Uma abordagem metabolómica no diagnóstico da tuberculose
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2016 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/10362/20060 |
Resumo: | Este trabalho teve como foco principal a identificação de potenciais biomarcadores para o diagnóstico da tuberculose, utilizando uma abordagem metabolómica. Estudos de metabolómica utilizando amostras de biofluidos são hoje em dia muito comuns na descoberta de biomarcadores para diagnóstico de doenças, além de auxiliarem na compreensão dos seus mecanismos patológicos. A tuberculose tornou-se uma doença emergente a nível mundial, sendo uma das principais causas de morte. Mycobacterium tuberculosis é o agente patogénico responsável pela tuberculose. Neste sentido, foram adquiridos espectros de 1H NMR de amostras de soro sanguíneo de indivíduos saudáveis e de pacientes com tuberculose, utilizando um espectrómetro de NMR de 800 MHz. A aquisição de espectros foi realizada após a otimização do protocolo de preparação de amostras de soro. Para isso, verificou-se qual a melhor sequência de pulsos a ser utilizada (CPMG ou NOESY), qual o efeito da ultrafiltração no perfil dos espectros e determinou-se a estabilidade da amostra. A abordagem metabolómica utilizada neste estudo envolveu uma análise do perfil metabólico e uma análise fingerprinting das amostras de soro. A identificação e quantificação dos metabolitos foi efetuada com o software Chenomx NMR Suite 8.1. A identificação foi auxiliada por bases de dados e espectros de NMR bidimensionais. Após a identificação/quantificação dos metabolitos procedeu-se á análise estatística. Para os dados obtidos a partir da análise do perfil metabólico foi realizada uma análise uni e multivariada dos dados. No caso da análise fingerprinting apenas se procedeu à realização da análise multivariada. Os resultados das duas análises foram similares, identificando os mesmos metabolitos responsáveis pela discriminação dos grupos experimentais (controlos e doentes). Foram encontrados em maiores concentrações no soro de indivíduos com tuberculose intermediários de nucleosídeos (hipoxantina e inosina), glícidos (manose e glucose), aminoácidos (ornitina, glutamato, serina e aspartato) e ácidos orgânicos (lactato). Já aminoácidos como a asparagina, a metionina, a cisteína, a lisina e a π-metilhistidina, e ácidos orgânicos, como o 3-hidroxisobutirato e o citrato, foram encontrados em menores concentrações no soro dos indivíduos com tuberculose. A partir destes resultados verificou-se que os principais processos alterados com reflexo nos níveis metabólicos do soro de doentes, estavam relacionados com a biossíntese de proteínas, com a reciclagem de amónia, com o metabolismo do aspartato e com o metabolismo da metionina. Os resultados obtidos neste estudo corroboram outros estudos já publicados |
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Uma abordagem metabolómica no diagnóstico da tuberculoseCiências biomédicasBiologia molecularTuberculoseMycobacterium tuberculosisMetabolómicaNMRDomínio/Área Científica::Ciências MédicasEste trabalho teve como foco principal a identificação de potenciais biomarcadores para o diagnóstico da tuberculose, utilizando uma abordagem metabolómica. Estudos de metabolómica utilizando amostras de biofluidos são hoje em dia muito comuns na descoberta de biomarcadores para diagnóstico de doenças, além de auxiliarem na compreensão dos seus mecanismos patológicos. A tuberculose tornou-se uma doença emergente a nível mundial, sendo uma das principais causas de morte. Mycobacterium tuberculosis é o agente patogénico responsável pela tuberculose. Neste sentido, foram adquiridos espectros de 1H NMR de amostras de soro sanguíneo de indivíduos saudáveis e de pacientes com tuberculose, utilizando um espectrómetro de NMR de 800 MHz. A aquisição de espectros foi realizada após a otimização do protocolo de preparação de amostras de soro. Para isso, verificou-se qual a melhor sequência de pulsos a ser utilizada (CPMG ou NOESY), qual o efeito da ultrafiltração no perfil dos espectros e determinou-se a estabilidade da amostra. A abordagem metabolómica utilizada neste estudo envolveu uma análise do perfil metabólico e uma análise fingerprinting das amostras de soro. A identificação e quantificação dos metabolitos foi efetuada com o software