Determinantes genéticos da infeção na febre Q crónica

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Castro, Liliana Alexandra Marques de
Data de Publicação: 2022
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10400.21/14955
Resumo: Mestrado em Tecnologias Moleculares em Saúde
id RCAP_27d002c09baa8f7a6b9638c708007fd2
oai_identifier_str oai:repositorio.ipl.pt:10400.21/14955
network_acronym_str RCAP
network_name_str Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
repository_id_str 7160
spelling Determinantes genéticos da infeção na febre Q crónicaFebre Q crónicaCGASSNPsNGSSequenciação SangerChronic Q feverSanger sequencingCandidate gene association studiesSingle nucleotide polymorphismNext generation sequencingMestrado em Tecnologias Moleculares em SaúdeA febre Q é uma zoonose de distribuição mundial causada pela bactéria Coxiella burnetii. A doença, que resulta numa elevada morbilidade e mortalidade, pode manifestar-se na forma aguda autolimitada ou na forma crónica de evolução grave. Considera-se que uma resposta imunitária deficitária poderá contribuir para o desenvolvimento da febre Q crónica. O presente estudo procurou identificar, na população portuguesa, variantes genéticas dos principais genes envolvidos na resposta imune à infeção que pudessem estar associadas a um desenvolvimento de febre Q crónica. Recorremos à análise retrospetiva caso-controlo usando métodos de associação genótipo-fenótipo com base em genes candidatos (Candidate gene association studies - CGAS) através de um estudo exploratório e de um estudo réplica. No primeiro, utilizamos o NGS para sequenciar regiões codificantes e não codificantes nos genes IL12RB1, IFNGR1, IFNGR2, NRAMP1, TLR1, TLR2 e TIMP1. No segundo, foram genotipados, por sequenciação Sanger, variantes nos genes P2X7R e IFNG. As amostras incluíam 17 casos com doença cronica, 43 com doença aguda e 34 amostras de conveniência (saudáveis). SNPs com significância estatística resistindo à correção de Bonferroni foram identificados apenas no gene IFNGR2. A análise dos padrões de desequilíbrio de ligação revelou ainda outras variantes em associação. Concluindo, a estratégia adotada revelou-se adequada para a identificação de determinantes genéticos da infeção na febre Q crónica. Contudo, será imprescindível avançar com estudos funcionais de modo a esclarecer o papel das variantes associadas com a febre Q crónica.ABSTRACT - Q fever is a zoonosis of worldwide distribution caused by the bacterium Coxiella burnetii. The disease, resulting in high morbidity and mortality, presents itself in the self-limiting acute form or in the chronic form, with severe implications. A defective immune response may contribute to the development of chronic Q fever. The present study aimed to identify, in the Portuguese population, genetic variants in the principal genes of the immune response to infection that could be associated with the development of chronic Q fever. A retrospective case-control candidate gene association study (CGAS) was used for genotype-phenotype association analysis in an exploratory study and in a replication study. In the first, we used NGS to sequence coding and non-coding regions in the IL12RB1, IFNGR1, IFNGR2, NRAMP1, TLR1, TLR2, and TIMP1 genes. In the second, the genes P2X7R and IFNG were genotyped using Sanger sequencing. The study sample included 17 chronic disease cases, 43 acute cases, and 34 convenient samples (healthy). SNPs with statistical significance resisting the Bonferroni correction were identified only in the IFNGR2 gene. Linkage disequilibrium analysis revealed other variants in the association. In conclusion, our strategy was found to be suitable for the identification of genetic determinants of infection in chronic Q fever. However, functional studies are necessary in order to elucidate the role of the associated variants with chronic Q fever.Instituto Politécnico de Lisboa, Escola Superior de Tecnologia da Saúde de LisboaDavid, SusanaGomes, Anita Q.RCIPLCastro, Liliana Alexandra Marques de20222024-09-08T00:00:00Z2022-01-01T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10400.21/14955TID:203035801porCastro LA. Determinantes genéticos da infeção na febre Q crónica [dissertation]. Lisboa: Escola Superior de Tecnologia da Saúde de Lisboa/Instituto Politécnico de Lisboa; 2022.info:eu-repo/semantics/embargoedAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2023-08-03T10:11:48Zoai:repositorio.ipl.pt:10400.21/14955Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-19T20:22:42.721820Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse
dc.title.none.fl_str_mv Determinantes genéticos da infeção na febre Q crónica
title Determinantes genéticos da infeção na febre Q crónica
spellingShingle Determinantes genéticos da infeção na febre Q crónica
Castro, Liliana Alexandra Marques de
Febre Q crónica
CGAS
SNPs
NGS
Sequenciação Sanger
Chronic Q fever
Sanger sequencing
Candidate gene association studies
Single nucleotide polymorphism
Next generation sequencing
title_short Determinantes genéticos da infeção na febre Q crónica
title_full Determinantes genéticos da infeção na febre Q crónica
title_fullStr Determinantes genéticos da infeção na febre Q crónica
title_full_unstemmed Determinantes genéticos da infeção na febre Q crónica
title_sort Determinantes genéticos da infeção na febre Q crónica
author Castro, Liliana Alexandra Marques de
author_facet Castro, Liliana Alexandra Marques de
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv David, Susana
Gomes, Anita Q.
RCIPL
dc.contributor.author.fl_str_mv Castro, Liliana Alexandra Marques de
dc.subject.por.fl_str_mv Febre Q crónica
CGAS
SNPs
NGS
Sequenciação Sanger
Chronic Q fever
Sanger sequencing
Candidate gene association studies
Single nucleotide polymorphism
Next generation sequencing
topic Febre Q crónica
CGAS
SNPs
NGS
Sequenciação Sanger
Chronic Q fever
Sanger sequencing
Candidate gene association studies
Single nucleotide polymorphism
Next generation sequencing
description Mestrado em Tecnologias Moleculares em Saúde
publishDate 2022
dc.date.none.fl_str_mv 2022
2022-01-01T00:00:00Z
2024-09-08T00:00:00Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10400.21/14955
TID:203035801
url http://hdl.handle.net/10400.21/14955
identifier_str_mv TID:203035801
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv Castro LA. Determinantes genéticos da infeção na febre Q crónica [dissertation]. Lisboa: Escola Superior de Tecnologia da Saúde de Lisboa/Instituto Politécnico de Lisboa; 2022.
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/embargoedAccess
eu_rights_str_mv embargoedAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Instituto Politécnico de Lisboa, Escola Superior de Tecnologia da Saúde de Lisboa
publisher.none.fl_str_mv Instituto Politécnico de Lisboa, Escola Superior de Tecnologia da Saúde de Lisboa
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
instacron:RCAAP
instname_str Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
instacron_str RCAAP
institution RCAAP
reponame_str Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
collection Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
repository.name.fl_str_mv Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1799133499444166656

Registros relacionados