Characterization of models of young and mature bacterial biofilms to study the activity and mechanism of action of a designed cyclic analog of gomesin
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Data de Publicação: | 2023 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | eng |
Título da fonte: | Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/10362/159125 |
Resumo: | Os biofilmes bacterianos apresentam alta recalcitrância a agentes antimicrobianos devido a vários fatores, incluindo a presença de uma matriz extracelular que dificulta a sua difusão, a reduzida suscetibilidade de bactérias dentro do biofilme e a degradação enzimática. Neste sentido, o tratamento de infeções associadas a biofilmes enfrenta severos problemas ao nível do tratamento, exigindo o uso de doses mais elevadas ou a aplicação de terapias combinadas para obter eficácia, destacando a necessidade urgente de abordagens inovadoras e alternativas aos antimicrobianos convencionais. O desenvolvimento de biofilmes tem sido uma área central de pesquisa na busca por novas terapias, uma vez que a compreensão da estrutura e dos mecanismos de crescimento do biofilme ainda é mal compreendida. Neste estudo, selecionamos uma estirpe de MRSA formadora de biofilme (LUH14616) para realizar uma ampla caracterização in vitro de biofilmes jovens (1 dia) e maduros (5 dias), e posteriormente investigar a atividade e mecanismo de ação de [G1K, K8R]cGm, um análogo cíclico do péptido antimicrobiano gomesina. Resultados obtidos do ensaio de violeta de cristal revelaram uma maior quantidade de biomassa aderida em estágios de maturação posteriores, embora houvesse menos bactérias por unidade de massa. Notavelmente, evidenciado por microscopias confocal e de força atómica, biofilmes jovens exibiram uma estrutura mais espessa e robusta com bactérias revestidas por uma camada espessa de matriz, contrastando com um biofilme mais fino e rarefeito em estágios de maturação posteriores. Para iniciar o estudo da atividade e do mecanismo de ação de [G1K, K8R]cGm contra biofilmes jovens, foram testadas concentrações crescentes do péptido por 4 e 24 h. No ensaio fluorométrico de redução da resazurina, resultados mostraram que [G1K, K8R]cGm conseguiu reduzir a atividade metabólica das bactérias de forma dose-dependente, atingindo um decréscimo máximo de 55% a 50 µM. Por sua vez, estes resultados foram confirmados por confocal, onde biofilmes tratados com 50 µM [G1K, K8R]cGm apresentavam uma percentagem significativamente maior de células bacterianas com membranas comprometidas, revelando a capacidade do péptido em difundir através da espessa camada de exopolissacárido e permeabilizar a membrana citoplasmática, causando a sua disrupção e, por fim, levando à morte celular. No entanto, uma predominância de bactérias com membrana intacta nas camadas mais profundas foi observada, mostrando um mecanismo dependente da profundidade do biofilme. Estudos de AFM revelaram alterações significativas na morfologia e topografia da superfície dos biofilmes tratados com [G1K, K8R]cGm, indicando um aumento na rugosidade da superfície do biofilme e das bactérias, mostrando uma relação com a capacidade de [G1K,K8R]cGm na disrupção da membrana da célula bacteriana. Em geral, os nossos resultados reforçam a importância de aprofundar o conhecimento sobre a fisiologia dos biofilmes e a sua estrutura tridimensional em termos de distribuição de células e matriz, uma vez que a heterogeneidade dos biofilmes pode afetar a atividade dos agentes antimicrobianos. São necessárias investigações adicionais para avaliar o potencial de [G1K, K8R]cGm contra biofilmes maduros e a sua aplicação no combate a biofilmes bacterianos em diferentes estágios de maturação. |
