NRF2 polimorfismo rs35652124, como identificar os três genótipos? Identificação e otimização do método

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Preto, Ana Isabel Esteves
Data de Publicação: 2018
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10400.6/8516
Resumo: O seguinte trabalho é constituído por três capítulos relativos, respetivamente, à experiência profissionalizante realizada nas áreas de Investigação, Farmácia Comunitária e Farmácia Hospitalar, para a obtenção do Grau de Mestre em Ciências Farmacêuticas. No Capítulo 1, destinado à componente de Investigação, é abordado o papel antioxidante do Nuclear factor-erythroid 2 - related factor 2 (Nrf2) e a influência que os polimorfismos genéticos associados a este fator de transcrição poderão representar na carcinogénese. Atualmente, o ser humano encontra-se cada vez mais exposto ao Stress Oxidativo (SO) que, por sua vez, se pode correlacionar com a etiologia de várias doenças, nas quais se inclui o cancro. Porém, existem vários mecanismos de proteção contra o SO. Têm sido realizados vários estudos que refletem a importância do Nrf2 no SO, uma vez que intervém neste processo mediante a ativação da transcrição de genes que codificam enzimas antioxidantes de fase II e proteínas que participam no transporte de xenobióticos, prevenindo alterações na cromatina provocadas pelo SO, o que lhe confere um papel antioxidante. O Nrf2 encontra-se no citoplasma, acoplado à proteína Kelch-like ECH-associated protein 1 (Keap1), o seu regulador negativo. Mutações somáticas que influenciem a perda desta regulação negativa ou a presença de Single Nucleotide Polymorphism(s) (SNPs) na região promotora do gene Nrf2 podem estar associadas a alterações na expressão deste fator de transcrição. As diferenças observadas entre indivíduos relativamente à expressão de genes envolvidos na via oxidativa e no metabolismo carcinogénico poderão estar relacionadas com estes polimorfismos genéticos. O cancro da mama é uma das doenças na qual as vias envolvidas no SO representam um fator de risco para o seu desenvolvimento. Sendo o cancro da mama o mais frequente entre mulheres, com maior percentagem de morbilidade e mortalidade a nível mundial e o segundo tipo de cancro com maior mortalidade que afeta maioritariamente mulheres, os SNPs na região promotora do gene, anteriormente associados a outras patologias, consideram-se um potencial alvo de investigação no cancro da mama. Têm sido identificados vários SNPs no gene Nrf2, nomeadamente o SNP rs35652124 (A?G) na região promotora do mesmo. Contudo, o impacto deste polimorfismo no cancro da mama não se encontra atualmente suficientemente explorado. Assim, pretendeu-se verificar em doentes do Centro Hospitalar Cova da Beira (CHCB) a presença do polimorfismo rs35652124 na região promotora do Nrf2, tendo este estudo laboratorial como objetivo identificar e otimizar o método mais adequado para distinguir os três genótipos do polimorfismo rs35652124 do Nrf2. Como objetivos específicos, o presente estudo pretendeu determinar os genótipos pelo método de Polymerase Chain Reaction (PCR) with Confronting Two-Pair Primers (PCR-CTPP) e pelo método de PCR with Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP), analisando os resultados de modo a escolher qual o melhor método a utilizar. A população do estudo consistiu em amostras de sangue periférico de 45 doentes do Departamento de Saúde da Mulher e da Criança, do CHCB, Covilhã – Portugal, que realizaram biópsia para despiste histopatológico de cancro da mama. Procedeu-se à extração de Ácido Desoxirribonucleico (ADN) a partir das amostras recolhidas. O método de PCR-CTPP foi executado para identificação do genótipo das amostras. No entanto, o método não pareceu ser fidedigno e como tal, por PCR convencional amplificamos a região de interesse que foi posteriormente enviada para a empresa STABVIDA® que efetuou a sua sequenciação. Após a sequenciação foram identificados os três genótipos do polimorfismo rs35652124 do Nrf2, nomeadamente: 23 casos AA (Wild Type (WT)), 19 casos heterozigóticos (AG) e 3 casos homozigóticos (GG). Depois de efetuada a genotipagem do polimorfismo rs35652124 nas amostras selecionadas, procedeu-se à identificação do método de PCR mais adequado, nomeadamente PCR-CTPP e PCR-RFLP. Através da análise dos resultados demonstrámos que, de entre os métodos aplicados, o mais fidedigno para a genotipagem das amostras foi o método de PCR-RFLP. Estudos prévios demonstram que SNPs do Nrf2 estão relacionados com o risco de vir a desenvolver cancro da mama e com o prognóstico da doença. Uma vez confirmado como estando associado o polimorfismo rs35652124 ao desenvolvimento e prognóstico do cancro da mama, a genotipagem do mesmo poderá definir o Nrf2 como biomarcador do prognóstico tumoral. O Capítulo 2 refere-se ao estágio curricular efetuado de 22 de Janeiro a 6 de Abril de 2018 na Farmácia Bem Saúde, em Bragança, com a supervisão da Dr.ª Eugénia Baptista. A realização deste estágio funcionou como elo de ligação entre o conhecimento teórico previamente adquirido e a sua aplicação prática. Pretende-se portanto, neste capítulo, descrever as atividades executadas ao longo deste período, enumerando as competências adquiridas durante o mesmo. O Capítulo 3 descreve o estágio realizado no Hospital Distrital de Bragança durante o período de 9 Abril a 1 de Junho de 2018 sob a supervisão da Dr.ª Ângela Aragão. O estágio teve como objetivo consolidar conhecimentos relativos à vertente Hospitalar da área das Ciências Farmacêuticas. Com este capítulo pretende-se relatar as atividades realizadas ao longo deste estágio que possibilitaram a integração de conhecimentos teóricos com a realidade profissional em contexto hospitalar.
