Genetic diversity and primary resistance among HIV-1-positive patients from Maringá, Paraná, Brazil

• Autor(a) principal: Gaspareto, Karine Vieira
• Data de Publicação: 2012
• Outros Autores: Mello, Flávia Myrian Martins de Almeida, Dias, José Ricardo Colleti, Meneguetti, Vera Alice Fernandes, Storti, Marta Evelyn Giansante, Ferreira, João Leandro de Paula, Lança, André Minhoto, Rodrigues, Rosângela, Brígido, Luis Fernando de Macedo, Teixeira, Jorge Juarez Vieira, Bertolini, Dennis Armando
• Tipo de documento: Artigo
• Idioma: eng
• Título da fonte: Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo
• Texto Completo: https://www.revistas.usp.br/rimtsp/article/view/48391
• topic: Primary resistance; Transmitted resistance; HIV-1; Naïve patients; Subtypes; Brazil

O objetivo foi identificar subtipos do Vírus da Imunodeficiência Humana tipo-1 (HIV-1) e analisar a presença de mutações/polimorfismos nas regiões da protease (PR) e transcriptase reversa (TR) de 48 pacientes virgens de tratamento atendidos no município de Maringá, Paraná, Brasil. O sequenciamento foi conduzido usando produtos de nested PCR dos genes da PR, TR parcial e group-specific antigen gene (gag) de RNA retrotranscrito. A interpretação da resistência transmitida foi realizada segundo o algoritmo Surveillance Drug Resistance Mutation List (SDRM). As análises filogenética e SimPlot dos segmentos concatenados classificaram as sequências como subtipo B 19/48 (39,6%), subtipo C 12/48 (25%), subtipo F 4/48 (8,3%), com 13/48 (27,1%) formas recombinantes. A maioria das formas recombinantes era mosaicos B (B/F 12,5%, B/C 10,4%), com um C/F (2,1%) e um mosaico complexo B/C/F (2,1%). A prevalência de resistência transmitida foi de 4,2% (2,1% para ITRN e 2,1% para IP). Baixos níveis de resistência transmitida foram encontrados nesse estudo, 2/48 (2,1% para INTR e 2,1% para IP). Esses achados, embora preliminares, podem contribuir no monitoramento da epidemia de HIV na região.