Avaliação do impacto dos níveis de expressão de RalGPS2 em cancro do pulmão e da próstata

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Diniz, Catarina Isabel da Poça
Data de Publicação: 2022
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10400.6/13045
Resumo: O cancro da próstata é o que mais afeta homens, sendo de todos os tipos de cancro o segundo mais frequente a nível mundial. Por outro lado, o cancro do pulmão é o mais letal. O forte impacto destas doenças a nível mundial continua a impulsionar a investigação científica sobre o seu desenvolvimento e progressão, bem como sobre o seu tratamento. A sobreativação dos cofatores transcricionais YAP/TAZ, regulados negativamente pela via supressora tumoral Hippo, tem sido associada a diversos tipos de cancro, incluindo cancro da próstata, promovendo a proliferação celular. Além disso, RalGPS2 é um fator de troca de nucleotídeos de guanina e o seu silenciamento tem demonstrado ter a capacidade de diminuir a proliferação de células tumorais, mas o mecanismo não foi totalmente esclarecido. Recentemente, foi demonstrado que o aumento da sua expressão está associado a mau prognóstico dos doentes com adenocarcinoma do pulmão, o que reforça o interesse de prosseguir com a investigação do seu papel em células tumorais. Assim, este estudo teve como objetivos principais procurar evidências de uma possível interação entre RalGPS2 e os cofatores de transcrição YAP/TAZ no cancro da próstata. Este objectivo foi atingido quer por uma abordagem experimental, avaliando o silenciamento de RalGPS2 em combinação com tratamentos que levam à inativação de YAP/TAZ, quer através de uma abordagem bioinformática, explorando dados de transcriptómica de tumores de acesso livre. Na primeira abordagem, efetuou-se o silenciamento de RalGPS2 em linha celulares de cancro da próstata (DU145 e PC3) e de cancro do pulmão (A549) em combinação com ausência de soro fetal bovino (FBS) do meio de cultura e tratamentos com sinvastatina. Na 2ª abordagem, realizou-se uma análise de dados de transcriptómica por forma a perceber qual a expressão de RALGPS2 e o seu valor prognóstico em cancro da próstata. Para além disso, avaliou-se o nível de correlação existente entre os níveis de expressão dos genes RalGPS2, YAP1 e WWTR1 em adenocarcinoma da próstata e em tumores neuroendócrinos da próstata. Tanto a ausência de FBS como a adição de sinvastatina a 10 ou 30 µM tiveram efeito na distribuição do ciclo celular na linha DU145, induzindo o aumento do número de células em fase G1 e sua diminuição na fase S. No que respeita à indução de apoptose, apenas a concentração mais elevada a induziu nesta linha, mas a sua combinação com ausência de soro teve um efeito sinérgico. Nas condições de transfeção usadas, o silenciamento de RalGPS2 não teve um efeito claro no crescimento celular das células estudadas, apesar de se poder ter devido parcialmente a ter sido usad0 um controlo de transfeção com elevada toxicidade inespecífica, e parte devido ao silenciamento incompleto do gene alvo. Quanto à sua combinação com a remoção de soro ou sinvastatina, o efeito foi maioritariamente aditivo. Contudo, este efeito não foi específico se comparado com o siRNA usado como controlo, ficando a dúvida se por não se ter usado o controlo correto. Na linha A549 verificou-se que a combinação do silenciamento com a uma baixa concentração de sinvastatina, sem efeito por si só, teve um ligeiro efeito sinérgico de inibição do crescimento celular, apesar de não se terem detetado efeitos sinérgicos na indução e apoptose ou na distribuição do ciclo celular. No que respeita à análise de transcriptómica realizada, não se detetou valor prognóstico significativo na expressão de RalGPS2 em cancro da próstata, mas verificou-se existirem evidências de uma correlação muito forte entre a expressão de YAP1 e RalGPS2 específica quer de tecido saudável, adenocarcinomas e tumores neuroendócrinos da próstata.