Chenomx NMR Suite 8.1. A identificação foi auxiliada por bases de dados e espectros de NMR bidimensionais. Após a identificação/quantificação dos metabolitos procedeu-se á análise estatística. Para os dados obtidos a partir da análise do perfil metabólico foi realizada uma análise uni e multivariada dos dados. No caso da análise fingerprinting apenas se procedeu à realização da análise multivariada. Os resultados das duas análises foram similares, identificando os mesmos metabolitos responsáveis pela discriminação dos grupos experimentais (controlos e doentes). Foram encontrados em maiores concentrações no soro de indivíduos com tuberculose intermediários de nucleosídeos (hipoxantina e inosina), glícidos (manose e glucose), aminoácidos (ornitina, glutamato, serina e aspartato) e ácidos orgânicos (lactato). Já aminoácidos como a asparagina, a metionina, a cisteína, a lisina e a π-metilhistidina, e ácidos orgânicos, como o 3-hidroxisobutirato e o citrato, foram encontrados em menores concentrações no soro dos indivíduos com tuberculose. A partir destes resultados verificou-se que os principais processos alterados com reflexo nos níveis metabólicos do soro de doentes, estavam relacionados com a biossíntese de proteínas, com a reciclagem de amónia, com o metabolismo do aspartato e com o metabolismo da metionina. Os resultados obtidos neste estudo corroboram outros estudos já publicadosThis work had as major focus the identification of potential biomarkers for tuberculosis diagnosis, using a metabolomic approach. Metabolomics studies using biofluids samples are nowadays very commons in the discovery of biomarkers for diseases diagnosis, in addition to assist in the compression of their mechanisms of pathogenesis. Tuberculosis has become an emerging disease worldwide and is a major cause of death. Mycobacterium tuberculosis is the pathogen responsible for tuberculosis. In this study were acquired 1H NMR spectra of blood serum samples of healthy subjects and of patients with tuberculosis, using a 800 MHz NMR spectrometer. The spectra acquisition was performed after optimization of serum samples preparation protocol. For this, it was found that the better spectra type to be used is NOESY and were evaluated the effect of ultrafiltration on the spectra profile and determined the sample stability. The metabolomics approach used in this study involves a metabolic profiling and a fingerprinting analysis of the obtained NMR data. The identification and quantification of metabolites was performed with Chenomx NMR Suite 8.1 software. The identification was assist using databases and two-dimensional NMR spectra. After metabolites identification and quantification, we proceeded to the statistical analysis. For the results obtained with the metabolic profiling method both uni- and multivariate analysis were performed. On behalf of the fingerprinting method results were only evaluated by multivariate analysis The results of both analysis were similar, identifying the same metabolites responsible for discrimination between experimental groups (controls and patients). In serum of TB-infected individuals were found in higher concentrations nucleosides intermediaries (hypoxanthine and inosine), carbohydrates (mannose and glucose), amino acids (ornithine, glutamate, serine and aspartate) and organic acids (lactate). Amino acids as asparagine, methionine, cysteine, lysine and π-methylhistidine and organic acids such as 3-hydroxyisobutyrate and citrate were found at lower concentrations in the serum of patients. From these results, it was found that the major metabolic changes reflected in the serum of patients were related with protein biosynthesis, ammonia recycling aspartate and methionine metabolism. These results support other studies already published.Instituto de Higiene e Medicina TropicalCOELHO, Ana VarelaMATZAPETAKIS, ManolisRUNCONDE, Ricardo Diogo Alves2018-12-21T01:30:17Z201620162016-01-01T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10362/20060TID:201609835porinfo:eu-repo/semantics/embargoedAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2024-03-11T04:03:03Zoai:run.unl.pt:10362/20060Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-20T03:25:55.891014Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse |
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