Transfer and persistence of DNA on drug wrappings
| Autor(a) principal: | |
|---|---|
| Data de Publicação: | 2021 |
| Tipo de documento: | Dissertação |
| Idioma: | eng |
| Título da fonte: | Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
| Texto Completo: | http://hdl.handle.net/10451/51355 |
Resumo: | Tese de Mestrado, Biologia Humana e Ambiente, 2021, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências |
| id |
RCAP_92322a79e3e74806195294b46ea3e0b8 |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:repositorio.ul.pt:10451/51355 |
| network_acronym_str |
RCAP |
| network_name_str |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
| repository_id_str |
7160 |
| spelling |
Transfer and persistence of DNA on drug wrappingsTransferênciaPersistênciaDNAEmbalagens de drogaTeses de mestrado - 2021Domínio/Área Científica::Ciências Naturais::Ciências BiológicasTese de Mestrado, Biologia Humana e Ambiente, 2021, Universidade de Lisboa, Faculdade de CiênciasA área da genética é responsável pelo estudo da transmissão e expressão dos genes. Na população humana, existe uma imensa diversidade genética. Esta variabilidade genética permite o uso da técnica de análise de perfis de DNA por geneticistas forenses. Um perfil de DNA consiste no conjunto de genótipos de múltiplos loci. A análise de perfis de DNA é utilizada na identificação de indivíduos. O perfil de DNA pode ligar um individuo específico a uma amostra recuperada numa cena de crime. Dos diversos marcadores de DNA existentes, o mais indicado para se utilizar na análise de perfis de DNA são os STR, Short Tandem Repeat. Estes correspondem às características necessárias para este tipo de análise: são extremamente polimórficos, são de fácil caraterização e permitem uma leitura simples dos perfis de DNA. A análise de amostras forenses é conhecida pelos seus desafios. Este tipo de amostras é suscetível a alterações analíticas devido a diversos fatores, desde a sua natureza biológica, substrato e contaminação. Estes fatores poderão afetar a qualidade do DNA e o resultado final da análise. Quando se realiza as análises a perfis de DNA existe uma elevada probabilidade de deteção de misturas de DNA. Estes perfis de DNA possuem mais de um contribuidor de DNA, possuindo múltiplos genótipos. Estas misturas de DNA acarretam uma dificuldade maior na análise deste tipo de perfil de DNA. EuroForMix é um programa de interpretação de misturas de DNA que facilita a análise de perfis de DNA, e fornece informação como o valor de Likelihood Ratio (LR) – medida que compara dois cenários e indica qual o mais provável. O DNA recolhido numa cena de crime deve ser analisado em diferentes níveis. Nesta dissertação estamos a estudar o nível de atividade, que diz respeito às questões de como e quando o vestígio foi depositado na cena de crime. Os mecanismos de DNA, transferência, persistência, prevalência e recuperação (DNA-TPPR) possuem um grande impacto na qualidade e quantidade de DNA. O DNA pode ser transferido, principalmente, por dois modos, transferência direta (primária) e por transferência indireta (secundária). O modo como o DNA foi transferido para a cena de crime possui consequências na interpretação do perfil de DNA. É importante ter em consideração a existência de ‘Background DNA’ e ‘Shedder Status’. ‘Background DNA’ corresponde a DNA que não está relacionado com o ato criminal, mas que está presente antes de o crime ocorrer. Este é inevitável e afeta a transferência de DNA. ‘Shedder Status’ corresponde à quantidade de DNA que nós depositamos quando tocamos num objeto, este fator é influenciado pelo género, idade, suor, doenças de pele e hábitos de cada pessoa. Determinados fatores possuem impacto na transferência DNA: o tipo de substrato do objeto, a origem do material biológico e o tipo de contacto entre as superfícies. A persistência do material biológico é afetada por fatores ambientais que podem acelerar o processo de degradação, pelo tipo de substrato do objeto e se o objeto é um objeto pessoal ou partilhado por diversas pessoas. A prevalência do DNA pode ser perturbada por diversas questões anteriormente mencionadas, como o ‘Background DNA’ e se o objeto é um objeto pessoal ou partilhado. A recuperação do DNA pode influenciar a qualidade dos resultados das análises futuras. A escolha do método mais adequado de recuperação é um fator importante. Os métodos mais utilizados são os esfregaços e a fita. Atualmente, em Portugal temos vindo a assistir um aumento dos números de casos relacionados com narcóticos, com apreensões cada vez maiores de estupefacientes. Este aumento