Potential of FTIR-spectroscopy for drugs screening against Helicobacter pylori
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2020 |
Outros Autores: | |
Tipo de documento: | Artigo |
Idioma: | eng |
Título da fonte: | Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/10400.21/12488 |
Resumo: | Este trabalho foi financiado pelo Concurso Anual para Projetos de Investigação, Desenvolvimento, Inovação e Criação Artística (IDI&CA) 2016 do Instituto Politécnico de Lisboa. Código de referência IPL/2018/RENALPROG_ISEL |
id |
RCAP_22d301aa2d98e51cb91a78ec38f4a1b6 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repositorio.ipl.pt:10400.21/12488 |
network_acronym_str |
RCAP |
network_name_str |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
repository_id_str |
7160 |
spelling |
Potential of FTIR-spectroscopy for drugs screening against Helicobacter pyloriDrugs screeningFourier-transform infrared (FTIR) spectroscopyHelicobacter pyloriHigh-throughput screeningEste trabalho foi financiado pelo Concurso Anual para Projetos de Investigação, Desenvolvimento, Inovação e Criação Artística (IDI&CA) 2016 do Instituto Politécnico de Lisboa. Código de referência IPL/2018/RENALPROG_ISELEste trabalho foi financiado pelo Concurso Anual para Projetos de Investigação, Desenvolvimento, Inovação e Criação Artística (IDI&CA) 2016 do Instituto Politécnico de Lisboa. Código de referência IPL/2017/DrugsPlatf/ISELEste trabalho foi financiado pelo Concurso Anual para Projetos de Investigação, Desenvolvimento, Inovação e Criação Artística (IDI&CA) 2016 do Instituto Politécnico de Lisboa. Código de referência IPL/2020/NephroMD/ISELHelicobacter pylori colonizes the human stomach of half of the world’s population. The infection if not treated, persists through life, leading to chronic gastric inflammation, that may progress to severe diseases as peptic ulcer, gastric adenocarcinoma, and mucosa-associated lymphoid tissue lymphoma. The first line of treatment, based on 7 to 21 days of two antibiotics associated with a proton pump inhibitor, is, however, already failing most due to patient non-compliance that leads to antibiotic resistance. It is, therefore, urgent to screen for new and more efficient antimicrobials against this bacterium. In this work, Fourier Transform Infrared (FTIR) spectroscopy was evaluated to screen new drugs against H. pylori, in rapid (between 1 to 6 h), and high-throughput mode and based on a microliter volume processes in relation to the agar dilution method. The reference H. pylori strains 26,695 and J99, were evaluated against a peptide-based antimicrobial and the clinical antibiotic clarithromycin, respectively. After optimization of the assay conditions, as the composition of the incubation mixture, the time of incubation, and spectral pre-processing, it was possible to reproducibly observe the effect of the drug on the bacterial molecular fingerprint as pointed by the spectra principal component analysis. The spectra, obtained from both reference strains, after its incubation with drugs concentrations lower than the MIC, presented peak ratios statistically different (p < 0.05) in relation to the bacteria incubated with drugs concentrations equal or higher to the MIC. It was possible to develop a partial least square regression model, enabling to predict from spectra of both bacteria strains, the drug concentration on the assay, with a high correlation coefficient between predicted and experimental data (0.91) and root square error of 40% of the minimum inhibitory concentration. All this points to the high potential of the technique for drug screening against this fastidious growth bacterium.MDPIRCIPLSampaio, PedroCalado, Cecília2020-12-16T12:23:44Z2020-12-122020-12-12T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10400.21/12488engSAMPAIO, Pedro S.; CALADO, Cecília R. C. – Potential of FTIR-spectroscopy for drugs screening against Helicobacter pylori. Antibiotics. ISSN 2079-6382. Vol. 9, N.º 12 (2020), pp. 1-152079-638210.3390/antibiotics9120897info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2023-08-03T10:05:30Zoai:repositorio.ipl.pt:10400.21/12488Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-19T20:20:34.404435Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse |
dc.title.none.fl_str_mv |
Potential of FTIR-spectroscopy for drugs screening against Helicobacter pylori |
title |
Potential of FTIR-spectroscopy for drugs screening against Helicobacter pylori |
spellingShingle |
Potential of FTIR-spectroscopy for drugs screening against Helicobacter pylori Sampaio, Pedro Drugs screening Fourier-transform infrared (FTIR) spectroscopy Helicobacter pylori High-throughput screening |
title_short |
Potential of FTIR-spectroscopy for drugs screening against Helicobacter pylori |
title_full |
Potential of FTIR-spectroscopy for drugs screening against Helicobacter pylori |
title_fullStr |
Potential of FTIR-spectroscopy for drugs screening against Helicobacter pylori |
title_full_unstemmed |
Potential of FTIR-spectroscopy for drugs screening against Helicobacter pylori |
title_sort |
Potential of FTIR-spectroscopy for drugs screening against Helicobacter pylori |
author |
Sampaio, Pedro |
author_facet |
Sampaio, Pedro Calado, Cecília |
author_role |
author |
author2 |
Calado, Cecília |
author2_role |
author |
dc.contributor.none.fl_str_mv |
RCIPL |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Sampaio, Pedro Calado, Cecília |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Drugs screening Fourier-transform infrared (FTIR) spectroscopy Helicobacter pylori High-throughput screening |
topic |
Drugs screening Fourier-transform infrared (FTIR) spectroscopy Helicobacter pylori High-throughput screening |
description |
Este trabalho foi financiado pelo Concurso Anual para Projetos de Investigação, Desenvolvimento, Inovação e Criação Artística (IDI&CA) 2016 do Instituto Politécnico de Lisboa. Código de referência IPL/2018/RENALPROG_ISEL |
publishDate |
2020 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2020-12-16T12:23:44Z 2020-12-12 2020-12-12T00:00:00Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/article |
format |
article |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://hdl.handle.net/10400.21/12488 |
url |
http://hdl.handle.net/10400.21/12488 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
eng |
language |
eng |
dc.relation.none.fl_str_mv |
SAMPAIO, Pedro S.; CALADO, Cecília R. C. – Potential of FTIR-spectroscopy for drugs screening against Helicobacter pylori. Antibiotics. ISSN 2079-6382. Vol. 9, N.º 12 (2020), pp. 1-15 2079-6382 10.3390/antibiotics9120897 |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
MDPI |
publisher.none.fl_str_mv |
MDPI |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação instacron:RCAAP |
instname_str |
Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação |
instacron_str |
RCAAP |
institution |
RCAAP |
reponame_str |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
collection |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação |
repository.mail.fl_str_mv |
|
_version_ |
1799133474468134912 |