Hibridação e introgressão em zona de contato entre Alouatta guariba clamitans e Alouatta caraya (Primates) no sul do Brasil estudadas com dados genômicos
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2016 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS |
Texto Completo: | http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/7752 |
Resumo: | Contact zones between Alouatta caraya and A. guariba clamitans with mixed groups has been recently documented and hybridization was inferred by the presence of individuals with mixed morphological patterns. Here we sequenced thousands of ultraconserved elements in noninvasive fecal samples within a hybrid zone and from adjacent populations from both species and characterize 3302 polymorphic sites. We found several F1 hybrids in a narrow contact zones, derived from both combinations of parents, but also found evidence of hybrids in the A. g. clamitans zone that likely originated from serial backcrosses of hybrid males with purebred A. g. clamitans females. There is no evidence of any maternal (mtDNA) introgression, and only two female F1 hybrids were found, therefore female F1 hybrids seem inviable or infertile. On the other hand, we found bidirectional introgression of the Y-chromosomes at least tens of kilometers away from both sides of the contact zone, in otherwise apparently purebred individuals, indicating a not recent introgression mediated by males. |
id |
P_RS_3634514dd87341c9c455f07ed9364841 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:tede2.pucrs.br:tede/7752 |
network_acronym_str |
P_RS |
network_name_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS |
repository_id_str |
|
spelling |
Bonatto, Sandro Luishttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783801Y0Mourthé, Italo Martins da Costahttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4777638J6http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4462198T6Trinade, Rhaysa Avila2017-12-01T11:03:32Z2016-09-01http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/7752Contact zones between Alouatta caraya and A. guariba clamitans with mixed groups has been recently documented and hybridization was inferred by the presence of individuals with mixed morphological patterns. Here we sequenced thousands of ultraconserved elements in noninvasive fecal samples within a hybrid zone and from adjacent populations from both species and characterize 3302 polymorphic sites. We found several F1 hybrids in a narrow contact zones, derived from both combinations of parents, but also found evidence of hybrids in the A. g. clamitans zone that likely originated from serial backcrosses of hybrid males with purebred A. g. clamitans females. There is no evidence of any maternal (mtDNA) introgression, and only two female F1 hybrids were found, therefore female F1 hybrids seem inviable or infertile. On the other hand, we found bidirectional introgression of the Y-chromosomes at least tens of kilometers away from both sides of the contact zone, in otherwise apparently purebred individuals, indicating a not recent introgression mediated by males.Zonas de contato, com presença de bandos mistos, entre Alouatta caraya e Alouatta guariba clamitans, tem sido recentemente documentada e a hibridação foi inferida pela presença de indivíduos com padrões morfológicos mistos. Neste estudo nós sequenciamos milhares de regiões ultra conservadas em amostras não-invasivas de fezes dentro de uma zona hibrida e de populações adjacentes das duas espécies e caracterizamos 3302 sítios polimórficos. Nós encontramos híbridos F1 limitados a zona de contato, derivados das duas combinações de parentesco, mas também encontramos evidência de híbridos na zona de A. g. clamitans originados de retrocruzamentos por várias gerações de híbridos com indivíduos provavelmente puros de A. g. clamitans. Não existe evidência de nenhum introgressão maternal (mtDNA), e somente duas fêmeas hibridas F1, então fêmeas hibridas F1 parecem ser inviáveis ou inférteis. Por outro lado, encontramos introgressão bidirecional do cromossomo Y a pelo menos dezenas de quilômetros além da zona de contato em ambos os lados, em indivíduos sem outro sinal de introgressão, sinalizando uma introgressão antiga mediada pelos machos.Submitted by PPG Zoologia (zoologia-pg@pucrs.br) on 2017-11-06T16:56:21Z No. of bitstreams: 1 Rhaysa_Trindade_mestrado.pdf: 2742098 bytes, checksum: 19939cbcdcc6b11f6b5b3f38d6a23609 (MD5)Rejected by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br), reason: Devolvido devido à falta da folha de rosto (página com as principais informações) no arquivo PDF, passando direto da capa para o sumário. on 