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Atualmente, o ser humano encontra-se cada vez mais exposto ao Stress Oxidativo (SO) que, por sua vez, se pode correlacionar com a etiologia de várias doenças, nas quais se inclui o cancro. Porém, existem vários mecanismos de proteção contra o SO. Têm sido realizados vários estudos que refletem a importância do Nrf2 no SO, uma vez que intervém neste processo mediante a ativação da transcrição de genes que codificam enzimas antioxidantes de fase II e proteínas que participam no transporte de xenobióticos, prevenindo alterações na cromatina provocadas pelo SO, o que lhe confere um papel antioxidante. O Nrf2 encontra-se no citoplasma, acoplado à proteína Kelch-like ECH-associated protein 1 (Keap1), o seu regulador negativo. Mutações somáticas que influenciem a perda desta regulação negativa ou a presença de Single Nucleotide Polymorphism(s) (SNPs) na região promotora do gene Nrf2 podem estar associadas a alterações na expressão deste fator de transcrição. As diferenças observadas entre indivíduos relativamente à expressão de genes envolvidos na via oxidativa e no metabolismo carcinogénico poderão estar relacionadas com estes polimorfismos genéticos. O cancro da mama é uma das doenças na qual as vias envolvidas no SO representam um fator de risco para o seu desenvolvimento. Sendo o cancro da mama o mais frequente entre mulheres, com maior percentagem de morbilidade e mortalidade a nível mundial e o segundo tipo de cancro com maior mortalidade que afeta maioritariamente mulheres, os SNPs na região promotora do gene, anteriormente associados a outras patologias, consideram-se um potencial alvo de investigação no cancro da mama. Têm sido identificados vários SNPs no gene Nrf2, nomeadamente o SNP rs35652124 (A?G) na região promotora do mesmo. Contudo, o impacto deste polimorfismo no cancro da mama não se encontra atualmente suficientemente explorado. Assim, pretendeu-se verificar em doentes do Centro Hospitalar Cova da Beira (CHCB) a presença do polimorfismo rs35652124 na região promotora do Nrf2, tendo este estudo laboratorial como objetivo identificar e otimizar o método mais adequado para distinguir os três genótipos do polimorfismo rs35652124 do Nrf2. Como objetivos específicos, o presente estudo pretendeu determinar os genótipos pelo método de Polymerase Chain Reaction (PCR) with Confronting Two-Pair Primers (PCR-CTPP) e pelo método de PCR with Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP), analisando os resultados de modo a escolher qual o melhor método a utilizar. A população do estudo consistiu em amostras de sangue periférico de 45 doentes do Departamento de Saúde da Mulher e da Criança, do CHCB, Covilhã – Portugal, que realizaram biópsia para despiste histopatológico de cancro da mama. Procedeu-se à extração de Ácido Desoxirribonucleico (ADN) a partir das amostras recolhidas. O método de PCR-CTPP foi executado para identificação do genótipo das amostras. No entanto, o método não pareceu ser fidedigno e como tal, por PCR convencional amplificamos a região de interesse que foi posteriormente enviada para a empresa STABVIDA® que efetuou a sua sequenciação. Após a sequenciação foram identificados os três genótipos do polimorfismo rs35652124 do Nrf2, nomeadamente: 23 casos AA (Wild Type (WT)), 19 casos heterozigóticos (AG) e 3 casos homozigóticos (GG). Depois de efetuada a genotipagem do polimorfismo rs35652124 nas amostras selecionadas, procedeu-se à identificação do método de PCR mais adequado, nomeadamente PCR-CTPP e PCR-RFLP. Através da análise dos resultados demonstrámos que, de entre os métodos aplicados, o mais fidedigno para a genotipagem das amostras foi o método de PCR-RFLP. Estudos prévios demonstram que SNPs do Nrf2 estão relacionados com o risco de vir a desenvolver cancro da mama e com o prognóstico da doença. Uma vez confirmado como estando associado o polimorfismo rs35652124 ao desenvolvimento e prognóstico do cancro da mama, a genotipagem do mesmo poderá definir o Nrf2 como biomarcador do prognóstico tumoral. O Capítulo 2 refere-se ao estágio curricular efetuado de 22 de Janeiro a 6 de Abril de 2018 na Farmácia Bem Saúde, em Bragança, com a supervisão da Dr.ª Eugénia Baptista. A realização deste estágio funcionou como elo de ligação entre o conhecimento teórico previamente adquirido e a sua aplicação prática. Pretende-se portanto, neste capítulo, descrever as atividades executadas ao longo deste período, enumerando as competências adquiridas durante o mesmo. O Capítulo 3 descreve o estágio realizado no Hospital Distrital de Bragança durante o período de 9 Abril a 1 de Junho de 2018 sob a supervisão da Dr.