The impact of social confinement measures on the control of COVID-19 in Portugal

• Autor(a) principal: Pereira, João Paulo Freitas
• Data de Publicação: 2022
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: eng
• Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10348/11454
• topic: Modelação matemática; Análise de dados

Este trabalho foca-se em dois objetivos principais. A análise de dados portugueses de hospitalização, de forma a compreender melhor a dinâmica de hospitalização do COVID-19 e assim criar parâmetros a serem utilizados em modelação matemática. E a construção de um aplicativo para facilitar o uso e divulgação dos modelos desenvolvidos pela equipa do projeto COVID-19 in-CTRL. Para a análise dos dados de internamento, os dados de Grupos de Diagnósticos Homogéneos (DRG) portugueses, relativos a um período de um ano (março 2020 a março 2021), foram tratatos e transformados de forma a permitir uma análise exploratória em que o tempo de permanência em hospital, tempo até a morte, taxas de letalidade, percentagem de pacientes que necessitaram de tratamento em Unidades de Cuidados Intensivos (UCI) e outras métricas relativas a hospitalização por COVID foram estudadas, para pacientes UCI e não UCI, de acordo com vários fatores como a idade, o género e a Administação Regional de Saúde (ARS) e também ao longo do tempo. Contagens de entradas, fatalidades, ocupação e outras métricas de evolução ao longo do tempo também foram analisadas. Durante a pandemia COVID-19 em Portugal, o grupo COVID-19 in-CTRL teve um importante papel na criação de modelos para prever o impacto de vários tipos de medidas de saúde pública para prevenir a propagação da pandemia e assim ajudar as autoridades portuguesas nas suas tomadas de decisão. Com o final do projeto o autor pretende preservar todo o trabalho realizado ao reimplementar, na linguagem de programação R, o motor utilizado para resolver os sistemas de equações diferenciais ordinárias (EDO) dos modelos matemáticos, de forma a permitir que futuros trabalhos, utilizando os modelos desenvolvidos ou criando novos modelos, apenas fornecendo o sistema de EDO do modelo, realizem os cálculos de forma rápida e modular e, se assim o desejarem, numa população heterogênea sem necessidade de alterar as equações diferenciais. Também foi construída uma aplicação mais complexa na qual os usuários podem facilmente realizar cirar cenários com os modelos fornecidos. Para utilizar o aplicativo o usuário fornece, sequencialmente, o modelo com o qual deseja utilizar, em seguida os valores iniciais e os parâmetros iniciais, adiciona os breakpoints desejados, sendo estes datas em que o valor de parâmetros muda, e o aplicativo garante que a linha do tempo é construída corretamente e valida os valores fornecidos pelo utilizador. Os resultados podem ser expressos numa tabela onde as faixas etárias são agrupadas ou num grafico simples. Desta forma o usuário pode facilmente criar seus próprios cenários, ver os resultados e extrair os dados para usar noutras aplicações.