Regulation of the alternative splicing of RAC1B in tumor cells

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Bizarro, Inês
Data de Publicação: 2023
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: eng
Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10400.18/9162
Resumo: Dissertação de mestrado em Bioquímica e Biomedicina, apresentada à Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, 2023.
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spelling Regulation of the alternative splicing of RAC1B in tumor cellsCancerAlternative SplicingRAC1BTumorigenesisSplicing FactorsCancroSplicing AlternativoTumorigéneseFatores de SplicingVias de Transdução de Sinal e Patologias AssociadasDissertação de mestrado em Bioquímica e Biomedicina, apresentada à Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, 2023.Dissertação orientada por: Doutora Vânia Gonçalves e Doutor Peter Jordan.Trabalho de dissertação de Mestrado realizado no Laboratório de Oncobiologia e Vias de Sinalização do Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge.Cancer is a molecularly heterogeneous disease that presents genetic modifications in different alternative pathways. Namely, a subgroup of colorectal cancer (CRC) is characterized by the simultaneous presence of an oncogenic mutation in BRAF and overexpression of RAC1B, an alternative splicing variant of the small GTPase RAC1. Together, these two changes stimulate signalling pathways that induce the proliferation and survival of CRC cells. Previously, the splicing factors (SFs) ESRP1 and SRSF1 were reported to promote RAC1B overexpression in this type of tumor, while SRSF3 inhibited it. However, the overexpression of RAC1B has also been identified in breast and lung tumors. As such, this work aimed to study the modulatory role of ESRP1, SRSF1 and SRSF3 on RAC1B alternative splicing in breast and lung cancer cells, using CRC cells as an experimental control since the role of these SFs has already been documented in these types of tumor. The SFs were overexpressed in the cells by co-transfection with a RAC1 minigene and the expression levels of the minigene-derived transcripts were analysed by RT-PCR. Next, the SFs endogenous expression was depleted by siRNA transfection and the endogenous levels of RAC1B transcript and protein were assessed through RT-PCR and Western blot, respectively. The obtained results indicate a role for SRSF1 and SRSF3 in positively and negatively modulating RAC1B alternative splicing, respectively, in both breast and lung cancer cells, as previously described for CRC. Intriguingly, ESRP1 inhibited RAC1B alternative splicing in these cells, revealing an opposite role to what was previously observed for CRC. Although future studies should be performed to confirm these results, ESRP1 and SRSF3 act as inhibitors of RAC1B alternative splicing whereas SRSF1 acts as an enhancer, in both breast and lung cancer cells.O foco deste trabalho experimental consistiu em averiguar se os fatores de splicing ESRP1, SRSF1 e SRSF3 desempenham um efeito modulatório no splicing alternativo de RAC1B em tumores da mama e do pulmão, nos quais a sua atividade já foi reportada.Funding: Bolsa de Iniciação à Investigação do Biosystems and Integrative Sciences Institute no âmbito do BioISI Junior Programe 2022 (UIDP/04046/2020) financiada pela Fundação para a Ciência e TecnologiaGonçalves, VâniaJordan, PeterRepositório Científico do Instituto Nacional de SaúdeBizarro, Inês20232025-10-26T00:00:00Z2023-01-01T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10400.18/9162enginfo:eu-repo/semantics/embargoedAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2024-03-09T01:30:50Zoai:repositorio.insa.pt:10400.18/9162Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-20T03:14:05.493574Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse
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