Contribuição de mutações genéticas no gene gyrA para a resistência a fluoroquinolonas por Arcobacter butzleri
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2018 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/10400.6/9993 |
Resumo: | Arcobacter butzleri é considerado o quarto agente de Campylobacter-like organism isolado a partir de amostras diarreicas em humanos. As fluoroquinolonas são normalmente utilizadas na primeira linha de tratamento de infeções severas causadas por Arcobacter spp.. A elevada frequência de resistência a esta classe de antibióticos observada em A. butzleri poderá constituir uma grande preocupação para a saúde pública. Assim, este trabalho tem como objetivo avaliar os mecanismos de resistência às fluoroquinolonas em A. butzleri, tendo como foco a contribuição de mutações espontâneas, bem como na sua diversidade, e no papel das bombas de efluxo. Inicialmente procedeu-se à determinação da concentração mínima inibitória (CMI) de estirpes suscetíveis a três fluoroquinolonas (ciprofloxacina, levofloxacina e moxifloxacina). Através do ensaio de flutuação foi determinada uma taxa média de mutação espontânea de 2.34x10-9 ± 1.72x10-9 para todas as estirpes de A. butzleri estudadas. Posteriormente, os mutantes foram avaliados pela determinação da concentração mínima inibitória e pela análise das mutações presentes na região determinante de resistência às quinolonas (RDRQ) dos genes gyrA e gyrB através da amplificação e sequenciação destas regiões. Todos os mutantes avaliados apresentaram resistência às fluoroquinolonas, tendo sido identificadas três mutações pontuais, uma já descrita para esta resistência em A. butzleri, a mutação Thr85Ile (C254T), e duas novas mutações nunca descritas em A. Butzleri, Asp89Asn e Asp89Gli (G265A e A266G respetivamente) na RDRQ da gyrA, associada à resistência, mas sem correlação com o valor de CMI. A influência do gene gyrB na resistência às fluoroquinolonas em A. butzleri foi também estudada, porém não foi verificada. Quando não foi observada relação entre resistência e mutação pontual no gene gyrA, os resultados sugerem um contributo das bombas de efluxo na resistência às fluoroquinolonas por parte de membros de A. butzleri. A transformação de uma estirpe suscetível permitiu validar o papel da mutação C254T na RDRQ do gene gyrA. Verificou-se ainda que a presença desta mutação, espontânea ou por transformação, parece não afetar a robustez de A. butzleri. Assim, os resultados sugerem que as mutações encontradas nos codões 85 e 89 da RDRQ da gyrA bem como a ação das bombas de efluxo estão na base da resistência às fluoroquinolonas. |
id |
RCAP_a32f10b8c64ec23a09079a15c5d6dbc7 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:ubibliorum.ubi.pt:10400.6/9993 |
network_acronym_str |
RCAP |
network_name_str |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
repository_id_str |
7160 |
spelling |
Contribuição de mutações genéticas no gene gyrA para a resistência a fluoroquinolonas por Arcobacter butzleriArcobacter ButzleriDna GiraseFluoroquinolonasMutações GyraResistênciaDomínio/Área Científica::Ciências Médicas::Ciências BiomédicasArcobacter butzleri é considerado o quarto agente de Campylobacter-like organism isolado a partir de amostras diarreicas em humanos. As fluoroquinolonas são normalmente utilizadas na primeira linha de tratamento de infeções severas causadas por Arcobacter spp.. A elevada frequência de resistência a esta classe de antibióticos observada em A. butzleri poderá constituir uma grande preocupação para a saúde pública. Assim, este trabalho tem como objetivo avaliar os mecanismos de resistência às fluoroquinolonas em A. butzleri, tendo como foco a contribuição de mutações espontâneas, bem como na sua diversidade, e no papel das bombas de efluxo. Inicialmente procedeu-se à determinação da concentração mínima inibitória (CMI) de estirpes suscetíveis a três fluoroquinolonas (ciprofloxacina, levofloxacina e moxifloxacina). Através do ensaio de flutuação foi determinada uma taxa média de mutação espontânea de 2.34x10-9 ± 1.72x10-9 para todas as estirpes de A. butzleri estudadas. Posteriormente, os mutantes foram avaliados pela determinação da concentração mínima inibitória e pela análise das mutações presentes na