Mutações de resistência a inibidores antivirais nos genes NS5A e NS5B em casuística de hepatite C, Pará, Brasil

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Figueiredo, Andrea Lima Silva
Data de Publicação: 2022
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Digital do Instituto Evandro Chagas (Patuá)
Texto Completo: https://patua.iec.gov.br/handle/iec/6958
Resumo: O vírus da hepatite C (HCV) atinge cerca de 58 milhões de pessoas no mundo. Dados do Brasil estimam que 0,7% da sua população seja soropositiva e 10 a 20% destas, desenvolverão cirrose e carcinoma hepatocelular. Este hepacivirus constituído por genoma de RNA, possui 8 genótipos, transmissão principal via parenteral, e o seu principal meio de diagnóstico é através da testes sorológicos. O desenvolvimento de novos antivirais de ação direta (DAA) tem contribuído para a resposta virológica sustentada (RVS), eliminando a infecção e alcançando a cura da hepatite C crônica. No entanto, pacientes pré-tratados podem desenvolver resistência natural aos DAA, o que pode contribuir para o falha do tratamento. Com o objetivo de avaliar a prevalência natural, identificar o padrão específico de substituições nucleotídicas associadas com resistência (RAS) e avaliar a taxa das RVS em amostras de 34 pacientes cronicamente infectados do Hospital Fundação Santa Casa de Misericórdia do Pará realizou-se estudo descritivo exploratório quantitativo, de corte transversal. As amostras de soro/plasma foram submetidas à extração de RNA utilizando o kit comercial QIAamp EZ1 Viral, de acordo com as recomendações do fabricante. O cDNA foi amplificado com auxílio de iniciadores randômicos (IDT) e da enzima SuperScript III. Por meio das técnicas de Reação em Cadeia da Polimerase convencional e Semi-nested-PCR amplificou-se segmentos de 792 pb e 382 pb dos genes das proteínas não estruturais NS5A e NS5B do vírus da hepatite C, respectivamente e seus produtos foram sequenciados, purificada acordo com as instruções do fabricante, na plataforma 3130xl Genetic Analyzer. Em relação ao gene NS5A, observou-se polimorfismos nas sequências de 42,8% (12/28) das amostras analisadas sendo que em 17,8% (5/28) delas observou-se importante RSA. Já em relação ao gene NS5B, polimorfismos de sequência foram identificados em 15% (5/33) das amostras, porém não observou-se nenhum RAS importante. A taxa de RVS encontrada neste estudo foi de 90% (1/10). As RASs encontradas em amostras de pré-tratamento de pacientes com hepatite C circulantes no estado do Pará, foram A30K + A62S (genótipo 3), L31M, R30Q, Y93H (genótipo 1b), o que chama atenção para um possível aumento da resistência a alguns DAA utilizados no tratamento do HCV. Este estudo destacou que a taxa de RVS na rotina clínica no Brasil foi semelhante aos ensaios clínicos randomizados.
id IEC-2_84c97b71bb6d6ed42bbe24485514258d
oai_identifier_str oai:patua.iec.gov.br:iec/6958
network_acronym_str IEC-2
network_name_str Repositório Digital do Instituto Evandro Chagas (Patuá)
repository_id_str
spelling Figueiredo, Andrea Lima SilvaNunes, Heloisa MarcelianoMachado, Luiz Fernando AlmeidaRocha, Daniela Cristiane da CruzFreitas, Pedro Eduardo BonfimLima, Marcelo de OliveiraMorais, Lena Líllian Sá de Canto2023-09-18T16:36:11Z2023-09-18T16:36:11Z2022FIGUEIREDO, Andrea Lima Silva. Mutações de resistência a inibidores antivirais nos genes NS5A e NS5B em casuística de hepatite C, Pará, Brasil. 2022. 