Fatores moleculares no metabolismo fundamental de Phytophthora cinnamomi
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2021 |
Outros Autores: | , |
Tipo de documento: | Artigo |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
Texto Completo: | https://doi.org/10.19084/rca.24616 |
Resumo: | Phytophthora cinnamomi é um Oomiceta diploide que vive no solo e é o causador da morte de inúmeras plantas em todo o mundo. Em Portugal a produção de castanheiro europeu encontra-se sobretudo na região norte onde mais de 80% está concentrada principalmente na região de Trás-os-Montes, tornando-se uma fonte económica muito valiosa para a região. A doença da tinta do castanheiro europeu é uma patologia causada principalmente por P. cinnamomi e representa uma ameaça para a preservação do castanheiro europeu (Castanea sativa Miller). O principal objetivo deste trabalho é a identificação de genes que expressam proteínas relacionadas com o metabolismo fundamental de P. cinnamomi, através da utilização de ferramentas bioinformáticas. O genoma deste microrganismo encontra-se depositado na base de dados biológicos NCBI (National Center for Biotechnology Information) e através das sequências desse genoma foram identificadas as ORFs (open reading frames - fases de leitura aberta) que codifiquem para proteínas associadas ao metabolismo fundamental. Com ferramentas bioinformáticas conseguimos ainda predizer a localização subcelular, a estrutura tridimensional, as características físico-químicas e a caracterização dos domínios dessas proteínas. |
id |
RCAP_3acd8ae8f229a994fc3fd4660f7e65f8 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:ojs.revistas.rcaap.pt:article/24616 |
network_acronym_str |
RCAP |
network_name_str |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
repository_id_str |
7160 |
spelling |
Fatores moleculares no metabolismo fundamental de Phytophthora cinnamomiGeralPhytophthora cinnamomi é um Oomiceta diploide que vive no solo e é o causador da morte de inúmeras plantas em todo o mundo. Em Portugal a produção de castanheiro europeu encontra-se sobretudo na região norte onde mais de 80% está concentrada principalmente na região de Trás-os-Montes, tornando-se uma fonte económica muito valiosa para a região. A doença da tinta do castanheiro europeu é uma patologia causada principalmente por P. cinnamomi e representa uma ameaça para a preservação do castanheiro europeu (Castanea sativa Miller). O principal objetivo deste trabalho é a identificação de genes que expressam proteínas relacionadas com o metabolismo fundamental de P. cinnamomi, através da utilização de ferramentas bioinformáticas. O genoma deste microrganismo encontra-se depositado na base de dados biológicos NCBI (National Center for Biotechnology Information) e através das sequências desse genoma foram identificadas as ORFs (open reading frames - fases de leitura aberta) que codifiquem para proteínas associadas ao metabolismo fundamental. Com ferramentas bioinformáticas conseguimos ainda predizer a localização subcelular, a estrutura tridimensional, as características físico-químicas e a caracterização dos domínios dessas proteínas. Phytophthora cinnamomi is a diploid Oomycete that lives in the soil and is the cause of the death of countless plants worldwide. In Portugal the production of European chestnut is found mainly in the northern region where more than 80% is concentrated mainly in the region of Trás-os-Montes, making it a very valuable economic source for the region. European chestnut ink disease is a pathology caused mainly by P. cinnamomi and poses a threat to the preservation of chestnut (Castanea sativa Miller). The main objective of this work is the identification of genes that express proteins related to the fundamental metabolism of P. cinnamomi, through the use of bioinformatics tools. The genome of this microorganism is deposited in the biological database NCBI (National Center for Biotechnology Information) and through the sequences of this genome, ORFs (open reading frames) that code for proteins associated with fundamental metabolism were identified. With bioinformatics tools we can also predict the subcellular location, the three-dimensional structure, the physical-chemical characteristics and the characterization of the domains of these proteins.Sociedade de Ciências Agrárias de Portugal2021-10-23T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articlehttps://doi.org/10.19084/rca.24616por2183-041X0871-018XRibeiro, DanielBranco, IuliiaChoupina, Altino Brancoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2022-09-06T09:25:28Zoai:ojs.revistas.rcaap.pt:article/24616Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-19T15:31:25.565685Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse |
dc.title.none.fl_str_mv |
Fatores moleculares no metabolismo fundamental de Phytophthora cinnamomi |
title |
Fatores moleculares no metabolismo fundamental de Phytophthora cinnamomi |
spellingShingle |
Fatores moleculares no metabolismo fundamental de Phytophthora cinnamomi Ribeiro, Daniel Geral |
title_short |
Fatores moleculares no metabolismo fundamental de Phytophthora cinnamomi |
title_full |
Fatores moleculares no metabolismo fundamental de Phytophthora cinnamomi |
title_fullStr |
Fatores moleculares no metabolismo fundamental de Phytophthora cinnamomi |
title_full_unstemmed |
Fatores moleculares no metabolismo fundamental de Phytophthora cinnamomi |
title_sort |
Fatores moleculares no metabolismo fundamental de Phytophthora cinnamomi |
author |
Ribeiro, Daniel |
author_facet |
Ribeiro, Daniel Branco, Iuliia Choupina, Altino Branco |
author_role |
author |
author2 |
Branco, Iuliia Choupina, Altino Branco |
author2_role |
author author |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Ribeiro, Daniel Branco, Iuliia Choupina, Altino Branco |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Geral |
topic |
Geral |
description |
Phytophthora cinnamomi é um Oomiceta diploide que vive no solo e é o causador da morte de inúmeras plantas em todo o mundo. Em Portugal a produção de castanheiro europeu encontra-se sobretudo na região norte onde mais de 80% está concentrada principalmente na região de Trás-os-Montes, tornando-se uma fonte económica muito valiosa para a região. A doença da tinta do castanheiro europeu é uma patologia causada principalmente por P. cinnamomi e representa uma ameaça para a preservação do castanheiro europeu (Castanea sativa Miller). O principal objetivo deste trabalho é a identificação de genes que expressam proteínas relacionadas com o metabolismo fundamental de P. cinnamomi, através da utilização de ferramentas bioinformáticas. O genoma deste microrganismo encontra-se depositado na base de dados biológicos NCBI (National Center for Biotechnology Information) e através das sequências desse genoma foram identificadas as ORFs (open reading frames - fases de leitura aberta) que codifiquem para proteínas associadas ao metabolismo fundamental. Com ferramentas bioinformáticas conseguimos ainda predizer a localização subcelular, a estrutura tridimensional, as características físico-químicas e a caracterização dos domínios dessas proteínas. |
publishDate |
2021 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2021-10-23T00:00:00Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/article |
format |
article |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://doi.org/10.19084/rca.24616 |
url |
https://doi.org/10.19084/rca.24616 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.relation.none.fl_str_mv |
2183-041X 0871-018X |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Sociedade de Ciências Agrárias de Portugal |
publisher.none.fl_str_mv |
Sociedade de Ciências Agrárias de Portugal |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação instacron:RCAAP |
instname_str |
Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação |
instacron_str |
RCAAP |
institution |
RCAAP |
reponame_str |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
collection |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação |
repository.mail.fl_str_mv |
|
_version_ |
1799130179342172160 |