Desenvolvimento de suportes cromatográficos derivados de compostos heterocíclicos para purificação do G-quadruplex
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2015 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/10400.6/6069 |
Resumo: | As sequências de oligonucleótidos ricas em guanina têm capacidade de formar estruturas de G-quadruplex. Estas estruturas são diversas, transientes, polimórficas e podem ser encontradas em importantes regiões do genoma, tais com os telómeros e oncogenes. Estudos recentes demonstraram que existem ligandos que se ligam seletivamente e estabilizam estas estruturas, sendo estes considerados potenciais agentes anticancerígenos. Tendo em conta estes pressupostos, sintetizaram-se ligandos heterocíclicos derivados de indol para desenvolvimento de suportes cromatográficos através da sua imobilização na Sepharose para purificação de estruturas de G-quadruplex ou plasmídeos que contenham sequências formadoras de estruturas de G-quadruplex. Primeiramente sintetizaram-se os ligandos derivados de acridina e indol acoplados a diferentes poliaminas. Os ligandos derivados de acridina envolveram quatro tipos de reações, bromometilação da acridina, tosilação das aminas, substituição nucleofílica das aminas parcialmente tosiladas e por fim a destosilação dos ligandos. Os ligandos derivados de indol envolveram a condensação do aldeído de indol com as diferentes poliaminas, dos quais resultaram os ligandos IT3 (31%), IT4 (24%) e o IP5 (24%). Os ligandos sintetizados foram analisados e caracterizados por espectroscopia de RMN. A síntese dos suportes cromatográficos foi efetuada imobilizando os ligandos IT3, IT4 e IP5. Estes ligandos foram imobilizados na Sepharose, que havia sido previamente ativada via epóxido. Posteriormente os suportes cromatográficos foram analisados e caracterizados por RMN de HR-MAS, onde se constatou a efetiva imobilização dos derivados de indol na Sepharose, com diferentes densidades de imobilização. A fração de imobilização dos ligandos IT3, IT4 e IP5 foi de 0,15, 0,55 e 0,75, respetivamente. Estes resultados demonstraram que a imobilização de derivados de indol com aminas de cadeia mais longa apresentaram maior percentagem de imobilização. |
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Desenvolvimento de suportes cromatográficos derivados de compostos heterocíclicos para purificação do G-quadruplexDerivados de AcridinaDerivados de IndolG-QuadruplexRmn Hr-MasSuportes CromatográficosDomínio/Área Científica::Engenharia e Tecnologia:: Outras Engenharias e TecnologiasAs sequências de oligonucleótidos ricas em guanina têm capacidade de formar estruturas de G-quadruplex. Estas estruturas são diversas, transientes, polimórficas e podem ser encontradas em importantes regiões do genoma, tais com os telómeros e oncogenes. Estudos recentes demonstraram que existem ligandos que se ligam seletivamente e estabilizam estas estruturas, sendo estes considerados potenciais agentes anticancerígenos. Tendo em conta estes pressupostos, sintetizaram-se ligandos heterocíclicos derivados de indol para desenvolvimento de suportes cromatográficos através da sua imobilização na Sepharose para purificação de estruturas de G-quadruplex ou plasmídeos que contenham sequências formadoras de estruturas de G-quadruplex. Primeiramente sintetizaram-se os ligandos derivados de acridina e indol acoplados a diferentes poliaminas. Os ligandos derivados de acridina envolveram quatro tipos de reações, bromometilação da acridina, tosilação das aminas, substituição nucleofílica das aminas parcialmente tosiladas e por fim a destosilação dos ligandos. Os ligandos derivados de indol envolveram a condensação do aldeído de indol com as diferentes poliaminas, dos quais resultaram os ligandos IT3 (31%), IT4 (24%) e o IP5 (24%). Os ligandos sintetizados foram analisados e caracterizados por espectroscopia de RMN. A síntese dos suportes cromatográficos foi efetuada imobilizando os ligandos IT3, IT4 e IP5. Estes ligandos foram imobilizados na Sepharose, que havia sido previamente ativada via epóxido. Posteriormente os suportes cromatográficos foram analisados e caracterizados por RMN de HR-MAS, onde se constatou a efetiva imobilização dos derivados de indol na Sepharose, com diferentes densidades de imobilização. A fração de imobilização dos ligandos IT3, IT4 e IP5 foi de 0,15, 0,55 e 0,75, respetivamente. Estes resultados demonstraram que a imobilização de derivados de indol com aminas de cadeia mais longa apresentaram maior percentagem de imobilização.The sequences of oligonucleotides rich in guanine are capable of forming G-quadruplex structures. These structures are diverse, transient, polymorphic and can be found in important genome regions like telomeres and oncogenes. Recent studies have demonstrated that there are ligands which selectively bind and stabilize these structures, which are considered potential anticancer agents. In view of these assumptions, heterocyclic derivatives of indole have been synthesized for the development of chromatographic supports by immobilization of heterocyclic ligands in Sepharose for purification of G-quadruplex structures or plasmids containing sequences capable of forming G-quadruplex structures. The acridine and indol derivatives were the first ligands synthesized by coupling different polyamines. The acridine derivative synthesis involved four reactions, the acridine bromomethylation, tosylation of amines, nucleophilic substitution of partially tosilated amines and finally detosylation of the ligands. The indole derivatives ligands involved the aldehyde condensation with different polyamines, which resulted in the ligands IT3 (31%), IT4 (24%) and IP5 (24%). The synthesized ligands were analyzed and characterized by NMR spectroscopy. The synthesis of the chromatographic supports was performed using the ligands IT3, IT4 and IP5. These ligands were immobilized on Sepharose, which was previously activated via epoxide. Later, the chromatographic supports were analyzed and characterized by HR-MAS NMR, which confirmed the immobilization of the indole derivatives in Sepharose, with different densities in each case. The ligand density obtained for IT3, IT4 and IP5 was 0.15, 0.55 and 0.75, respectively. These results demonstrate, therefore, higher rate of immobilization of ligands that have longer chain amines bounded to them.Corvo, MartaCruz, Carla Patrícia Alves Freire MadeirauBibliorumRodrigues, Sérgio Miguel Roso2018-09-03T15:39:55Z2015-11-102015-10-52015-11-10T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10400.6/6069TID:201642883porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2023-12-15T09:44:20Zoai:ubibliorum.ubi.pt:10400.6/6069Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-20T00:46:52.656936Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse |
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