68 f. Dissertação (Mestrado em Epidemiologia e Vigilância em Saúde) - Instituto Evandro Chagas, Programa de Pós-Graduação em Virologia, Ananindeua, 2022. Disponível em: https://patua.iec.gov.br/handle/iec/6958.https://patua.iec.gov.br/handle/iec/6958O vírus da hepatite C (HCV) atinge cerca de 58 milhões de pessoas no mundo. Dados do Brasil estimam que 0,7% da sua população seja soropositiva e 10 a 20% destas, desenvolverão cirrose e carcinoma hepatocelular. Este hepacivirus constituído por genoma de RNA, possui 8 genótipos, transmissão principal via parenteral, e o seu principal meio de diagnóstico é através da testes sorológicos. O desenvolvimento de novos antivirais de ação direta (DAA) tem contribuído para a resposta virológica sustentada (RVS), eliminando a infecção e alcançando a cura da hepatite C crônica. No entanto, pacientes pré-tratados podem desenvolver resistência natural aos DAA, o que pode contribuir para o falha do tratamento. Com o objetivo de avaliar a prevalência natural, identificar o padrão específico de substituições nucleotídicas associadas com resistência (RAS) e avaliar a taxa das RVS em amostras de 34 pacientes cronicamente infectados do Hospital Fundação Santa Casa de Misericórdia do Pará realizou-se estudo descritivo exploratório quantitativo, de corte transversal. As amostras de soro/plasma foram submetidas à extração de RNA utilizando o kit comercial QIAamp EZ1 Viral, de acordo com as recomendações do fabricante. O cDNA foi amplificado com auxílio de iniciadores randômicos (IDT) e da enzima SuperScript III. Por meio das técnicas de Reação em Cadeia da Polimerase convencional e Semi-nested-PCR amplificou-se segmentos de 792 pb e 382 pb dos genes das proteínas não estruturais NS5A e NS5B do vírus da hepatite C, respectivamente e seus produtos foram sequenciados, purificada acordo com as instruções do fabricante, na plataforma 3130xl Genetic Analyzer. Em relação ao gene NS5A, observou-se polimorfismos nas sequências de 42,8% (12/28) das amostras analisadas sendo que em 17,8% (5/28) delas observou-se importante RSA. Já em relação ao gene NS5B, polimorfismos de sequência foram identificados em 15% (5/33) das amostras, porém não observou-se nenhum RAS importante. A taxa de RVS encontrada neste estudo foi de 90% (1/10). As RASs encontradas em amostras de pré-tratamento de pacientes com hepatite C circulantes no estado do Pará, foram A30K + A62S (genótipo 3), L31M, R30Q, Y93H (genótipo 1b), o que chama atenção para um possível aumento da resistência a alguns DAA utilizados no tratamento do HCV. Este estudo destacou que a taxa de RVS na rotina clínica no Brasil foi semelhante aos ensaios clínicos randomizados.Ministério da Saúde. Secretaria de Ciência, Tecnologia, Inovação e Insumos Estratégicos. Instituto Evandro Chagas. Programa de Pós-Graduação em Epidemiologia e Vigilância em Saúde. Ananindeua, PA, BrasilporMS/SCTIE/Instituto Evandro ChagasMutações de resistência a inibidores antivirais nos genes NS5A e NS5B em casuística de hepatite C, Pará, Brasilinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisSeção de Ensino, Informação Científica e MemóriaMS/SCTIE/Instituto Evandro ChagasMestrado AcadêmicoAnanindeua / PAPrograma de Pós-Graduação em Epidemiologia e Vigilância em SaúdeHepatite C / virologiaMutação / efeitos dos fármacosFarmacorresistência Viralinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Digital do Instituto Evandro Chagas (Patuá)instname:Instituto Evandro Chagas (IEC)instacron:IECORIGINALMutações de resistência a inibidores antivirais nos genes NS5A e NS5B em casuística de hepatite C, Pará, Brasil.pdfMutações de resistência a inibidores antivirais nos genes NS5A e NS5B em casuística de hepatite C, Pará, Brasil.pdfapplication/pdf3084150https://patua.iec.gov.br/bitstreams/19032459-730e-400f-96e1-a0bbf2680290/download11ede9495b532a8bc00d85a7d4aa3e63MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82182https://patua.iec.gov.br/bitstreams/e3096f09-c805-40dc-8a2d-39d129873565/download11832eea31b16df8613079d742d61793MD52TEXTMutações de resistência a inibidores antivirais nos genes NS5A e NS5B em casuística de hepatite C, Pará, Brasil.pdf.txtMutações de resistência a inibidores antivirais nos genes NS5A e NS5B em casuística de hepatite C, Pará, Brasil.pdf.txtExtracted texttext/plain102856https://patua.iec.gov.br/bitstreams/1771e4b6-3a35-435a-bf77-42c8a653e277/download0bdbe075e4ef10008a2047acfbc63385MD53THUMBNAILMutações de resistência a inibidores antivirais nos genes NS5A e NS5B em casuística de hepatite C, Pará, Brasil.pdf.jpgMutações de resistência a inibidores antivirais nos genes NS5A e NS5B em casuística de hepatite C, Pará, Brasil.