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Characterization of models of young and mature bacterial biofilms to study the activity and mechanism of action of a designed cyclic analog of gomesinMicrobiologiaBiofilmes bacterianosBiofilmes MRSAResistência antimicrobianaDomínio/Área Científica::Ciências MédicasOs biofilmes bacterianos apresentam alta recalcitrância a agentes antimicrobianos devido a vários fatores, incluindo a presença de uma matriz extracelular que dificulta a sua difusão, a reduzida suscetibilidade de bactérias dentro do biofilme e a degradação enzimática. Neste sentido, o tratamento de infeções associadas a biofilmes enfrenta severos problemas ao nível do tratamento, exigindo o uso de doses mais elevadas ou a aplicação de terapias combinadas para obter eficácia, destacando a necessidade urgente de abordagens inovadoras e alternativas aos antimicrobianos convencionais. O desenvolvimento de biofilmes tem sido uma área central de pesquisa na busca por novas terapias, uma vez que a compreensão da estrutura e dos mecanismos de crescimento do biofilme ainda é mal compreendida. Neste estudo, selecionamos uma estirpe de MRSA formadora de biofilme (LUH14616) para realizar uma ampla caracterização in vitro de biofilmes jovens (1 dia) e maduros (5 dias), e posteriormente investigar a atividade e mecanismo de ação de [G1K, K8R]cGm, um análogo cíclico do péptido antimicrobiano gomesina. Resultados obtidos do ensaio de violeta de cristal revelaram uma maior quantidade de biomassa aderida em estágios de maturação posteriores, embora houvesse menos bactérias por unidade de massa. Notavelmente, evidenciado por microscopias confocal e de força atómica, biofilmes jovens exibiram uma estrutura mais espessa e robusta com bactérias revestidas por uma camada espessa de matriz, contrastando com um biofilme mais fino e rarefeito em estágios de maturação posteriores. 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São necessárias investigações adicionais para avaliar o potencial de [G1K, K8R]cGm contra biofilmes maduros e a sua aplicação no combate a biofilmes bacterianos em diferentes estágios de maturação.Bacterial biofilms present high recalcitrance to antimicrobial agents due to various factors, including the presence of an extracellular matrix that hinders their diffusion, reduced susceptibility of biofilm-embedded bacteria, and enzymatic degradation. Therefore, the treatment of biofilm-associated infections faces severe challenges, requiring higher doses or the application of combination therapies to achieve effectiveness. This highlights the urgent need for innovative and alternative approaches to conventional antimicrobials. The development of biofilms has been a central area of research in the search for new therapies, as the understanding of biofilm structure and growth mechanisms is still poorly understood. In this study, we selected a strain of biofilm-forming MRSA (LUH14616) to perform a comprehensive in vitro characterization of young (1-day) and mature (5-day) biofilms, and subsequently investigate the activity and mechanism of action of [G1K, K8R]cGm, a cyclic analog of the antimicrobial peptide gomesin. Results from the crystal violet assay revealed a greater amount of adhered biomass in later maturation stages, although there were fewer bacteria per unit mass. Notably, as evidenced by confocal and atomic force microscopy, young biofilms exhibited a thicker and more robust structure with bacteria coated by a thick layer of matrix, contrasting with a thinner and more sparse biofilm in later maturation stages. To initiate the study of the activity and mechanism of action of [G1K, K8R]cGm against young biofilms, increasing concentrations of the peptide were tested for 4 and 24 h. In the resazurin reduction fluorometric assay, results showed that [G1K, K8R]cGm was able to dose-dependently reduce bacterial metabolic activity, reaching a maximum decrease of 55% at 50 µM. These results were further confirmed by confocal microscopy, where biofilms treated with 50 µM [G1K, K8R]cGm exhibited a significantly higher percentage of bacterial cells with compromised membranes, revealing the peptide's ability to diffuse through the thick exopolysaccharide layer and permeabilize the cytoplasmic membrane, causing its disruption and ultimately leading to cell death. However, a predominance of bacteria with intact membranes in the deeper layers was observed, indicating a depth-dependent mechanism within the biofilm. AFM studies revealed significant changes in the morphology and surface topography of biofilms treated with [G1K, K8R]cGm, indicating an increase in biofilm and bacterial surface roughness, which correlates with the peptide's capacity to disrupt the bacterial cell membrane. Overall, our results reinforce the importance of deepening the knowledge