também é uma realidade na Noruega, onde as taxas de casos de narcóticos têm vindo a aumentar nos últimos anos. Uma grande parte das amostras que vêm para os laboratórios forenses são embalagens de drogas para analisar e conectar a um potencial suspeito. O DNA tem sido contestado mais frequentemente em tribunal. Especificamente a atividade ou a altura dos acontecimentos que resultaram na transferência do DNA. Em muitos casos, a defesa dos suspeitos tenta dar uma explicação alternativa sobre como o DNA do suspeito foi transferido. Pois um perfil de DNA pode apenas fornecer informações sobre a identidade do dador, não diz como e quando ocorreu a deposição deste. O principal objetivo desta dissertação é obter um maior conhecimento sobre os mecanismos de transferência, persistência e recuperação de DNA, de modo que no futuro seja mais fácil para os cientistas forenses interpretar questões relacionadas com a atividade em casos relacionados com drogas. Foram realizados dois tipos de experiência: simulação de manuseamento de embalagens de droga e ‘Shedder status’. A simulação de manuseamento de embalagens de droga englobou três experiências diferentes: simulação de transferência direta (em que os participantes manusearam múltiplas vezes uma embalagem de droga); simulação de transferência indireta (participantes colocaram uma embalagem de droga numa mala previamente usada) e por último simulação do empacotamento de uma embalagem de droga (esta experiência realizou-se aos pares, em que o primeiro participantes manuseou o rolo de fita cola, e o segundo participante embalou um pedaço de cartão com o rolo de fita cola). Na experiência de determinação do ‘Shedder status’, os participantes manusearam três tubos de plástico em diferentes alturas. Os métodos utilizados para análise são os métodos padrão usados em laboratórios forenses. Após a recolhas das amostras através de esfregaços, foi utilizada a extração de DNA Chelex® 100 (Laboratórios Bio-Rad), seguido por quantificação através de PowerQuant® (Promega) e amplificação com Promega Fusion®6C Kit. Por último, a análise de fragmentos foi realizada no sistema de eletroforese capilar (CE). Na experiência de determinação do ‘Shedder status’ optou-se por realizar uma amplificação direta com Promega Fusion®6C Kit, em vez de se realizar a extração de DNA. A amplificação foi seguida pela realização de eletroforese capilar. Na primeira experiência em que os participantes manusearam diretamente as embalagens de droga, foi obtida a maioria dos perfis de DNA dos participantes. Na experiência de transferência secundária através da mala, foram obtidos perfis de DNA parciais e perfis nulos. Na experiência de simulação do empacotamento de uma embalagem de droga obteve-se misturas de perfis de DNA. Com base nos resultados da experiência de ‘Shedder status’, foi possível classificar os participantes em baixo, médio e alto ‘shedders’. Tendo em conta a classificação atribuída aos participantes, os resultados das experiências anteriores foram analisados. Na primeira experiência foi observada uma correlação entre os valores de LR e RFU (Relative Fluorescence Unit) obtidos e a classificação dos participantes, tal como na terceira experiência, empacotamento de uma embalagem de droga. Na segunda experiência, transferência secundária através da mala, não foi observada uma correlação entre os valores de LR e RFU e a classificação atribuída aos participantes. Em suma, observou-se uma maior deteção de DNA após transferência direta do que por transferência indireta. Foi mais frequentemente detetado o DNA do participante que realizou o empacotamento da droga do que o DNA do participante que manuseou o rolo de fita cola. Com base nos resultados obtidos foi possível classificar os participantes em baixo, médio e alto ‘shedders’, tendo sido, a maioria dos participantes, classificados como médio ‘shedders’. Os dados que foram obtidos nesta dissertação fornecem informação que pode ajudar os cientistas forenses na avaliação de questões relativas ao nível de atividade. Tendo em conta a base de dados, criada com os resultados obtidos, foi formulado um caso fictício, de forma a comprovar se a base de dados criada pode ajudar na análise de questões ao nível de atividade do vestígio depositado na cena de crime. Com este caso demonstramos que o valor de LR referente ao nível de atividade de um caso, pode ser calculado através da nossa base de dados.DNA profiling is an instrumental aid in the investigation of illegal activities. Nowadays, the explanation on how DNA evidence was deposited in the crime scene is particularly