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg2819https://patua.iec.gov.br/bitstreams/c8127746-7d92-4895-9c9d-ccfe9123ecf1/download4372f503520a7d20c40a3c26d00ac883MD54iec/69582023-09-18 16:56:08.925oai:patua.iec.gov.br:iec/6958https://patua.iec.gov.brRepositório InstitucionalPUBhttps://patua.iec.gov.br/oai/requestclariceneta@iec.gov.br || Biblioteca@iec.gov.bropendoar:2023-09-18T16:56:08Repositório Digital do Instituto Evandro Chagas (Patuá) - Instituto Evandro Chagas (IEC)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
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Mutações de resistência a inibidores antivirais nos genes NS5A e NS5B em casuística de hepatite C, Pará, Brasil
title Mutações de resistência a inibidores antivirais nos genes NS5A e NS5B em casuística de hepatite C, Pará, Brasil
spellingShingle Mutações de resistência a inibidores antivirais nos genes NS5A e NS5B em casuística de hepatite C, Pará, Brasil
Figueiredo, Andrea Lima Silva
Hepatite C / virologia
Mutação / efeitos dos fármacos
Farmacorresistência Viral
title_short Mutações de resistência a inibidores antivirais nos genes NS5A e NS5B em casuística de hepatite C, Pará, Brasil
title_full Mutações de resistência a inibidores antivirais nos genes NS5A e NS5B em casuística de hepatite C, Pará, Brasil
title_fullStr Mutações de resistência a inibidores antivirais nos genes NS5A e NS5B em casuística de hepatite C, Pará, Brasil
title_full_unstemmed Mutações de resistência a inibidores antivirais nos genes NS5A e NS5B em casuística de hepatite C, Pará, Brasil
title_sort Mutações de resistência a inibidores antivirais nos genes NS5A e NS5B em casuística de hepatite C, Pará, Brasil
author Figueiredo, Andrea Lima Silva
author_facet Figueiredo, Andrea Lima Silva
author_role author
dc.contributor.advisorco.-.fl_str_mv Nunes, Heloisa Marceliano
dc.contributor.member.-.fl_str_mv Machado, Luiz Fernando Almeida
Rocha, Daniela Cristiane da Cruz
Freitas, Pedro Eduardo Bonfim
Lima, Marcelo de Oliveira
dc.contributor.author.fl_str_mv Figueiredo, Andrea Lima Silva
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Morais, Lena Líllian Sá de Canto
contributor_str_mv Morais, Lena Líllian Sá de Canto
dc.subject.decsPrimary.pt_BR.fl_str_mv Hepatite C / virologia
Mutação / efeitos dos fármacos
Farmacorresistência Viral
topic Hepatite C / virologia
Mutação / efeitos dos fármacos
Farmacorresistência Viral
description O vírus da hepatite C (HCV) atinge cerca de 58 milhões de pessoas no mundo. Dados do Brasil estimam que 0,7% da sua população seja soropositiva e 10 a 20% destas, desenvolverão cirrose e carcinoma hepatocelular. Este hepacivirus constituído por genoma de RNA, possui 8 genótipos, transmissão principal via parenteral, e o seu principal meio de diagnóstico é através da testes sorológicos. O desenvolvimento de novos antivirais de ação direta (DAA) tem contribuído para a resposta virológica sustentada (RVS), eliminando a infecção e alcançando a cura da hepatite C crônica. No entanto, pacientes pré-tratados podem desenvolver resistência natural aos DAA, o que pode contribuir para o falha do tratamento. Com o objetivo de avaliar a prevalência natural, identificar o padrão específico de substituições nucleotídicas associadas com resistência (RAS) e avaliar a taxa das RVS em amostras de 34 pacientes cronicamente infectados do Hospital Fundação Santa Casa