Caracterização genômica de rotavírus A com potencial zoonótico em Belém, Pará, Brasil
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Source: | Repositório Digital do Instituto Evandro Chagas (Patuá) |
Download full: | https://patua.iec.gov.br/handle/iec/4215 |
Summary: | Os RVA são de particular importância epidemiológica e estão dispersos em todo o mundo, causando a maioria das gastroenterites em humanos e com alta prevalência em animais. A transmissão zoonótica pode ocorrer de animais para humanos, e as vacinas previnem a infecção por RVA, contudo novas cepas surgem e a recombinação zoonótica explica a atual diversidade antigênica e genética de RVA. No estudo, selecionou-se 83 amostras fecais de origem humana positivas para RVA de Belém, Pará, Brasil. Identificou-se 17 amostras com potencial zoonótico, destas, nove foram confirmadas como potencial zoonótico. As amostras do genótipo G4P[6] apresentaram origem suína. A amostra HSE005 apresentou perfil zoonótico e as análises filogenéticas indicaram que esta amostra agrupou na linhagem II quando analisada para a maioria dos genes, exceto para VP7, VP4 e NSP4. Foi identificado padrão de rearranjo com amostras oriundas de suínos para os genes NSP4, VP3, VP4 e VP6. Uma amostra de genótipo G3P[3] evoluiu de origem canina, felina e símia e um rearranjo com a linhagem II. As cepas G12P[9] tiveram origem em quirópteros, bovinos e felinos. O presente estudo incluiu análises filodinâmicas para elucidar os padrões evolutivos desconhecidos, principalmente em relação aos genótipos G3P[3] e G12P[9]. Esses eventos evolutivos contribuem na identificação de cepas emergentes de RVA com potencial zoonótico e escape vacinal. |
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Bandeira, Renato da SilvaSousa, Maisa Silva deSoares, Luana da SilvaSilva, Luciana Damascena daCasseb, Samir Mansour MoraesMascarenhas, Joana D’Arc Pereira2020-12-16T14:11:28Z2020-12-16T14:11:28Z2019BANDEIRA, Renato da Silva.Caracterização genômica de rotavírus A com potencial zoonótico em Belém, Pará, Brasil. 85f. Tese (Doutorado em Virologia) - Instituto Evandro Chagas, Programa de Pós-Graduação em Virologia, Ananindeua, 2019.https://patua.iec.gov.br/handle/iec/4215Os RVA são de particular importância epidemiológica e estão dispersos em todo o mundo, causando a maioria das gastroenterites em humanos e com alta prevalência em animais. A transmissão zoonótica pode ocorrer de animais para humanos, e as vacinas previnem a infecção por RVA, contudo novas cepas surgem e a recombinação zoonótica explica a atual diversidade antigênica e genética de RVA. No estudo, selecionou-se 83 amostras fecais de origem humana positivas para RVA de Belém, Pará, Brasil. Identificou-se 17 amostras com potencial zoonótico, destas, nove foram confirmadas como potencial zoonótico. As amostras do genótipo G4P[6] apresentaram origem suína. A amostra HSE005 apresentou perfil zoonótico e as análises filogenéticas indicaram que esta amostra agrupou na linhagem II quando analisada para a maioria dos genes, exceto para VP7, VP4 e NSP4. Foi identificado padrão de rearranjo com amostras oriundas de suínos para os genes NSP4, VP3, VP4 e VP6. Uma amostra de genótipo G3P[3] evoluiu de origem canina, felina e símia e um rearranjo com a linhagem II. As cepas G12P[9] tiveram origem em quirópteros, bovinos e felinos. O presente estudo incluiu análises filodinâmicas para elucidar os padrões evolutivos desconhecidos, principalmente em relação aos genótipos G3P[3] e G12P[9]. Esses eventos evolutivos contribuem na identificação de cepas emergentes de RVA com potencial zoonótico e escape vacinal.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Programa de Pós-Graduação em Virologia. Ananindeua, PA, Brasil.porMS/SVS/Instituto Evandro ChagasCaracterização genômica de rotavírus A com potencial zoonótico em Belém, Pará, Brasilinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis2019-05-12Núcleo de Ensino e Pós-GraduaçãoInstituto Evandro ChagasAnanindeua / PAPrograma de Pós-Graduação em VirologiaRotavirus / isolamento & purificaçãoInfecções por Rotavirus / veterináriaGastroenterite / patologiainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Digital do Instituto Evandro Chagas (Patuá)instname:Instituto Evandro Chagas (IEC)instacron:IECORIGINALCaracterização genômica de rotavírus A com potencial zoonótico em Belém, Pará, Brasil.pdfCaracterização genômica de rotavírus A com potencial zoonótico em Belém, Pará, Brasil.pdfapplication/pdf14258457https://patua.iec.gov.br/bitstreams/752df5cd-909e-4ad6-bce5-e29d8a5bc499/downloadc5ab46628ba4ee7ff86163647900a3ecMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82182https://patua.iec.gov.br/bitstreams/521b5406-19c1-4913-89a6-f7460fb4448c/download11832eea31b16df8613079d742d61793MD52TEXTCaracterização genômica de rotavírus A com potencial zoonótico em Belém, Pará, Brasil.pdf.txtCaracterização genômica de rotavírus A com potencial zoonótico em Belém, Pará, Brasil.pdf.txtExtracted texttext/plain102361https://patua.iec.gov.br/bitstreams/6550a14f-b69a-4f4b-a82a-5b54dd70f52c/download2ba16da75d241b67966dc29c6bc2a47aMD55THUMBNAILCaracterização genômica de rotavírus A com potencial zoonótico em Belém, Pará, Brasil.pdf.jpgCaracterização genômica de rotavírus A com potencial zoonótico em Belém, Pará, Brasil.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg2594https://patua.iec.gov.br/bitstreams/b09fe21c-eda8-4e42-b929-c26c6c9b5816/download28908471ebb21b119be3fd4bd6b6b1c8MD56iec/42152022-10-20 21:49:34.858oai:patua.iec.gov.br:iec/4215https://patua.iec.gov.brRepositório InstitucionalPUBhttps://patua.iec.gov.br/oai/requestclariceneta@iec.gov.br || Biblioteca@iec.gov.bropendoar:2022-10-20T21:49:34Repositório Digital do Instituto Evandro Chagas (Patuá) - Instituto Evandro Chagas (IEC)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 |
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