ª Ângela Aragão. O estágio teve como objetivo consolidar conhecimentos relativos à vertente Hospitalar da área das Ciências Farmacêuticas. Com este capítulo pretende-se relatar as atividades realizadas ao longo deste estágio que possibilitaram a integração de conhecimentos teóricos com a realidade profissional em contexto hospitalar.This report has three chapters, each one referring to the work experience in the areas of Research, Community Pharmacy and Hospital Pharmacy, to obtain the Master’s Degree in Pharmaceutical Sciences. Chapter 1 relates to the Research component. It approaches the role of an antioxidant and transcription factor, the Nuclear factor-erythroid 2 - related factor 2 (Nrf2), and the influence of its genetic polymorphisms in cancer. Currently, the human being is increasingly exposed to Oxidative Stress (OS) which is related to the etiology of various diseases, including cancer. However, there are many protective mechanisms against OS and a number of studies have shown the importance of Nrf2 as an antioxidant, once it activates the transcription of certain genes which encode phase II antioxidant enzymes and proteins that have a role in carrying xenobiotics, preventing changes in chromatin caused by OS. Nrf2 is located in the cytoplasm, attached to the Kelch-like ECH-associated protein 1 (Keap1), its negative regulator. Nrf2 expression may be altered by somatic mutations that influence its negative regulation, Keap1, or the occurrence of Single Nucleotide Polymorphism(s) (SNPs) in its promoter region. The differences between individuals expressing the genes involved in the oxidation and carcinogenic metabolism may be explain by these genetic polymorphisms. Breast cancer development has OS as a risk factor. It has the higher percentage of morbility and mortality worldwide and it is more frequently found between women, being the second type of cancer with the higher rate of mortality between them. Therefore, the SNPs in the promoter region of the gene that were previously associated with other pathologies, are now a potential target of investigation in breast cancer. Numerous SNPs have been identified in Nrf2, namely the SNP rs35652124 (A?G) found in the promoter region. However, the impact of this polymorphism in breast cancer is not sufficiently explored. Thus, this project intended to verify the presence of rs35652124 polymorphism in the promoter region of Nrf2 in patients of the Hospital Centre of Cova da Beira (CHCB). The aim of this laboratory study was to identify and optimize the most suitable method to distinguish between the three genotypes of rs35652124 polymorphism in the Nrf2 gene. As specific purposes, this project aimed to determine those genotypes by the Polymerase Chain Reaction (PCR) with Confronting Two-Pair Primers (PCR-CTPP) method and the de PCR with Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP) method, looking at the results and choose the best one to use. The study population was established by samples of peripheral blood of 45 patients of The Women and Children Department of CHCB, Covilhã – Portugal, which did a biopsy to test the presence of breast cancer. Deoxyribonucleic acid (DNA) was extracted from the samples. The PCR-CTPP method was performed in order to identify the genotype of the samples. However, the method did not seem to be reliable and we performed a conventional PCR in order to amplify the region of interest which was sent to STABVIDA® to be sequenced through Sanger Sequencing. This results enable us to distinguish the three genotypes of rs35652124 of Nrf2, namely: 23 cases AA (Wild Type (WT)), 19 cases heterozygous (AG) and 3 cases homozygous (GG). After the genotyping of the polymorphism rs35652124 for the selected samples, we proceed to the identification of the most adequate PCR method, namely PCR-CTPP and PCR-RFLP. Through the analysis of the results we verified that, between the methods applied, the most reliable for samples genotyping is the PCR-RFLP method. Previous studies has shown that SNPs and Nrf2 are correlated with the risk of breast cancer and the disease prognosis. If the association between the rs35652124 polymorphism and the development of breast cancer is confirmed, its genotyping may define Nrf2 as a cancer biomarker. Chapter 2 refers to the curricular internship held between January 22 and April 6 – 2018, at Farmácia Bem Saúde, in Bragança, under the supervision of Dr.ª Eugénia Baptista. This internship was the link between the acquisition of theoretical knowledge and its application. This chapter aims to describe all the activities performed and list the professional skills acquired in this period. Chapter 3 describes the internship held in Hospital Distrital de Bragança, between April 9 and June 1 – 2018, under the supervision of Dr.