Sequências de DNA: uma nova abordagem para o alinhamento ótimo
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2016 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_SP |
Texto Completo: | https://tede2.pucsp.br/handle/handle/18207 |
Resumo: | The objective of this study is to deeply understand the techniques currently used in optimal alignment of DNA sequences, focused on the strengths and limitations of these methods. Analyzing the feasibility of creating a new logical approach able to ensure optimal results , taking into account existing problems in optimal alignment as: (i ) the numerous alignment possibilities of two sequences , ( ii ) the great need for space and memory the machines, ( ii ) processing time to compute the optimal data and (iv ) exponential growth. This study allowed the beginning of the creation of a new logical approach to the global optimum alignment, showing promising results in higher scores with less need for calculations where the mastery of these new techniques can lead to use search of excellent results in the global alignment optimal in large data bases |
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Gatti, Daniel Coutohttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4799319H5http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K8152242D4Ioste, Aline Rodrigheri2016-04-29T14:23:42Z2016-04-142016-03-04Ioste, Aline Rodrigheri. Sequências de DNA: uma nova abordagem para o alinhamento ótimo. 2016. 148 f. Dissertação (Mestrado em Tecnologias da Inteligência e Design Digital) - Programa de Estudos Pós-Graduados em Tecnologias da Inteligência e Design Digital da Pontifícia Universidade Católica de São Paulo, São Paulo, 2016.https://tede2.pucsp.br/handle/handle/18207The objective of this study is to deeply understand the techniques currently used in optimal alignment of DNA sequences, focused on the strengths and limitations of these methods. Analyzing the feasibility of creating a new logical approach able to ensure optimal results , taking into account existing problems in optimal alignment as: (i ) the numerous alignment possibilities of two sequences , ( ii ) the great need for space and memory the machines, ( ii ) processing time to compute the optimal data and (iv ) exponential growth. This study allowed the beginning of the creation of a new logical approach to the global optimum alignment, showing promising results in higher scores with less need for calculations where the mastery of these new techniques can lead to use search of excellent results in the global alignment optimal in large data basesO objetivo deste estudo é entender profundamente as técnicas utilizadas atualmente no alinhamento ótimo de sequências de DNA e analisar a viabilidade da criação de uma nova abordagem lógica capaz de garantir o resultado ótimo, levando em consideração os problemas existentes no alinhamento ótimo como: (i) as inúmeras possibilidades de alinhamento de duas sequências, (ii) a grande necessidade de espaço e memória das máquinas, (ii) o tempo de processamento para computar os dados ótimos e (iv) seu crescimento exponencial. O presente estudo permitiu o início da criação de uma nova abordagem lógica para o alinhamento ótimo global, demonstrando resultados promissores de maiores pontuações com menos necessidades de cálculos, onde o domínio destas novas técnicas pode conduzir à utilização da busca de resultados ótimos no alinhamento global de sequências biológicas em grandes bases de dadosapplication/pdfhttp://tede2.pucsp.br/tede/retrieve/35000/Aline%20Rodrigheri%20Ioste.pdf.jpgporPontifícia Universidade Católica de São PauloPrograma de Estudos Pós-Graduados em Tecnologias da Inteligência e Design DigitalPUC-SPBRFaculdade de Ciências Exatas e TecnologiaDNAAlinhamento ótimo globalAlinhamento de sequênciasAlgoritmosGlobal alignment OoptimalSequence alignmentAlgorithmCNPQ::ENGENHARIASSequências de DNA: uma nova abordagem para o alinhamento ótimoinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_SPinstname:Pontifícia Universidade Católica de São Paulo (PUC-SP)instacron:PUC_SPTEXTAline Rodrigheri Ioste.pdf.txtAline Rodrigheri Ioste.pdf.txtExtracted texttext/plain217805https://repositorio.pucsp.br/xmlui/bitstream/handle/18207/3/Aline%20Rodrigheri%20Ioste.pdf.txt45dbb1b207a856fd1ffa20db86fefc7fMD53ORIGINALAline Rodrigheri Ioste.pdfapplication/pdf3892568https://repositorio.pucsp.br/xmlui/bitstream/handle/18207/1/Aline%20Rodrigheri%20Ioste.pdfd4b25a166ea46de0a3b7edfbfeab6923MD51THUMBNAILAline Rodrigheri Ioste.pdf.jpgAline Rodrigheri Ioste.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1943https://repositorio.pucsp.br/xmlui/bitstream/handle/18207/2/Aline%20Rodrigheri%20Ioste.pdf.jpgcc73c4c239a4c332d642ba1e7c7a9fb2MD52handle/182072023-06-19 10:15:52.12oai:repositorio.pucsp.br:handle/18207Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttps://sapientia.pucsp.br/https://sapientia.pucsp.br/oai/requestbngkatende@pucsp.br||rapassi@pucsp.bropendoar:2023-06-19T13:15:52Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_SP - Pontifícia Universidade Católica de São Paulo (PUC-SP)false |
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