The role of SMN protein in microRNA biogenesis
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2013 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | eng |
Título da fonte: | Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/10451/10821 |
Resumo: | Tese de mestrado. Biologia (Biologia Molecular e Genética). Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2013 |
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The role of SMN protein in microRNA biogenesisBiologia molecularAtrofia muscular espinalExpressão génicaTeses de mestrado - 2013Tese de mestrado. Biologia (Biologia Molecular e Genética). Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2013A Atrofia Muscular Espinal (AME) é uma doença neuromuscular caracterizada pela degeneração dos neurónios alfa motores inferiores, atrofia muscular e perda de função motora. AME é causada por uma mutação homozigótica ou deleção no gene Survival Motor Neuron-1 (SMN1). No entanto, é desconhecida ainda a razão pela qual a perda de função da proteína SMN afecta especificamente os neurónios motores inferiores. Os microRNAs (miRNA) são uma categoria de RNA não codificante expressos em grande quantidade no sistema nervoso. Foi demonstrado que desregulações na expressão dos miRNAs estão associadas a algumas doenças neurológicas, incluindo AME. Especificamente, detectámos um aumento na expressão do microRNA-183 (miR-183) em neurónios com expressão nula da proteína SMN. Desta forma, como objectivo de estudo pretendemos descobrir quais os mecanismos que estão envolvidos na desregulação da expressão dos microRNAs causada pela perda de SMN. Uma vez estando o complexo SMN envolvido no processamento de RNA, foi posto em questão um possível envolvimento deste complexo na regulação da expressão dos microRNAs. Para testar esta hipótese, analisámos o processo de biogénese dos miRNAs desde a sua transcrição primária até aos restantes passos do processamento de RNA, em medula espinal de um modelo animal de AME. A análise de expressão feita ao cluster miR-183~96~182 mostrou uma desregulação na regulação do processo de biogénese deste cluster em neurónios onde a proteína SMN não é expressa. Da mesma forma, verificámos uma desregulação na expressão dos genes envolvidos na biogénese, estabilidade e decaimento dos miRNAs em medula espinhal de um modelo animal de AME. Assim, os resultados obtidos confirmam que a expressão dos miRNAs é alterada devido a níveis deficientes da proteína SMN.Spinal muscular atrophy (SMA) is a neuromuscular disease caused by degeneration of alpha lower motor neurons, muscle atrophy and loss of motor function. SMA occurs when SMN1 (survival motor neuron-1) is homozygously mutated or deleted. However, it remains unclear how deficiency of SMN function mainly affects lower motor neurons. microRNA (miRNA) are a sub-set of non-coding RNAs highly expressed in the nervous system. It has been reported that dysregulation of miRNA expression is associated to several neurological diseases including SMA. We found that expression of miR-183 is elevated in SMN deficient neurons. Therefore, we sought to uncover the mechanisms underlying the dysregulation of miRNA expression caused by SMN loss. Since the SMN complex plays a role in RNA processing, we hypothesize that this complex is involved in regulation of miRNA expression. To test our hypothesis, we analyzed miRNA biogenesis from primary transcript to down-stream steps of RNA processing in spinal cord of SMA mouse model. Analysis of the expression of miR-183~96~182 cluster suggests that the biogenesis process for this cluster is dysregulated in SMN deficient neurons. We found that the genes involved in miRNA biogenesis, stability and decay pathways are dysregulated in spinal cord of SMA mouse model. Our findings suggest that SMN deficiency causes dysregulation of miRNA biogenesis and decay pathways.Duarte, Júlio António Bargão, 1957-Kye, Min JeongRepositório da Universidade de LisboaGonçalves, Inês do Carmo Gil, 1989-2014-04-07T11:15:29Z20132013-01-01T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10451/10821TID:201326183enginfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2023-11-08T15:56:37Zoai:repositorio.ul.pt:10451/10821Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-19T21:34:43.832589Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse |
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