important in court. The quantity and quality of DNA traces are affected by the mechanisms: transfer, persistence, prevalence and recovery (DNA-TPPR). DNA traces can be transferred directly during the illegal activity or indirectly, where an intermediary has transferred DNA. The existence of high levels of background DNA on the surface may decrease the detection of transferred DNA. The persistence of DNA can be affected by environmental conditions the object is exposed to in that period of time, as well by the nature of the substrate of the object. Hands are a well-known vector when considering transfer of DNA. All these possible sources of DNA in a sample can produce a mixed profile when analysing the results. A large portion of the samples that come to the Norwegian forensic laboratories are drug wrappings to analyse and link it to a person of interest. We simulated drug wrappings in different scenarios, from direct transfer, indirect transfer from inside of a pre used bag and the packing of drug wrappings (one participant handled the tape, a second participant packed the drug wrap). We also determined de shedder status of the participants. It was observed a higher detection of DNA after direct transfer in comparison with the indirect transfer results. The DNA from the participant that packed the drug wrap was more frequently detected than the DNA from the participant that previously handled the tape. Based on a tube holding experiment we were able to categorise the participants as high, low and medium shedders. The majority of the participants was classified as medium shedders.Rebelo, Maria Teresa Ferreira Ramos Nabais de Oliveira,1964-Fonneløp, Ane ElidaRepositório da Universidade de LisboaFaria, Sara Isabel Pereira de2022-12-31T01:31:56Z202120212021-01-01T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10451/51355TID:202934845enginfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2023-11-08T16:56:00Zoai:repositorio.ul.pt:10451/51355Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-19T22:02:39.472189Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse |
| dc.title.none.fl_str_mv |
Transfer and persistence of DNA on drug wrappings |
| title |
Transfer and persistence of DNA on drug wrappings |
| spellingShingle |
Transfer and persistence of DNA on drug wrappings Faria, Sara Isabel Pereira de Transferência Persistência DNA Embalagens de droga Teses de mestrado - 2021 Domínio/Área Científica::Ciências Naturais::Ciências Biológicas |
| title_short |
Transfer and persistence of DNA on drug wrappings |
| title_full |
Transfer and persistence of DNA on drug wrappings |
| title_fullStr |
Transfer and persistence of DNA on drug wrappings |
| title_full_unstemmed |
Transfer and persistence of DNA on drug wrappings |
| title_sort |
Transfer and persistence of DNA on drug wrappings |
| author |
Faria, Sara Isabel Pereira de |
| author_facet |
Faria, Sara Isabel Pereira de |
| author_role |
author |
| dc.contributor.none.fl_str_mv |
Rebelo, Maria Teresa Ferreira Ramos Nabais de Oliveira,1964- Fonneløp, Ane Elida Repositório da Universidade de Lisboa |
| dc.contributor.author.fl_str_mv |
Faria, Sara Isabel Pereira de |
| dc.subject.por.fl_str_mv |
Transferência Persistência DNA Embalagens de droga Teses de mestrado - 2021 Domínio/Área Científica::Ciências Naturais::Ciências Biológicas |
| topic |
Transferência Persistência DNA Embalagens de droga Teses de mestrado - 2021 Domínio/Área Científica::Ciências Naturais::Ciências Biológicas |
| description |
Tese de Mestrado, Biologia Humana e Ambiente, 2021, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências |
| publishDate |
2021 |
| dc.date.none.fl_str_mv |
2021 2021 2021-01-01T00:00:00Z 2022-12-31T01:31:56Z |
| dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| format |
masterThesis |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://hdl.handle.net/10451/51355 TID:202934845 |
| url |
http://hdl.handle.net/10451/51355 |
| identifier_str_mv |
TID:202934845 |
| dc.language.iso.fl_str_mv |
eng |
| language |
eng |
| dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
| dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação instacron:RCAAP |
| instname_str |
Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação |
| instacron_str |
RCAAP |
| institution |
RCAAP |
| reponame_str |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
| collection |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
| repository.name.fl_str_mv |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação |
| repository.mail.fl_str_mv |
|
| _version_ |
1799134576135634944 |