2017-11-17T11:11:23Z (GMT)Submitted by PPG Zoologia (zoologia-pg@pucrs.br) on 2017-11-22T10:45:36Z No. of bitstreams: 1 RhaysaTrindade_mestrado.pdf: 1690881 bytes, checksum: b3cc134ae387722f8b629ef36bd49b9a (MD5)Approved for entry into archive by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2017-12-01T10:55:11Z (GMT) No. of bitstreams: 1 RhaysaTrindade_mestrado.pdf: 1690881 bytes, checksum: b3cc134ae387722f8b629ef36bd49b9a (MD5)Made available in DSpace on 2017-12-01T11:03:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RhaysaTrindade_mestrado.pdf: 1690881 bytes, checksum: b3cc134ae387722f8b629ef36bd49b9a (MD5) Previous issue date: 2016-09-01Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESapplication/pdfhttp://tede2.pucrs.br:80/tede2/retrieve/170407/DIS_RHAYSA_AVILA_TRINDADE_CONFIDENCIAL.pdf.jpghttp://tede2.pucrs.br:80/tede2/retrieve/173644/DIS_RHAYSA_AVILA_TRINDADE_COMPLETO.pdf.jpgporPontifícia Universidade Católica do Rio Grande do SulPrograma de Pós Graduação em ZoologiaPUCRSBrasilFaculdade de BiociênciasUltraconserved ElementsHibridaçãoDNA FecalBugioSequenciamento de Alto DesempenhoCIENCIAS BIOLOGICAS::ZOOLOGIAHibridação e introgressão em zona de contato entre Alouatta guariba clamitans e Alouatta caraya (Primates) no sul do Brasil estudadas com dados genômicosinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisTrabalho será publicado como artigo ou livro12 meses01/12/201836528317262667714500500600-64826523806012675582075167498588264571info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RSinstname:Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS)instacron:PUC_RSORIGINALDIS_RHAYSA_AVILA_TRINDADE_COMPLETO.pdfDIS_RHAYSA_AVILA_TRINDADE_COMPLETO.pdfapplication/pdf1690881http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/7752/10/DIS_RHAYSA_AVILA_TRINDADE_COMPLETO.pdfb3cc134ae387722f8b629ef36bd49b9aMD510THUMBNAILDIS_RHAYSA_AVILA_TRINDADE_CONFIDENCIAL.pdf.jpgDIS_RHAYSA_AVILA_TRINDADE_CONFIDENCIAL.pdf.jpgimage/jpeg4099http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/7752/6/DIS_RHAYSA_AVILA_TRINDADE_CONFIDENCIAL.pdf.jpgd7bc9598d5d4a6c698c92323d20a2fffMD56DIS_RHAYSA_AVILA_TRINDADE_COMPLETO.pdf.jpgDIS_RHAYSA_AVILA_TRINDADE_COMPLETO.pdf.jpgimage/jpeg5991http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/7752/9/DIS_RHAYSA_AVILA_TRINDADE_COMPLETO.pdf.jpg2803439944cc75ffec8ced5472928667MD59TEXTDIS_RHAYSA_AVILA_TRINDADE_CONFIDENCIAL.pdf.txtDIS_RHAYSA_AVILA_TRINDADE_CONFIDENCIAL.pdf.txttext/plain1136http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/7752/5/DIS_RHAYSA_AVILA_TRINDADE_CONFIDENCIAL.pdf.txtcf63084fc748f4a9dcf7a5b167089587MD55DIS_RHAYSA_AVILA_TRINDADE_COMPLETO.pdf.txtDIS_RHAYSA_AVILA_TRINDADE_COMPLETO.pdf.txttext/plain81685http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/7752/8/DIS_RHAYSA_AVILA_TRINDADE_COMPLETO.pdf.txtd5513aee9e9cc826dcf64014332a3d93MD58LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-8610http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/7752/3/license.txt5a9d6006225b368ef605ba16b4f6d1beMD53tede/77522018-12-07 11:19:08.066oai:tede2.pucrs.br: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Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://tede2.pucrs.br/tede2/PRIhttps://tede2.pucrs.br/oai/requestbiblioteca.central@pucrs.br||opendoar:2018-12-07T13:19:08Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS)false |
dc.title.por.fl_str_mv |
Hibridação e introgressão em zona de contato entre Alouatta guariba clamitans e Alouatta caraya (Primates) no sul do Brasil estudadas com dados genômicos |
title |
Hibridação e introgressão em zona de contato entre Alouatta guariba clamitans e Alouatta caraya (Primates) no sul do Brasil estudadas com dados genômicos |
spellingShingle |
Hibridação e introgressão em zona de contato entre Alouatta guariba clamitans e Alouatta caraya (Primates) no sul do Brasil estudadas com dados genômicos Trinade, Rhaysa Avila Ultraconserved Elements Hibridação DNA Fecal Bugio Sequenciamento de Alto Desempenho CIENCIAS BIOLOGICAS::ZOOLOGIA |
title_short |
Hibridação e introgressão em zona de contato entre Alouatta guariba clamitans e Alouatta caraya (Primates) no sul do Brasil estudadas com dados genômicos |
title_full |
Hibridação e introgressão em zona de contato entre Alouatta guariba clamitans e Alouatta caraya (Primates) no sul do Brasil estudadas com dados genômicos |
title_fullStr |
Hibridação e introgressão em zona de contato entre Alouatta guariba clamitans e Alouatta caraya (Primates) no sul do Brasil estudadas com dados genômicos |
title_full_unstemmed |
Hibridação e introgressão em zona de contato entre Alouatta guariba clamitans e Alouatta caraya (Primates) no sul do Brasil estudadas com dados genômicos |