id RCAP_96b22e9f18eb981cd39d6024fbdb1144
oai_identifier_str oai:ubibliorum.ubi.pt:10400.6/13045
network_acronym_str RCAP
network_name_str Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
repository_id_str 7160
spelling Avaliação do impacto dos níveis de expressão de RalGPS2 em cancro do pulmão e da próstataA549ApoptoseCancro da PróstataCancro do PulmãoCiclo CelularDu145Pc3Ralgps2TranscriptómicaTumores NeuroendócrinosYap1/TazDomínio/Área Científica::Ciências Médicas::Ciências BiomédicasO cancro da próstata é o que mais afeta homens, sendo de todos os tipos de cancro o segundo mais frequente a nível mundial. Por outro lado, o cancro do pulmão é o mais letal. O forte impacto destas doenças a nível mundial continua a impulsionar a investigação científica sobre o seu desenvolvimento e progressão, bem como sobre o seu tratamento. A sobreativação dos cofatores transcricionais YAP/TAZ, regulados negativamente pela via supressora tumoral Hippo, tem sido associada a diversos tipos de cancro, incluindo cancro da próstata, promovendo a proliferação celular. Além disso, RalGPS2 é um fator de troca de nucleotídeos de guanina e o seu silenciamento tem demonstrado ter a capacidade de diminuir a proliferação de células tumorais, mas o mecanismo não foi totalmente esclarecido. Recentemente, foi demonstrado que o aumento da sua expressão está associado a mau prognóstico dos doentes com adenocarcinoma do pulmão, o que reforça o interesse de prosseguir com a investigação do seu papel em células tumorais. Assim, este estudo teve como objetivos principais procurar evidências de uma possível interação entre RalGPS2 e os cofatores de transcrição YAP/TAZ no cancro da próstata. Este objectivo foi atingido quer por uma abordagem experimental, avaliando o silenciamento de RalGPS2 em combinação com tratamentos que levam à inativação de YAP/TAZ, quer através de uma abordagem bioinformática, explorando dados de transcriptómica de tumores de acesso livre. Na primeira abordagem, efetuou-se o silenciamento de RalGPS2 em linha celulares de cancro da próstata (DU145 e PC3) e de cancro do pulmão (A549) em combinação com ausência de soro fetal bovino (FBS) do meio de cultura e tratamentos com sinvastatina. Na 2ª abordagem, realizou-se uma análise de dados de transcriptómica por forma a perceber qual a expressão de RALGPS2 e o seu valor prognóstico em cancro da próstata. Para além disso, avaliou-se o nível de correlação existente entre os níveis de expressão dos genes RalGPS2, YAP1 e WWTR1 em adenocarcinoma da próstata e em tumores neuroendócrinos da próstata. Tanto a ausência de FBS como a adição de sinvastatina a 10 ou 30 µM tiveram efeito na distribuição do ciclo celular na linha DU145, induzindo o aumento do número de células em fase G1 e sua diminuição na fase S. No que respeita à indução de apoptose, apenas a concentração mais elevada a induziu nesta linha, mas a sua combinação com ausência de soro teve um efeito sinérgico. Nas condições de transfeção usadas, o silenciamento de RalGPS2 não teve um efeito claro no crescimento celular das células estudadas, apesar de se poder ter devido parcialmente a ter sido usad0 um controlo de transfeção com elevada toxicidade inespecífica, e parte devido ao silenciamento incompleto do gene alvo. Quanto à sua combinação com a remoção de soro ou sinvastatina, o efeito foi maioritariamente aditivo. Contudo, este efeito não foi específico se comparado com o siRNA usado como controlo, ficando a dúvida se por não se ter usado o controlo correto. Na linha A549 verificou-se que a combinação do silenciamento com a uma baixa concentração de sinvastatina, sem efeito por si só, teve um ligeiro efeito sinérgico de inibição do crescimento celular, apesar de não se terem detetado efeitos sinérgicos na indução e apoptose ou na distribuição do ciclo celular. No que respeita à análise de transcriptómica realizada, não se detetou valor prognóstico significativo na expressão de RalGPS2 em cancro da próstata, mas verificou-se existirem evidências de uma correlação muito forte entre a expressão de YAP1 e RalGPS2 específica quer de tecido saudável, adenocarcinomas e tumores neuroendócrinos da próstata.Prostate cancer is the one that most affects men, being the second most common of all types of cancer worldwide. On the other hand, lung cancer is the most lethal. The strong impact of these diseases worldwide continues to drive scientific research into their development and progression as well as their treatment. Overactivation of transcriptional cofactors YAP/TAZ, downregulated by the Hippo tumor suppressor pathway has been associated with several types of cancer, including prostate cancer, promoting cell