo de Ensino e Pós-GraduaçãoMS/SVS/Instituto Evandro ChagasAnanindeua / PAPrograma de Pós-Graduação em VirologiaHepatite CHepatite C / tratamento farmacológicoHepacivirus / patogenicidadeAntivirais / farmacologiaDesenho de FármacosInibidores da HCV NS3-4A Proteaseinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Digital do Instituto Evandro Chagas (Patuá)instname:Instituto Evandro Chagas (IEC)instacron:IECORIGINALProspecção de moléculas com potenciais inibidores da serino protease do vírus da hepatite.pdfProspecção de moléculas com potenciais inibidores da serino protease do vírus da hepatite.pdfapplication/pdf6327168https://patua.iec.gov.br/bitstreams/cdeee9f9-cb71-4d22-b4c1-351e011da602/downloadb076b2453223049d964358143694cb81MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82182https://patua.iec.gov.br/bitstreams/060b8104-a028-4e11-ab56-60697d1f6fb0/download11832eea31b16df8613079d742d61793MD52TEXTProspecção de moléculas com potenciais inibidores da serino protease do vírus da hepatite.pdf.txtProspecção de moléculas com potenciais inibidores da serino protease do vírus da hepatite.pdf.txtExtracted texttext/plain102819https://patua.iec.gov.br/bitstreams/fdddc614-2ae8-4dd7-9795-33647ab05a1a/downloadeea569f1794caf9cc5485e217b3c666aMD53THUMBNAILProspecção de moléculas com potenciais inibidores da serino protease do vírus da hepatite.pdf.jpgProspecção de moléculas com potenciais inibidores da serino protease do vírus da hepatite.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg2836https://patua.iec.gov.br/bitstreams/904c6eb0-f82c-41d0-be80-bb30d97fe75a/download7ca5c2181471cff509bfb06b51b7e33fMD54iec/66932022-12-15 18:35:34.294oai:patua.iec.gov.br:iec/6693https://patua.iec.gov.brRepositório InstitucionalPUBhttps://patua.iec.gov.br/oai/requestclariceneta@iec.gov.br || Biblioteca@iec.gov.bropendoar:2022-12-15T18:35:34Repositório Digital do Instituto Evandro Chagas (Patuá) - 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