Uso da metabolômica na predição de perfis de susceptibilidade de Mycobacterium tuberculosis a drogas de primeira e segunda linha

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Rêgo, Amanda Mendes
Data de Publicação: 2018
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/37709
Resumo: A tuberculose é uma doença infecciosa de extrema importância, sendo uma das principais causas de morte provocadas por um único agente infeccioso em todo o mundo. Apesar disso, a tuberculose pode ser facilmente tratada através da terapia com drogas antimicobacterianas. Entretanto, cepas resistentes a antibióticos são cada vez mais comuns, gerando falhas no tratamento e dificultando o controle da doença. Dessa forma, a determinação de perfis de susceptibilidade a drogas é rotineiramente realizada em laboratórios de diagnóstico. Isso permite a escolha de drogas ideais para o tratamento, tendo em vista a susceptibilidade da cepa que infectou um dado paciente. Porém, a determinação de perfis de susceptibilidade leva tempo, e muitas vezes o tratamento precisa ser iniciado antes que o resultado dos testes seja obtido. Isso faz com que indivíduos infectados acabem sendo tratados com antibióticos inapropriados, resultando em falhas no tratamento e propiciando o desenvolvimento de resistência. Por isso, o desenvolvimento de novas técnicas que permitam a determinação rápida de perfis de susceptibilidade é imperativo. Este estudo teve como objetivo caracterizar os perfis metabólicos de cepas de Mycobacterium tuberculosis sensíveis a drogas, resistente a múltiplas drogas (MDR) e extensivamente resistente a drogas (XDR) através de metabolômica por espectrometria de massas de alta vazão. O objetivo deste estudo foi determinar se a avaliação destes perfis metabólicos poderia ser utilizada como uma alternativa aos métodos tradicionais de determinação de perfis de susceptibilidade. Tal proposta partiu do princípio de que cepas com diferentes níveis de resistência são metabolicamente distintas, permitindo assim que biomarcadores associados a padrões de resistência a drogas sejam identificados e utilizados como ferramentas diagnósticas Nossos resultados demonstraram que perfis de susceptibilidade a drogas de M. tuberculosis podem ser preditos através das análises metabólicas aqui descritas, sobretudo quando amostras com perfis de susceptibilidade conhecidos são utilizadas como controles em paralelo. Além disso, foi possível observar que cepas sensíveis apresentaram em seus perfis metabólicos níveis mais elevados de ácido pantotênico e biotina do que cepas resistentes; estas moléculas estão diretamente relacionadas com a síntese de ácidos graxos. Além destas, outras moléculas, como os aminoácidos prolina e isoleucina, também foram encontradas em níveis diferenciados entre cepas sensíveis e resistentes. Tais metabólitos, por serem estáveis e de identificação relativamente simples, são importantes candidatos a biomarcadores. Assim, nosso estudo representa um avanço significativo no atual entendimento do efeito da resistência a drogas no metabolismo bacteriano, além de apresentar possíveis trajetos a serem seguidos para a confirmação de marcadores específicos de resistência a drogas e o desenvolvimento de métodos diagnósticos baseados nestas informações. Os achados deste estudo destacam também a importância do metabolismo dos ácidos graxos e ácidos micólicos, ambos componentes estruturais da parede celular e envolvidos na resposta ao estresse oxidativo. Além disso, ressaltamos estes metabólitos como possíveis marcadores de resistência de M. tuberculosis. Portanto, estes resultados e abrem um leque de possíveis empregos de técnicas de metabolômica como ferramentas para a detecção de resistência a drogas através destas moléculas. Futuramente, os resultados aqui obtidos poderão subsidiar o desenvolvimento de métodos para a detecção rápida da resistência a drogas, contribuindo para a escolha do tratamento adequado para cada paciente e para o aumento do sucesso no controle da tuberculose.