proliferation. Furthermore, RalGPS2 is a guanine nucleotide exchange factor and its silencing has been shown to have the ability to decrease tumor cell proliferation, but the mechanism has not been fully clarified. It has recently been shown that the increase in its expression is associated with a worse prognosis in patients with lung adenocarcinoma which reinforces the interest in continuing with the investigation of its role in tumor cells. The main objectives of this study were to look for evidence of a possible interaction between RalGPS2 and YAP/TAZ transcriptional cofactors in prostate cancer. This was achieved both by an experimental approach, evaluating RalGPS2 silencing in combination with treatments that lead to YAP1/TAZ inactivation, and through a bioinformatics approach exploring open access tumor transcriptomics data. In the first approach RalGPS2 was silenced in prostate cancer (DU145 and PC3) and lung cancer (A549) cell lines in combination with privation of fetal bovine serum (FBS) from the culture medium and treatments with simvastatin. In the second approach, an analysis of transcriptomics data was performed to understand the expression of RALGPS2 and its prognostic value in prostate cancer. Furthermore, the level of correlation between the expression levels of RalGPS2, YAP1 and WWTR1 genes in prostate adenocarcinoma and in prostate neuroendocrine tumors was evaluated. Both the privation of FBS and the addition of 10 or 30 µM simvastatin had an effect on the cell cycle distribution in the DU145 line, inducing an increase in the number of cells in G1 phase and their decrease in S phase. Only the highest concentration induced apoptosis in this cell line but its combination with privation of serum had a synergistic effect. Under the transfection conditions used, RalGPS2 silencing did not have a clear effect on cell growth in the cells studied, although this may have been partly due to the use of a transfection control with high nonspecific toxicity and partly due to incomplete silencing of the target gene. As for its combination with serum removal or simvastatin, the effect was mostly additive but not specific compared to the siRNA used as a control, but it remains to be seen whether the correct control was used. In line A549 it was found that the combination of silencing with a low concentration of simvastatin without effect by itself had a slight synergistic effect of inhibiting cell growth although no synergistic effects were detected in induction and apoptosis or in the cell cycle distribution. Regarding the transcriptomic analysis performed no significant prognostic value was detected in the expression of RalGPS2 in prostate cancer but there was evidence of a very strong correlation between the expression of YAP1 and RalGPS2 specific to healthy tissue, adenocarcinomas and neuroendocrine tumors of the prostate.Santos, Adriana Oliveira dosuBibliorumDiniz, Catarina Isabel da Poça2023-02-20T16:24:20Z2022-11-222022-10-102022-11-22T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10400.6/13045TID:203220005porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2023-12-15T09:56:28Zoai:ubibliorum.ubi.pt:10400.6/13045Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-20T00:52:33.541219Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse
dc.title.none.fl_str_mv Avaliação do impacto dos níveis de expressão de RalGPS2 em cancro do pulmão e da próstata
title Avaliação do impacto dos níveis de expressão de RalGPS2 em cancro do pulmão e da próstata
spellingShingle Avaliação do impacto dos níveis de expressão de RalGPS2 em cancro do pulmão e da próstata
Diniz, Catarina Isabel da Poça
A549
Apoptose
Cancro da Próstata
Cancro do Pulmão
Ciclo Celular
Du145
Pc3
Ralgps2
Transcriptómica
Tumores Neuroendócrinos
Yap1/Taz
Domínio/Área Científica::Ciências Médicas::Ciências Biomédicas
title_short Avaliação do impacto dos níveis de expressão de RalGPS2 em cancro do pulmão e da próstata
title_full Avaliação do impacto dos níveis de expressão de RalGPS2 em cancro do pulmão e da próstata
title_fullStr Avaliação do impacto dos níveis de expressão de RalGPS2 em cancro do pulmão e da próstata
title_full_unstemmed Avaliação do impacto dos níveis de expressão de RalGPS2 em cancro do pulmão e da próstata
title_sort Avaliação do impacto dos níveis de expressão de RalGPS2 em cancro do pulmão e da próstata
author Diniz, Catarina Isabel da Poça
author_facet Diniz, Catarina Isabel da Poça
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Santos, Adriana Oliveira dos
uBibliorum
dc.contributor.author.fl_str_mv Diniz, Catarina Isabel da Poça
dc.subject.por.fl_str_mv A549
Apoptose
Cancro da Próstata
Cancro do Pulmão
