Análise da expressão gênica por RNASeq transcriptoma para o desenvolvimento de biomarcadores entre gestantes saudáveis e com hipotireoidismo primário
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Data de Publicação: | 2016 |
Tipo de documento: | Dissertação |
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Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Uninove |
Texto Completo: | http://bibliotecatede.uninove.br/handle/tede/3016 |
Resumo: | During pregnancy, under the endocrinological perspective, thyroid disorders are the most common in that period. However, they are ignored because of the non-specific nature of the symptoms and hypermetabolic state at this stage. Hypothyroidism in its clinical or subclinical, is similarly defined as outside of pregnancy. The thyroid stimulating hormone (TSH) acts as an important factor in the assessment of thyroid status in pregnancy. This disease has a prevalence important in pregnancy ranging from 1% to 1.5% and 5% and 8%, respectively on their clinical and subclinical. TSH reference values for pregnant women are different from the non-pregnant population and vary quarterly. The intense physiological changes of pregnancy influence the interpretation of thyroid function. This study aims to evaluate the profile of gene expression in the blood of women with gestational hypothyroidism and compare with the healthy pregnant women, and through RNA-Seq transcriptome define biomarkers for diagnosis of this disease more accurately. Fifty patients were evaluated, and selected these four in the control group and four for the hypothyroid group to perform the analysis. After statistical analysis, 11531 transcripts were found, and found loss of expression in 981 and gain 886. After the grouping of genes, we can see that the panel built with differentially expressed genes, allows to differentiate the group control group with hypothyroidism, forming a panel of biomarkers for the ability to differentiate euthyroid primary and subclinical hypothyroidism during pregnancy and also correlate them with serum TSH levels during pregnancy. The next step of this study will be the validation of these genes in a larger number of primary euthyroid and hypothyroid pregnant women by PCR in Real Time. |
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Hypothyroidism in its clinical or subclinical, is similarly defined as outside of pregnancy. The thyroid stimulating hormone (TSH) acts as an important factor in the assessment of thyroid status in pregnancy. This disease has a prevalence important in pregnancy ranging from 1% to 1.5% and 5% and 8%, respectively on their clinical and subclinical. TSH reference values for pregnant women are different from the non-pregnant population and vary quarterly. The intense physiological changes of pregnancy influence the interpretation of thyroid function. This study aims to evaluate the profile of gene expression in the blood of women with gestational hypothyroidism and compare with the healthy pregnant women, and through RNA-Seq transcriptome define biomarkers for diagnosis of this disease more accurately. Fifty patients were evaluated, and selected these four in the control group and four for the hypothyroid group to perform the analysis. After statistical analysis, 11531 transcripts were found, and found loss of expression in 981 and gain 886. After the grouping of genes, we can see that the panel built with differentially expressed genes, allows to differentiate the group control group with hypothyroidism, forming a panel of biomarkers for the ability to differentiate euthyroid primary and subclinical hypothyroidism during pregnancy and also correlate them with serum TSH levels during pregnancy. The next step of this study will be the validation of these genes in a larger number of primary euthyroid and hypothyroid pregnant women by PCR in Real Time.Na gestação, sob a perspectiva endocrinológica, os distúrbios da tireoide são os mais comuns nesse período. Todavia, são ignorados por causa da natureza não específica dos sintomas e do estado hipermetabólico nesta fase. O hipotireoidismo, na sua forma clínica ou subclínica, é definido semelhantemente como fora da gestação. O hormônio tireoestimulante (TSH) atua como um importante fator na avaliação do estado tireoide na gravidez. Esta doença tem uma prevalência importante na gravidez que varia de 1% a 1,5% e de 5% a 8%, respectivamente na sua forma clínica e subclínica. Os valores de referência do TSH para gestantes são diferentes da população não-gestante e variam trimestralmente. As intensas alterações fisiológicas da gravidez influenciam a interpretação da função tireoidiana. Este estudo tem como proposta avaliar o perfil de expressão gênica no sangue de mulheres com hipotireoidismo gestacional e comparar com o de gestantes saudáveis, através de RNAseq transcriptoma e definir biomarcadores para diagnóstico desta doença de maneira mais precisa. Foram avaliadas cinquenta gestantes, sendo selecionadas destas, quatro para o grupo controle e quatro para o grupo de hipotireoideas para realização da análise. Após a análise estatística, foram encontrados 11531 transcritos, sendo que encontramos perda de expressão em 981 e ganho em 886. Após o agrupamento dos genes, podemos observar que o painel construído com genes diferencialmente expressos, permite diferenciar o grupo controle do grupo com hipotireoidismo, formando um painel de biomarcadores pela capacidade de diferenciar o eutireoidismo do hipotireoidismo primário e subclínico na gestação e também correlacioná-los com os níveis séricos de TSH na gestação. A próxima etapa deste trabalho será a validação desses genes em um número maior de gestantes eutireoidianas e hipotireoidianas primárias por técnica de PCR em Tempo Real.Submitted by Nadir Basilio (nadirsb@uninove.br) on 2022-07-27T21:31:58Z No. of bitstreams: 1 Lucas dos Santos Bacigalupo.pdf: 3144282 bytes, checksum: 1094793e24bdd52cd4baa91db76a40dd (MD5)Made available in DSpace on 2022-07-27T21:31:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Lucas dos Santos Bacigalupo.pdf: 3144282 bytes, checksum: 1094793e24bdd52cd4baa91db76a40dd (MD5) Previous issue date: 2016-06-28application/pdfporUniversidade Nove de JulhoPrograma de Mestrado em MedicinaUNINOVEBrasilSaúdegestaçãohipotireoidismotranscriptomapregnancyhypothyroidtranscriptomeCIENCIAS DA SAUDEAnálise da expressão gênica por RNASeq transcriptoma para o desenvolvimento de biomarcadores entre gestantes saudáveis e com hipotireoidismo primárioAnalysis of gene expression by RNASeq transcriptome biomarkers for development between healthy pregnant women with primary hypothyroidisminfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis8765449414823306929600info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Uninoveinstname:Universidade Nove de Julho (UNINOVE)instacron:UNINOVEORIGINALLucas dos Santos Bacigalupo.pdfLucas dos Santos Bacigalupo.pdfapplication/pdf3144282http://localhost:8080/tede/bitstream/tede/3016/2/Lucas+dos+Santos+Bacigalupo.pdf1094793e24bdd52cd4baa91db76a40ddMD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82165http://localhost:8080/tede/bitstream/tede/3016/1/license.txtbd3efa91386c1718a7f26a329fdcb468MD51tede/30162022-07-27 18:31:58.445oai:localhost: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Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://bibliotecatede.uninove.br/PRIhttp://bibliotecatede.uninove.br/oai/requestbibliotecatede@uninove.br||bibliotecatede@uninove.bropendoar:2022-07-27T21:31:58Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Uninove - Universidade Nove de Julho (UNINOVE)false |
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