Painel de expressão gênica como biomarcador no hipotiroidismo por transcriptoma RNA-seq em indivíduos com hipotiroidismo primário
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Data de Publicação: | 2016 |
Tipo de documento: | Dissertação |
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Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Uninove |
Texto Completo: | http://bibliotecatede.uninove.br/handle/tede/3023 |
Resumo: | The thyroid hormone (TH), modulates directly and indirectly the primary physiological processes for the development and maintenance of the human body. The neuroendocrine activity provides an integration of complex functions of tissues, generating coordinates answers the specific needs of the body. The hypothalamus, pituitary, thyroid is the classic example of the neuroendocrine control. Hypothyroidism is defined by the thyroid gland unable to produce HT sufficient to meet the metabolic needs of the body. The plasma determination of thyroid stimulating hormone (TSH) is the first test performed on suspicion of primary hypothyroidism. The accuracy of diagnosis of TSH for Hypothyroidism detection still has limitations. Currently the specific molecular diagnostics for thyroid diseases are mostly made for thyroid carcinomas. RNA-Seq (ribonucleic acid sequencing) is currently built by technology called NGS (next generation sequencers) and performs all of the transcripts profile massively. TSH levels and free T4 set to most individuals in euthyroid may not reflect the proper amounts of hormone for the proper functioning of all tissues. The objective of this study was to identify the pattern of gene expression in peripheral blood of patients with hypothyroidism and find a gene or a panel of genes able to differentiate eutiroidianos individuals from patients with primary hypothyroidism. We have identified 5 genes (CCNJL, IMPA2, FAM129B, SLC4A11 and CDK18) that may be useful to form a panel of biomarkers for the ability to differentiate euthyroid primary hypothyroidism and also correlate them with the serum levels of TSH. |
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The hypothalamus, pituitary, thyroid is the classic example of the neuroendocrine control. Hypothyroidism is defined by the thyroid gland unable to produce HT sufficient to meet the metabolic needs of the body. The plasma determination of thyroid stimulating hormone (TSH) is the first test performed on suspicion of primary hypothyroidism. The accuracy of diagnosis of TSH for Hypothyroidism detection still has limitations. Currently the specific molecular diagnostics for thyroid diseases are mostly made for thyroid carcinomas. RNA-Seq (ribonucleic acid sequencing) is currently built by technology called NGS (next generation sequencers) and performs all of the transcripts profile massively. TSH levels and free T4 set to most individuals in euthyroid may not reflect the proper amounts of hormone for the proper functioning of all tissues. The objective of this study was to identify the pattern of gene expression in peripheral blood of patients with hypothyroidism and find a gene or a panel of genes able to differentiate eutiroidianos individuals from patients with primary hypothyroidism. We have identified 5 genes (CCNJL, IMPA2, FAM129B, SLC4A11 and CDK18) that may be useful to form a panel of biomarkers for the ability to differentiate euthyroid primary hypothyroidism and also correlate them with the serum levels of TSH.O hormônio tiroidiano (HT), modula de forma direta e indireta os processos fisiológicos primordiais para o desenvolvimento e manutenção do organismo humano. A atuação neuroendócrina fornece uma integração das complexas funções dos tecidos, gerando respostas coordenadas as específicas necessidades do organismo. O eixo hipotálamo, hipófise, tireoide é o exemplo clássico do controle neuroendócrino. O hipotiroidismo é definido pela incapacidade da glândula tiroide produzir HT suficiente para suprir as necessidades metabólicas do organismo. A determinação plasmática do hormônio estimulador da tiroide (TSH) é o primeiro teste realizado na suspeita do hipotiroidismo primário. A precisão do diagnóstico do TSH para detecção do hipotiroidismo ainda possui limitações. Atualmente os diagnósticos moleculares específicos para as doenças tiroidianas em sua maioria são confeccionados para os carcinomas de tiroide. O RNA-seq (sequenciamento de ácido ribonucleico) atualmente é construído por tecnologias denominadas de NGS (sequenciadores de nova geração) e realiza todo perfil dos transcritos de forma maciça. Os níveis de TSH e T4 livre definido para a maioria dos indivíduos em eutiroidismo podem não refletir as quantidades adequadas de hormônio para o correto funcionamento de todos os tecidos. O objetivo deste trabalho foi identificar o padrão de expressão gênica no sangue periférico de pacientes com hipotiroidismo e encontrar um gene ou um painel de genes capazes de diferenciar os indivíduos eutiroidianos de pacientes com hipotireoidismo primário. Conseguimos identificar 5 genes (CCNJL, IMPA2, FAM129B, SLC4A11 e CDK18) que podem ser úteis formando um painel de biomarcadores pela capacidade de diferenciar o eutiroidismo do hipotiroidismo primário e também correlacioná-los com os níveis séricos de TSH.Submitted by Nadir Basilio (nadirsb@uninove.br) on 2022-08-01T14:14:11Z No. of bitstreams: 1 Robson José de Almeida.pdf: 1702780 bytes, checksum: 7ad52cedea7098cc02b9d86ee883b10d (MD5)Made available in DSpace on 2022-08-01T14:14:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Robson José de Almeida.pdf: 1702780 bytes, checksum: 7ad52cedea7098cc02b9d86ee883b10d (MD5) Previous issue date: 2016-06-14application/pdfporUniversidade Nove de JulhoPrograma de Mestrado em MedicinaUNINOVEBrasilSaúdetiroidehipotiroidismotranscriptomaRNA-seqsequenciamentobiomarcadorthyroidhypothyroidismtranscriptomeRNA-seqsequencingbiomarkerCIENCIAS DA SAUDEPainel de expressão gênica como biomarcador no hipotiroidismo por transcriptoma RNA-seq em indivíduos com hipotiroidismo primárioGene expression in panel biomarker in hypothyroidism for transcriptome RNA-seq in subjects with primary hypothyroidisminfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis8765449414823306929600info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Uninoveinstname:Universidade Nove de Julho (UNINOVE)instacron:UNINOVEORIGINALRobson José de Almeida.pdfRobson José de Almeida.pdfapplication/pdf1702780http://localhost:8080/tede/bitstream/tede/3023/2/Robson+Jos%C3%A9+de+Almeida.pdf7ad52cedea7098cc02b9d86ee883b10dMD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82165http://localhost:8080/tede/bitstream/tede/3023/1/license.txtbd3efa91386c1718a7f26a329fdcb468MD51tede/30232022-08-01 11:14:11.826oai:localhost: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Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://bibliotecatede.uninove.br/PRIhttp://bibliotecatede.uninove.br/oai/requestbibliotecatede@uninove.br||bibliotecatede@uninove.bropendoar:2022-08-01T14:14:11Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Uninove - Universidade Nove de Julho (UNINOVE)false |
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