title_sort |
Hibridação e introgressão em zona de contato entre Alouatta guariba clamitans e Alouatta caraya (Primates) no sul do Brasil estudadas com dados genômicos |
author |
Trinade, Rhaysa Avila |
author_facet |
Trinade, Rhaysa Avila |
author_role |
author |
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
Bonatto, Sandro Luis |
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783801Y0 |
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv |
Mourthé, Italo Martins da Costa |
dc.contributor.advisor-co1Lattes.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4777638J6 |
dc.contributor.authorLattes.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4462198T6 |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Trinade, Rhaysa Avila |
contributor_str_mv |
Bonatto, Sandro Luis Mourthé, Italo Martins da Costa |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Ultraconserved Elements Hibridação DNA Fecal Bugio Sequenciamento de Alto Desempenho |
topic |
Ultraconserved Elements Hibridação DNA Fecal Bugio Sequenciamento de Alto Desempenho CIENCIAS BIOLOGICAS::ZOOLOGIA |
dc.subject.cnpq.fl_str_mv |
CIENCIAS BIOLOGICAS::ZOOLOGIA |
description |
Contact zones between Alouatta caraya and A. guariba clamitans with mixed groups has been recently documented and hybridization was inferred by the presence of individuals with mixed morphological patterns. Here we sequenced thousands of ultraconserved elements in noninvasive fecal samples within a hybrid zone and from adjacent populations from both species and characterize 3302 polymorphic sites. We found several F1 hybrids in a narrow contact zones, derived from both combinations of parents, but also found evidence of hybrids in the A. g. clamitans zone that likely originated from serial backcrosses of hybrid males with purebred A. g. clamitans females. There is no evidence of any maternal (mtDNA) introgression, and only two female F1 hybrids were found, therefore female F1 hybrids seem inviable or infertile. On the other hand, we found bidirectional introgression of the Y-chromosomes at least tens of kilometers away from both sides of the contact zone, in otherwise apparently purebred individuals, indicating a not recent introgression mediated by males. |
publishDate |
2016 |
dc.date.issued.fl_str_mv |
2016-09-01 |
dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2017-12-01T11:03:32Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
format |
masterThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/7752 |
url |
http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/7752 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.relation.department.fl_str_mv |
36528317262667714 |
dc.relation.confidence.fl_str_mv |
500 500 600 |
dc.relation.cnpq.fl_str_mv |
-6482652380601267558 |
dc.relation.sponsorship.fl_str_mv |
2075167498588264571 |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul |
dc.publisher.program.fl_str_mv |
Programa de Pós Graduação em Zoologia |
dc.publisher.initials.fl_str_mv |
PUCRS |
dc.publisher.country.fl_str_mv |
Brasil |
dc.publisher.department.fl_str_mv |
Faculdade de Biociências |
publisher.none.fl_str_mv |
Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS instname:Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS) instacron:PUC_RS |
instname_str |
Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS) |
instacron_str |
PUC_RS |
institution |
PUC_RS |
reponame_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS |
collection |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS |
bitstream.url.fl_str_mv |
http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/7752/10/DIS_RHAYSA_AVILA_TRINDADE_COMPLETO.pdf http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/7752/6/DIS_RHAYSA_AVILA_TRINDADE_CONFIDENCIAL.pdf.jpg http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/7752/9/DIS_RHAYSA_AVILA_TRINDADE_COMPLETO.pdf.jpg http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/7752/5/DIS_RHAYSA_AVILA_TRINDADE_CONFIDENCIAL.pdf.txt http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/7752/8/DIS_RHAYSA_AVILA_TRINDADE_COMPLETO.pdf.txt http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/7752/3/license.txt |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
b3cc134ae387722f8b629ef36bd49b9a d7bc9598d5d4a6c698c92323d20a2fff 2803439944cc75ffec8ced5472928667 cf63084fc748f4a9dcf7a5b167089587 d5513aee9e9cc826dcf64014332a3d93 5a9d6006225b368ef605ba16b4f6d1be |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS) |
repository.mail.fl_str_mv |
biblioteca.central@pucrs.br|| |
_version_ |
1799765329545527296 |