Population genetics and phylogenetic study of the genus Tolpis in the Azores and Madeira

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Silva, Lurdes da Conceição Borges
Data de Publicação: 2012
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: eng
Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10400.3/5333
Resumo: Dissertação de Mestrado, Biodiversidade e Biotecnologia Vegetal, 22 de Junho de 2012, Universidade dos Açores.
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spelling Population genetics and phylogenetic study of the genus Tolpis in the Azores and MadeiraEspécies EndémicasGenética PopulacionalTolpis azoricaTolpis succulentaEndemic SpeciesPopulation GeneticsDomínio/Área Científica::Ciências Naturais::Ciências da Terra e do AmbienteDissertação de Mestrado, Biodiversidade e Biotecnologia Vegetal, 22 de Junho de 2012, Universidade dos Açores.O género Tolpis é constituído por aproximadamente 12 espécies que se encontram distribuídas por África, Europa e pelas ilhas da Macaronésia. O género Tolpis está incluído na tribo cosmopolita Lactuceae Cass. pertencente à família Asteraceae. No arquipélago dos Açores, T. azorica (Nutt.) P. Silva, é considerada como endêmica e está atualmente indicada como presente em todas as ilhas do arquipélago com excepção de Santa Maria e Graciosa. T. succulenta (Dryander in Aiton) Lowe é indicada para todas as ilhas do arquipélago dos Açores, ocorrendo também no arquipélago da Madeira. Para estimar a variabilidade intra e intergenética nas várias populações de Tolpis spp. nos Açores e na Madeira, foi utilizado um conjunto de 5 microsatélites (SSR) em 478 indivíduos de Tolpis spp. Para estes marcadores, T. azorica apresenta 59 alelos no total (média de 11,8), oscilando entre 5, para o marcador TA3B02, e 22 para o marcador TA3B05, apresentando um excesso global de homozigotia (Multilocus Fis=0,298, variando desde -0,05 para TA3B05 a 0,49 para TA2A01). Quanto a T. succulenta, foram obtios 56 alelos no total (média de 11,2), variando entre 7 para o marcador TA2A02 e 18 para TA3B05, com um excesso global de homozigotia (Multilocus Fis=0.383, desde 0.06 para TA3B05 a 0.582 para TA2A01). As duas espécies têm um valor equivalente de alelos raros, nomeadamente 55.9% para T. azorica e 57.1% para T. succulenta. Após a realização de uma Análise de Componentes Principais (ACP) e análises Bayesianas confirmou-se a existência de uma estrutura populacional composta por três grupos bem definidos. Nesta estrutura T. azorica surge dividida em dois grupos, sendo o terceiro composto por T. succulenta. Uma análise mais detalhada a T. succulenta confirmou um agrupamento diferencial entre indivíduos pertencentes a populações dos Açores e da Madeira. Análises morfológicas e dados moleculares obtidos a partir de sequencias da região nuclear ITS foram utilizadas para esclarecer as relações filogenéticas entre as espécies de Tolpis endémicas presentes nos arquipélagos dos Açores e da Madeira. Os resultados obtidos são congruentes com os obtidos através da análise da estrutura genética populacional e têm como resultado final a nomeação de duas novas espécies, que são aqui descritas pela primeira vez. Uma actualização da circunscrição geográfica das espécies de Tolpis endémicas dos Açores é aqui também indicada.ABSTRACT: Tolpis consists of approximately 12 species distributed in Africa, Europe, and the islands of Macaronesia. The genus Tolpis is included in the cosmopolitan tribe Lactuceae Cass., within the Asteraceae family. In the Azores Islands, T. azorica (Nutt.) P. Silva, is an endemic specie to the archipelago and is currently listed as present in all the islands except Santa Maria and Graciosa. T. succulenta (Dryander in Aiton) Lowe is said to occur in all the Azores Islands and is shared with the Madeira archipelago. To evaluate intra and intergenetic variability in several populations of Azorean and Madeiran Tolpis spp., a set of 5 microsatellite loci (SSR) were applied to 478 individuals of Tolpis spp. As main results, T. azorica exhibits 59 alleles in total (average of 11.8), ranging from 5 for marker TA3B02 to 22 for TA3B05, and an overall excess of homozygotes (Multilocus Fis=0.298, ranging from -0.05 for TA3B05 to 0.49 for TA2A01), while T. succulenta, exhibits 56 alleles in total (average of 11.2), ranging from 7 for marker TA2A02 to 18 for TA3B05, and an overall excess of homozygotes (Multilocus Fis=0.383, ranging from 0.06 for TA3B05 to 0.582 for TA2A01). The two species have an equivalent value of rare alleles, 55. 9% for T. azorica and 57.1% for T.succulenta. A Principal Component Analysis (PCoA) and a Bayesian approach confirmed the existence of a population genetic structure with three well-confirmed groups, where T. azorica is divided in two groups, with the third one aggregating the T. succulenta individuals. A further detaled analysis to T. succulenta confirmed the occurrence of a diferencial grouping between individuals from Azores and Madeira populations. Morphological analysis and molecular sequence data from the ITS nuclear region was used for elucidating the phylogenetic relationships of the endemic Tolpis spp. in the archipelagos of Azores and Madeira. The results are congruente with the population genetic structure analyses obtained, and as main results two new species are named and described here for the first time. An update of the geographic circumscription of the Azorean endemic Tolpis spp. is also indicated here.Master dissertation included in demiurgo project financed by FEDER, of the iniciative MAC/1/C020- Programa de Cooperação Transnacional Açores-Madeira-Canárias (MAC) 2007-2013.Moura, Mónica Maria TavaresSardos, JulieRepositório da Universidade dos AçoresSilva, Lurdes da Conceição Borges2020-02-04T14:06:19Z2012-06-222012-06-22T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10400.3/5333enginfo:eu-repo/semantics/embargoedAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2022-12-20T14:33:38Zoai:repositorio.uac.pt:10400.3/5333Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-19T16:27:34.578698Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse
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