Alternative genotyping method for the single nucleotide polymorphism A2959G (AF159246) of the bovine CAST gene
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Data de Publicação: | 2008 |
Outros Autores: | , , |
Tipo de documento: | Artigo |
Idioma: | eng |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UNESP |
Texto Completo: | http://dx.doi.org/10.1590/S0100-204X2008000500014 http://hdl.handle.net/11449/14066 |
Resumo: | O objetivo deste trabalho foi genotipar o polimorfismo de nucleotídeo único (single nucleotide polymorphism - SNP) A2959G (AF159246) do gene CAST bovino, pela técnica de PCR-RFLP, e reportar a sua utilização pela primeira vez. Para tanto, 147 animais Bos indicus e Bos taurus x Bos indicus foram genotipados. A acurácia do método foi confirmada por meio do seqüenciamento direto de produtos de PCR de nove indivíduos. A menor freqüência do alelo A, favorável à maciez da carne, foi confirmada nos animais Bos indicus. O uso da PCR-RFLP, para a genotipagem do SNP do gene CAST bovino, mostrou-se consistente e de baixo custo, o que permite a sua análise por laboratórios dotados de estrutura básica. |
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Alternative genotyping method for the single nucleotide polymorphism A2959G (AF159246) of the bovine CAST geneMétodo alternativo de genotipagem do polimorfismo de nucleotídeo único A2959G (AF159246) do gene CAST bovinogene da calpastatinatextura da carnePCR-RFLPSNPcalpastatin genemeat texturePCR-RFLPSNPO objetivo deste trabalho foi genotipar o polimorfismo de nucleotídeo único (single nucleotide polymorphism - SNP) A2959G (AF159246) do gene CAST bovino, pela técnica de PCR-RFLP, e reportar a sua utilização pela primeira vez. Para tanto, 147 animais Bos indicus e Bos taurus x Bos indicus foram genotipados. A acurácia do método foi confirmada por meio do seqüenciamento direto de produtos de PCR de nove indivíduos. A menor freqüência do alelo A, favorável à maciez da carne, foi confirmada nos animais Bos indicus. O uso da PCR-RFLP, para a genotipagem do SNP do gene CAST bovino, mostrou-se consistente e de baixo custo, o que permite a sua análise por laboratórios dotados de estrutura básica.The objective of this work was to genotype the single nucleotide polymorphism (SNP) A2959G (AF159246) of bovine CAST gene by PCR-RFLP technique, and to report its use for the first time. For this, 147 Bos indicus and Bos taurus x Bos indicus animals were genotyped. The accuracy of the method was confirmed through the direct sequencing of PCR products of nine individuals. The lowest frequency of the meat tenderness favorable allele (A) in Bos indicus was confirmed. The use of PCR-RFLP for the genotyping of the bovine CAST gene SNP was shown to be robust and inexpensive, which will greatly facilitate its analysis by laboratories with basic structure.Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)Universidade Estadual Paulista Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia Departamento de Melhoramento e Nutrição AnimalUnesp Instituto de Biociências Departamento de Química e BioquímicaUniversidade Estadual Paulista Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia Departamento de Melhoramento e Nutrição AnimalUnesp Instituto de Biociências Departamento de Química e BioquímicaEmpresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA)Universidade Estadual Paulista (Unesp)Curi, Rogerio Abdallah [UNESP]Chardulo, Luis Artur Loyola [UNESP]Silveira, Antonio Carlos [UNESP]Oliveira, Henrique Nunes de [UNESP]2013-09-30T18:27:05Z2014-05-20T13:40:30Z2013-09-30T18:27:05Z2014-05-20T13:40:30Z2008-05-01info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/article657-659application/pdfhttp://dx.doi.org/10.1590/S0100-204X2008000500014Pesquisa Agropecuária Brasileira. Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA) Informação TecnológicaPesquisa Agropecuária Brasileira, v. 43, n. 5, p. 657-659, 2008.0100-204Xhttp://hdl.handle.net/11449/1406610.1590/S0100-204X2008000500014S0100-204X2008000500014WOS:000257020300014S0100-204X2008000500014.pdf351471341391912698207540112772630000-0001-6289-0406SciELOreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESPengPesquisa Agropecuária Brasileira0.546info:eu-repo/semantics/openAccess2024-01-18T06:31:25Zoai:repositorio.unesp.br:11449/14066Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestopendoar:29462024-01-18T06:31:25Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false |
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