Ciclo Celular
Du145
Pc3
Ralgps2
Transcriptómica
Tumores Neuroendócrinos
Yap1/Taz
Domínio/Área Científica::Ciências Médicas::Ciências Biomédicas
topic A549
Apoptose
Cancro da Próstata
Cancro do Pulmão
Ciclo Celular
Du145
Pc3
Ralgps2
Transcriptómica
Tumores Neuroendócrinos
Yap1/Taz
Domínio/Área Científica::Ciências Médicas::Ciências Biomédicas
description O cancro da próstata é o que mais afeta homens, sendo de todos os tipos de cancro o segundo mais frequente a nível mundial. Por outro lado, o cancro do pulmão é o mais letal. O forte impacto destas doenças a nível mundial continua a impulsionar a investigação científica sobre o seu desenvolvimento e progressão, bem como sobre o seu tratamento. A sobreativação dos cofatores transcricionais YAP/TAZ, regulados negativamente pela via supressora tumoral Hippo, tem sido associada a diversos tipos de cancro, incluindo cancro da próstata, promovendo a proliferação celular. Além disso, RalGPS2 é um fator de troca de nucleotídeos de guanina e o seu silenciamento tem demonstrado ter a capacidade de diminuir a proliferação de células tumorais, mas o mecanismo não foi totalmente esclarecido. Recentemente, foi demonstrado que o aumento da sua expressão está associado a mau prognóstico dos doentes com adenocarcinoma do pulmão, o que reforça o interesse de prosseguir com a investigação do seu papel em células tumorais. Assim, este estudo teve como objetivos principais procurar evidências de uma possível interação entre RalGPS2 e os cofatores de transcrição YAP/TAZ no cancro da próstata. Este objectivo foi atingido quer por uma abordagem experimental, avaliando o silenciamento de RalGPS2 em combinação com tratamentos que levam à inativação de YAP/TAZ, quer através de uma abordagem bioinformática, explorando dados de transcriptómica de tumores de acesso livre. Na primeira abordagem, efetuou-se o silenciamento de RalGPS2 em linha celulares de cancro da próstata (DU145 e PC3) e de cancro do pulmão (A549) em combinação com ausência de soro fetal bovino (FBS) do meio de cultura e tratamentos com sinvastatina. Na 2ª abordagem, realizou-se uma análise de dados de transcriptómica por forma a perceber qual a expressão de RALGPS2 e o seu valor prognóstico em cancro da próstata. Para além disso, avaliou-se o nível de correlação existente entre os níveis de expressão dos genes RalGPS2, YAP1 e WWTR1 em adenocarcinoma da próstata e em tumores neuroendócrinos da próstata. Tanto a ausência de FBS como a adição de sinvastatina a 10 ou 30 µM tiveram efeito na distribuição do ciclo celular na linha DU145, induzindo o aumento do número de células em fase G1 e sua diminuição na fase S. No que respeita à indução de apoptose, apenas a concentração mais elevada a induziu nesta linha, mas a sua combinação com ausência de soro teve um efeito sinérgico. Nas condições de transfeção usadas, o silenciamento de RalGPS2 não teve um efeito claro no crescimento celular das células estudadas, apesar de se poder ter devido parcialmente a ter sido usad0 um controlo de transfeção com elevada toxicidade inespecífica, e parte devido ao silenciamento incompleto do gene alvo. Quanto à sua combinação com a remoção de soro ou sinvastatina, o efeito foi maioritariamente aditivo. Contudo, este efeito não foi específico se comparado com o siRNA usado como controlo, ficando a dúvida se por não se ter usado o controlo correto. Na linha A549 verificou-se que a combinação do silenciamento com a uma baixa concentração de sinvastatina, sem efeito por si só, teve um ligeiro efeito sinérgico de inibição do crescimento celular, apesar de não se terem detetado efeitos sinérgicos na indução e apoptose ou na distribuição do ciclo celular. No que respeita à análise de transcriptómica realizada, não se detetou valor prognóstico significativo na expressão de RalGPS2 em cancro da próstata, mas verificou-se existirem evidências de uma correlação muito forte entre a expressão de YAP1 e RalGPS2 específica quer de tecido saudável, adenocarcinomas e tumores neuroendócrinos da próstata.
publishDate 2022
dc.date.none.fl_str_mv 2022-11-22
2022-10-10
2022-11-22T00:00:00Z
2023-02-20T16:24:20Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10400.6/13045
TID:203220005
url http://hdl.handle.net/10400.6/13045
identifier_str_mv TID:203220005
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
instacron:RCAAP
instname_str Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
instacron_str RCAAP
institution RCAAP
reponame_str Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
collection Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
repository.name.fl_str_mv Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1799136413616177152