Clonagem, caracteriza????o e an??lise filogen??tica das subunidades alfa e beta do horm??nio fol??culo estimulante de Pirarucu (Arapalma gigas) visando sua s??ntese em c??lulas CHO
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Data de Publicação: | 2014 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Título da fonte: | Repositório Institucional do IPEN |
Texto Completo: | http://repositorio.ipen.br/handle/123456789/11796 |
Resumo: | O Pirarucu (Arapaima gigas) ?? um peixe gigante da fam??lia Arapaimidae, nativo das bacias amaz??nicas que pode chegar a dois metros de comprimento e pesar mais de 200 Kg. Est?? presente no Equador, na Col??mbia, no Peru, na Bol??via e no Brasil. Atualmente a esp??cie est?? amea??ada de extin????o devido ?? pesca predat??ria e ao aumento da presen??a humana em seus viveiros naturais. No presente trabalho, os cDNAs da subunidade (ag-GTHα) e da subunidade β do horm??nio fol??culo estimulante de A. gigas (ag-FSH) foram isolados e clonados pela primeira vez, possibilitando uma melhor compreens??o da diversidade e evolu????o desta glicoprote??na em peixes e a futura s??ntese biotecnol??gica deste horm??nio para fins reprodutivos e aliment??cios. Tanto o cDNA do ag-GTHα quanto aquele do ag-FSHβ foram sintetizados pela rea????o de transcriptase reversa (RT) e pela rea????o em cadeia da polimerase (PCR) utilizando como molde RNA total proveniente das gl??ndulas hipofis??rias de A. gigas. O cDNA da subunidade ag-GTHα possui uma sequ??ncia codificadora (Open Reading Frame, ORF) de 348 pb, o que corresponde a uma prote??na de 115 amino??cidos com um suposto pept??deo sinal de 24 amino??cidos e com um pept??deo maduro de 91 amino??cidos. Dez res??duos de ciste??nas respons??veis pela forma????o de cinco pontes dissulfeto, dois s??tios de N-glicosila????o e tr??s res??duos de prolinas apresentaram-se altamente conservados quando comparados com outras esp??cies de peixes. A compara????o baseada em sequ??ncias de amino??cidos de GTHα de 38 esp??cies de peixes revelou alta identidade do A. gigas com membros das seguintes ordens: Acipenseriformes, Anguiliformes, Siluriformes e Cypriniformes (87,1-89,5%), e, a menor identidade com os Gadiformes e Cyprinodontiformes (55%). A identidade com a an??loga sequ??ncia de GTHα de Homo sapiens foi de 67%. Para a subunidade ag-FSHβ, a ORF correspondente foi de 381 pb, produzindo uma prote??na de 126 amino??cidos com um pept??deo sinal de 18 e um pept??deo maduro de 108 amino??cidos. Quando comparado com as sequ??ncias de Anguilla marmorata, Acipenser gueldenstaedtii e Homo sapiens, o pept??deo maduro de ag-FSHβ mostrou conter 12 res??duos de ciste??nas respons??veis pela forma????o de seis pontes dissulfeto, duas prolinas e um s??tio de glicosila????o perfeitamente conservados, apresentando identidades de 63, 50 e 45% respectivamente em suas sequ??ncias de amino??cidos. As ??rvores filogen??ticas constru??das mostraram, em geral, que o A. gigas, da ordem dos Osteoglossiformes, se apresenta como grupo irm??o dos Clupeocefala, enquanto os Elopomorpha (Anguiliformes) formam o grupo mais basal de todos os tele??steos aqui analisados. |
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Paolo BartoliniCARVALHO, ROBERTO F. de20142014-11-10T11:09:13Z2014-11-10T11:09:13Zhttp://repositorio.ipen.br/handle/123456789/1179610.11606/D.85.2014.tde-08092014-150519O Pirarucu (Arapaima gigas) ?? um peixe gigante da fam??lia Arapaimidae, nativo das bacias amaz??nicas que pode chegar a dois metros de comprimento e pesar mais de 200 Kg. Est?? presente no Equador, na Col??mbia, no Peru, na Bol??via e no Brasil. Atualmente a esp??cie est?? amea??ada de extin????o devido ?? pesca predat??ria e ao aumento da presen??a humana em seus viveiros naturais. No presente trabalho, os cDNAs da subunidade (ag-GTHα) e da subunidade β do horm??nio fol??culo estimulante de A. gigas (ag-FSH) foram isolados e clonados pela primeira vez, possibilitando uma melhor compreens??o da diversidade e evolu????o desta glicoprote??na em peixes e a futura s??ntese biotecnol??gica deste horm??nio para fins reprodutivos e aliment??cios. 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A compara????o baseada em sequ??ncias de amino??cidos de GTHα de 38 esp??cies de peixes revelou alta identidade do A. gigas com membros das seguintes ordens: Acipenseriformes, Anguiliformes, Siluriformes e Cypriniformes (87,1-89,5%), e, a menor identidade com os Gadiformes e Cyprinodontiformes (55%). A identidade com a an??loga sequ??ncia de GTHα de Homo sapiens foi de 67%. Para a subunidade ag-FSHβ, a ORF correspondente foi de 381 pb, produzindo uma prote??na de 126 amino??cidos com um pept??deo sinal de 18 e um pept??deo maduro de 108 amino??cidos. Quando comparado com as sequ??ncias de Anguilla marmorata, Acipenser gueldenstaedtii e Homo sapiens, o pept??deo maduro de ag-FSHβ mostrou conter 12 res??duos de ciste??nas respons??veis pela forma????o de seis pontes dissulfeto, duas prolinas e um s??tio de glicosila????o perfeitamente conservados, apresentando identidades de 63, 50 e 45% respectivamente em suas sequ??ncias de amino??cidos. 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No. of bitstreams: 0Disserta????o (Mestrado em Tecnologia Nuclear)IPEN/DInstituto de Pesquisas Energeticas e Nucleares - IPEN-CNEN/SP69fishesfshdna-cloninggeneticschemical analysischo cellspolymerase chain reactionrnaClonagem, caracteriza????o e an??lise filogen??tica das subunidades alfa e beta do horm??nio fol??culo estimulante de Pirarucu (Arapalma gigas) visando sua s??ntese em c??lulas CHOCloning, characterization and phylogenetic analysis of the alpha and beta subunits of the follicle stimulating hormone of Pirarucu (Arapalma gigas) in view of its synthesis in CHO cellsinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisNS??o Pauloinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional do IPENinstname:Instituto de Pesquisas Energéticas e Nucleares (IPEN)instacron:IPEN20162T591.147: / C331cCARVALHO, ROBERTO F. de14-11http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/85/85131/tde-08092014-150519/pt-br.php10146CARVALHO, ROBERTO F. 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