of biofilm physiology and its three-dimensional structure in terms of cell and matrix distribution, as the heterogeneity of biofilms can affect the activity of antimicrobial agents. Further investigations are needed to evaluate the potential of [G1K, K8R]cGm against mature biofilms and its application in combating bacterial biofilms at different stages of maturation.VEIGA, Ana Salomé Rocha do NascimentoCASTANHO, Miguel Augusto Rico BotasRUNLOPES, Joana Azevedo Felice2023-10-21T10:26:21Z2023-092023-092023-09-01T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10362/159125TID:203371020enginfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2024-03-11T05:41:35Zoai:run.unl.pt:10362/159125Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-20T03:57:24.785650Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse |
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Os biofilmes bacterianos apresentam alta recalcitrância a agentes antimicrobianos devido a vários fatores, incluindo a presença de uma matriz extracelular que dificulta a sua difusão, a reduzida suscetibilidade de bactérias dentro do biofilme e a degradação enzimática. Neste sentido, o tratamento de infeções associadas a biofilmes enfrenta severos problemas ao nível do tratamento, exigindo o uso de doses mais elevadas ou a aplicação de terapias combinadas para obter eficácia, destacando a necessidade urgente de abordagens inovadoras e alternativas aos antimicrobianos convencionais. O desenvolvimento de biofilmes tem sido uma área central de pesquisa na busca por novas terapias, uma vez que a compreensão da estrutura e dos mecanismos de crescimento do biofilme ainda é mal compreendida. Neste estudo, selecionamos uma estirpe de MRSA formadora de biofilme (LUH14616) para realizar uma ampla caracterização in vitro de biofilmes jovens (1 dia) e maduros (5 dias), e posteriormente investigar a atividade e mecanismo de ação de [G1K, K8R]cGm, um análogo cíclico do péptido antimicrobiano gomesina. Resultados obtidos do ensaio de violeta de cristal revelaram uma maior quantidade de biomassa aderida em estágios de maturação posteriores, embora houvesse menos bactérias por unidade de massa. Notavelmente, evidenciado por microscopias confocal e de força atómica, biofilmes jovens exibiram uma estrutura mais espessa e robusta com bactérias revestidas por uma camada espessa de matriz, contrastando com um biofilme mais fino e rarefeito em estágios de maturação posteriores. Para iniciar o estudo da atividade e do mecanismo de ação de [G1K, K8R]cGm contra biofilmes jovens, foram testadas concentrações crescentes do péptido por 4 e 24 h. No ensaio fluorométrico de redução da resazurina, resultados mostraram que [G1K, K8R]cGm conseguiu reduzir a atividade metabólica das bactérias de forma dose-dependente, atingindo um decréscimo máximo de 55% a 50 µM. Por sua vez, estes resultados foram confirmados por confocal, onde biofilmes tratados com 50 µM [G1K, K8R]cGm apresentavam uma percentagem significativamente maior de células bacterianas com membranas comprometidas, revelando a capacidade do péptido em difundir através da espessa camada de exopolissacárido e permeabilizar a membrana citoplasmática, causando a sua disrupção e, por fim, levando à morte celular. No entanto, uma predominância de bactérias com membrana intacta nas camadas mais profundas foi observada, mostrando um mecanismo dependente da profundidade do biofilme. Estudos de AFM revelaram alterações significativas na morfologia e topografia da superfície dos biofilmes tratados com [G1K, K8R]cGm, indicando um aumento na rugosidade da superfície do biofilme e das bactérias, mostrando uma relação com a capacidade de [G1K,K8R]cGm na disrupção da membrana da célula bacteriana. Em geral, os nossos resultados reforçam a importância de aprofundar o conhecimento sobre a fisiologia dos biofilmes e a sua estrutura tridimensional em termos de distribuição de células e matriz, uma vez que a heterogeneidade dos biofilmes pode afetar a atividade dos agentes antimicrobianos. São necessárias investigações adicionais para avaliar o potencial de [G1K, K8R]cGm contra biofilmes maduros e a sua aplicação no combate a biofilmes bacterianos em diferentes estágios de maturação. |
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