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Isso permite a escolha de drogas ideais para o tratamento, tendo em vista a susceptibilidade da cepa que infectou um dado paciente. Porém, a determinação de perfis de susceptibilidade leva tempo, e muitas vezes o tratamento precisa ser iniciado antes que o resultado dos testes seja obtido. Isso faz com que indivíduos infectados acabem sendo tratados com antibióticos inapropriados, resultando em falhas no tratamento e propiciando o desenvolvimento de resistência. Por isso, o desenvolvimento de novas técnicas que permitam a determinação rápida de perfis de susceptibilidade é imperativo. Este estudo teve como objetivo caracterizar os perfis metabólicos de cepas de Mycobacterium tuberculosis sensíveis a drogas, resistente a múltiplas drogas (MDR) e extensivamente resistente a drogas (XDR) através de metabolômica por espectrometria de massas de alta vazão. O objetivo deste estudo foi determinar se a avaliação destes perfis metabólicos poderia ser utilizada como uma alternativa aos métodos tradicionais de determinação de perfis de susceptibilidade. Tal proposta partiu do princípio de que cepas com diferentes níveis de resistência são metabolicamente distintas, permitindo assim que biomarcadores associados a padrões de resistência a drogas sejam identificados e utilizados como ferramentas diagnósticas Nossos resultados demonstraram que perfis de susceptibilidade a drogas de M. tuberculosis podem ser preditos através das análises metabólicas aqui descritas, sobretudo quando amostras com perfis de susceptibilidade conhecidos são utilizadas como controles em paralelo. Além disso, foi possível observar que cepas sensíveis apresentaram em seus perfis metabólicos níveis mais elevados de ácido pantotênico e biotina do que cepas resistentes; estas moléculas estão diretamente relacionadas com a síntese de ácidos graxos. Além destas, outras moléculas, como os aminoácidos prolina e isoleucina, também foram encontradas em níveis diferenciados entre cepas sensíveis e resistentes. Tais metabólitos, por serem estáveis e de identificação relativamente simples, são importantes candidatos a biomarcadores. Assim, nosso estudo representa um avanço significativo no atual entendimento do efeito da resistência a drogas no metabolismo bacteriano, além de apresentar possíveis trajetos a serem seguidos para a confirmação de marcadores específicos de resistência a drogas e o desenvolvimento de métodos diagnósticos baseados nestas informações. Os achados deste estudo destacam também a importância do metabolismo dos ácidos graxos e ácidos micólicos, ambos componentes estruturais da parede celular e envolvidos na resposta ao estresse oxidativo. Além disso, ressaltamos estes metabólitos como possíveis marcadores de resistência de M. tuberculosis. Portanto, estes resultados e abrem um leque de possíveis empregos de técnicas de metabolômica como ferramentas para a detecção de resistência a drogas através destas moléculas. Futuramente, os resultados aqui obtidos poderão subsidiar o desenvolvimento de métodos para a detecção rápida da resistência a drogas, contribuindo para a escolha do tratamento adequado para cada paciente e para o aumento do sucesso no controle da tuberculose.Tuberculosis is a high medical relevance infectious disease and is one of the leading causes of death provoked by a single infectious agent worldwide. Despite this, tuberculosis can be easily treated through antimycobacterial drug therapy. However, resistance to antibiotics is becoming increasingly common, leading to treatment failures and making the control of this disease challenging. Therefore, the determination of drug susceptibility profiles is routinely performed in diagnostic laboratories. This allows clinicians to make informed decisions when choosing a course of treatment, taking into account the drug susceptibility profile of the strain causing infection in a particular patient. However, the determination of susceptibility profiles takes time, and treatment often needs to be initiated before test results are available. This may result in patients being treated with inappropriate antibiotics, leading to treatment failures and the development of drug resistance. For that reason, the development of new techniques that can quickly determine drug susceptibility profiles of Mycobacterium tuberculosis is imperative. This study aimed to characterize the metabolic alterations of drug-susceptible, multidrugresistant (MDR) and extensively drug-resistant (XDR) M. tuberculosis strains by metabolomics using high-throughput mass spectrometry, in order to determine if the analysis of metabolic profiles can be used as an alternative to traditional methods of drug susceptibility testing. This proposal is based on the principle that strains with different levels of resistance are metabolically distinct, thus allowing metabolic biomarkers to be associated with patterns of resistance and used as diagnostic tools. Our findings have demonstrated that resistance profiles of M. tuberculosis can be predicted through the metabolic analyses described herein, provided that samples with known susceptibility profiles are used as control. In addition, it was observed that susceptible strains showed higher levels of pantothenic acid and biotin in their metabolic profiles when compared to resistant strains. It is important to note that both these molecules are directly involved in fatty acid synthesis, an important facet of M. tuberculosis metabolism. In addition to the molecules described above, two amino acids, proline and isoleucine, were also found in different levels when comparing susceptible and resistant strains. Due to their stability and the relative simplicity of their identification, these molecules are important biomarker candidates. Thus, our study represents a significant advance in the current understanding of the effect of antibiotic resistance on bacterial metabolism and opens new avenues for the detection and confirmation of drug resistance-specific biomarkers. These results are likely to be used in the future for the development of diagnostic tools for the detection of drug resistance in M. tuberculosis. In addition, our findings highlight the importance of the metabolism of fatty acids and mycolic acids, critical for cell wall structure and response to oxidative stress, as potential markers of M. tuberculosis drug resistance. Also, these studies provide a proof of concept that metabolomics techniques can be employed as useful tools for the detection of drug resistance through biomarkers. In the future, the results presented herein may support the development of tools for the rapid detection of resistance, contributing to better informed decisions by health care providers, and the choice of appropriate treatments for each patient, aiding in the success of tuberculosis control measures.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porMycobacterium tuberculosisPerfil metabólicoResistência à fármacosEspectrometria de massasMetabolômicaMycobacterium tuberculosisResistência a medicamentosEspectrometria de massasMetabolômicaUso da metabolômica na predição de perfis de susceptibilidade de Mycobacterium tuberculosis a drogas de primeira e segunda linhainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2018Instituto Oswaldo CruzFundação Oswaldo CruzRio de JaneiroPrograma de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecularinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/37709/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINALamanda_rego_ioc_mest_2018.pdfamanda_rego_ioc_mest_2018.pdfapplication/pdf5509222https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/37709/2/amanda_rego_ioc_mest_2018.pdfc5d6f4b91093c0fe95de0f101487f4b2MD52icict/377092019-12-10 22:57:53.103oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352019-12-11T01:57:53Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false
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