ª Ângela Aragão. The purpose of this internship was to consolidate the general knowledge about the hospital component in pharmaceutical sciences. This chapter reports the activities performed during this internship that allowed the integration of theoretical knowledge with the reality of the hospital professional context.Granadeiro, Luiza Augusta Tereza Gil BreitenfeldAlmeida, Micaela Carina PereirauBibliorumPreto, Ana Isabel Esteves2020-01-20T17:15:50Z2018-11-142018-10-42018-11-14T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10400.6/8516TID:202361136porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2023-12-15T09:48:32Zoai:ubibliorum.ubi.pt:10400.6/8516Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-20T00:48:50.325705Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse
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Têm sido realizados vários estudos que refletem a importância do Nrf2 no SO, uma vez que intervém neste processo mediante a ativação da transcrição de genes que codificam enzimas antioxidantes de fase II e proteínas que participam no transporte de xenobióticos, prevenindo alterações na cromatina provocadas pelo SO, o que lhe confere um papel antioxidante. O Nrf2 encontra-se no citoplasma, acoplado à proteína Kelch-like ECH-associated protein 1 (Keap1), o seu regulador negativo. Mutações somáticas que influenciem a perda desta regulação negativa ou a presença de Single Nucleotide Polymorphism(s) (SNPs) na região promotora do gene Nrf2 podem estar associadas a alterações na expressão deste fator de transcrição. As diferenças observadas entre indivíduos relativamente à expressão de genes envolvidos na via oxidativa e no metabolismo carcinogénico poderão estar relacionadas com estes polimorfismos genéticos. O cancro da mama é uma das doenças na qual as vias envolvidas no SO representam um fator de risco para o seu desenvolvimento. Sendo o cancro da mama o mais frequente entre mulheres, com maior percentagem de morbilidade e mortalidade a nível mundial e o segundo tipo de cancro com maior mortalidade que afeta maioritariamente mulheres, os SNPs na região promotora do gene, anteriormente associados a outras patologias, consideram-se um potencial alvo de investigação no cancro da mama. Têm sido identificados vários SNPs no gene Nrf2, nomeadamente o SNP rs35652124 (A?G) na região promotora do mesmo. Contudo, o impacto deste polimorfismo no cancro da mama não se encontra atualmente suficientemente explorado. Assim, pretendeu-se verificar em doentes do Centro Hospitalar Cova da Beira (CHCB) a presença do polimorfismo rs35652124 na região promotora do Nrf2, tendo este estudo laboratorial como objetivo identificar e otimizar o método mais adequado para distinguir os três genótipos do polimorfismo rs35652124 do Nrf2. Como objetivos específicos, o presente estudo pretendeu determinar os genótipos pelo método de Polymerase Chain Reaction (PCR) with Confronting Two-Pair Primers (PCR-CTPP) e pelo método de PCR with Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP), analisando os resultados de modo a escolher qual o melhor método a utilizar. A população do estudo consistiu em amostras de sangue periférico de 45 doentes do Departamento de Saúde da Mulher e da Criança, do CHCB, Covilhã – Portugal, que realizaram biópsia para despiste histopatológico de cancro da mama. Procedeu-se à extração de Ácido Desoxirribonucleico (ADN) a partir das amostras recolhidas. O método de PCR-CTPP foi executado para identificação do genótipo das amostras. No entanto, o método não pareceu ser fidedigno e como tal, por PCR convencional amplificamos a região de interesse que foi posteriormente enviada para a empresa STABVIDA® que efetuou a sua sequenciação. Após a sequenciação foram identificados os três genótipos do polimorfismo rs35652124 do Nrf2, nomeadamente: 23 casos AA (Wild Type (WT)), 19 casos heterozigóticos (AG) e 3 casos homozigóticos (GG). Depois de efetuada a genotipagem do polimorfismo rs35652124 nas amostras selecionadas, procedeu-se à identificação do método de PCR mais adequado, nomeadamente PCR-CTPP e PCR-RFLP. Através da análise dos resultados demonstrámos que, de entre os métodos aplicados, o mais fidedigno para a genotipagem das amostras foi o método de PCR-RFLP. Estudos prévios demonstram que SNPs do Nrf2 estão relacionados com o risco de vir a desenvolver cancro da mama e com o prognóstico da doença. 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