de Misericórdia do Pará realizou-se estudo descritivo exploratório quantitativo, de corte transversal. As amostras de soro/plasma foram submetidas à extração de RNA utilizando o kit comercial QIAamp EZ1 Viral, de acordo com as recomendações do fabricante. O cDNA foi amplificado com auxílio de iniciadores randômicos (IDT) e da enzima SuperScript III. Por meio das técnicas de Reação em Cadeia da Polimerase convencional e Semi-nested-PCR amplificou-se segmentos de 792 pb e 382 pb dos genes das proteínas não estruturais NS5A e NS5B do vírus da hepatite C, respectivamente e seus produtos foram sequenciados, purificada acordo com as instruções do fabricante, na plataforma 3130xl Genetic Analyzer. Em relação ao gene NS5A, observou-se polimorfismos nas sequências de 42,8% (12/28) das amostras analisadas sendo que em 17,8% (5/28) delas observou-se importante RSA. Já em relação ao gene NS5B, polimorfismos de sequência foram identificados em 15% (5/33) das amostras, porém não observou-se nenhum RAS importante. A taxa de RVS encontrada neste estudo foi de 90% (1/10). As RASs encontradas em amostras de pré-tratamento de pacientes com hepatite C circulantes no estado do Pará, foram A30K + A62S (genótipo 3), L31M, R30Q, Y93H (genótipo 1b), o que chama atenção para um possível aumento da resistência a alguns DAA utilizados no tratamento do HCV. Este estudo destacou que a taxa de RVS na rotina clínica no Brasil foi semelhante aos ensaios clínicos randomizados.
publishDate 2022
dc.date.issued.fl_str_mv 2022
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2023-09-18T16:36:11Z
dc.date.available.fl_str_mv 2023-09-18T16:36:11Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv FIGUEIREDO, Andrea Lima Silva. Mutações de resistência a inibidores antivirais nos genes NS5A e NS5B em casuística de hepatite C, Pará, Brasil. 2022. 68 f. Dissertação (Mestrado em Epidemiologia e Vigilância em Saúde) - Instituto Evandro Chagas, Programa de Pós-Graduação em Virologia, Ananindeua, 2022. Disponível em: https://patua.iec.gov.br/handle/iec/6958.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://patua.iec.gov.br/handle/iec/6958
identifier_str_mv FIGUEIREDO, Andrea Lima Silva. Mutações de resistência a inibidores antivirais nos genes NS5A e NS5B em casuística de hepatite C, Pará, Brasil. 2022. 68 f. Dissertação (Mestrado em Epidemiologia e Vigilância em Saúde) - Instituto Evandro Chagas, Programa de Pós-Graduação em Virologia, Ananindeua, 2022. Disponível em: https://patua.iec.gov.br/handle/iec/6958.
url https://patua.iec.gov.br/handle/iec/6958
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv MS/SCTIE/Instituto Evandro Chagas
publisher.none.fl_str_mv MS/SCTIE/Instituto Evandro Chagas
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Digital do Instituto Evandro Chagas (Patuá)
instname:Instituto Evandro Chagas (IEC)
instacron:IEC
instname_str Instituto Evandro Chagas (IEC)
instacron_str IEC
institution IEC
reponame_str Repositório Digital do Instituto Evandro Chagas (Patuá)
collection Repositório Digital do Instituto Evandro Chagas (Patuá)
bitstream.url.fl_str_mv https://patua.iec.gov.br/bitstreams/19032459-730e-400f-96e1-a0bbf2680290/download
https://patua.iec.gov.br/bitstreams/e3096f09-c805-40dc-8a2d-39d129873565/download
https://patua.iec.gov.br/bitstreams/1771e4b6-3a35-435a-bf77-42c8a653e277/download
https://patua.iec.gov.br/bitstreams/c8127746-7d92-4895-9c9d-ccfe9123ecf1/download
bitstream.checksum.fl_str_mv 11ede9495b532a8bc00d85a7d4aa3e63
11832eea31b16df8613079d742d61793
0bdbe075e4ef10008a2047acfbc63385
4372f503520a7d20c40a3c26d00ac883
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Digital do Instituto Evandro Chagas (Patuá) - Instituto Evandro Chagas (IEC)
repository.mail.fl_str_mv clariceneta@iec.gov.br || Biblioteca@iec.gov.br
_version_ 1809190052223254528