região determinante de resistência às quinolonas (RDRQ) dos genes gyrA e gyrB através da amplificação e sequenciação destas regiões. Todos os mutantes avaliados apresentaram resistência às fluoroquinolonas, tendo sido identificadas três mutações pontuais, uma já descrita para esta resistência em A. butzleri, a mutação Thr85Ile (C254T), e duas novas mutações nunca descritas em A. Butzleri, Asp89Asn e Asp89Gli (G265A e A266G respetivamente) na RDRQ da gyrA, associada à resistência, mas sem correlação com o valor de CMI. A influência do gene gyrB na resistência às fluoroquinolonas em A. butzleri foi também estudada, porém não foi verificada. Quando não foi observada relação entre resistência e mutação pontual no gene gyrA, os resultados sugerem um contributo das bombas de efluxo na resistência às fluoroquinolonas por parte de membros de A. butzleri. A transformação de uma estirpe suscetível permitiu validar o papel da mutação C254T na RDRQ do gene gyrA. Verificou-se ainda que a presença desta mutação, espontânea ou por transformação, parece não afetar a robustez de A. butzleri. Assim, os resultados sugerem que as mutações encontradas nos codões 85 e 89 da RDRQ da gyrA bem como a ação das bombas de efluxo estão na base da resistência às fluoroquinolonas.Arcobacter butzleri is the fourth Campylobacter-like organism found in human diarrhoeal disease samples. The first line treatment for severe infections by Arcobacter spp. is based in the use of fluoroquinolones. The high frequency of resistance to this class of antibiotics found in A. butzleri strains could raise a significant public health concern. Thus, this work aimed to evaluate the mechanisms of resistance to fluoroquinolone in A. butzleri, with focus in the contribution of spontaneous mutations and their diversity, also in the contribution of efflux pumps. Firstly, the minimal inhibitory concentration (MIC) of the susceptible strains to three fluoroquinolones (ciprofloxacin, levofloxacin, and moxifloxacin) was determined. The spontaneous mutation rate was then calculated by a fluctuation assay procedure, where all the tested A. butzleri strains had an average rate of around 2.34x10-9 ± 1.72x10-9. After, the MIC for A. butzleri mutants derived from this assay was determined, followed by the analysis of target mutations in the quinolone resistance determining region (QRDR) of gyrA and gyrB through amplification and sequencing of these regions. The mutants were confirmed to be fluoroquinolone-resistant, where three different single point mutations were identified in QRDR of gyrA, one previously described to A. butzleri the mutation Thr85Ile (C254T), and two new mutations correlated with the fluoroquinolone resistance in A. butzleri Asp89Asn and Asp89Gli (G265A and A266G respectively); however with no direct correlation with the MIC value was found. The influence of gyrB in fluoroquinolone-resistance in A. butzleri was not confirmed. Nonetheless, for the cases where no point mutation was found in the gyrA gene, the obtained results suggest an influence of efflux pumps to fluoroquinolone-resistance. The role of C254T point mutation in gyrA QRDR was validated by transformation of a susceptible strain. The presence of this mutation, either arising spontaneously or by transformation, does not seem to have a cost to the fitness of A. butzleri. In sum, the results propose the mutations found in codons 85 and 89 of QRDR of gyrA, as well as, the action of efflux pumps as mechanisms behind the fluoroquinolone resistance in A. butzleri strains.Ferreira, Susana Margarida ParaísoDomingues, Fernanda da ConceiçãouBibliorumAlves, Ana Rita Martins2020-03-11T17:24:02Z2018-11-052018-10-082018-11-05T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10400.6/9993TID:202353966porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2023-12-15T09:51:22Zoai:ubibliorum.ubi.pt:10400.6/9993Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-20T00:50:03.845599Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse |
dc.title.none.fl_str_mv |
Contribuição de mutações genéticas no gene gyrA para a resistência a fluoroquinolonas por Arcobacter butzleri |
title |
Contribuição de mutações genéticas no gene gyrA para a resistência a fluoroquinolonas por Arcobacter butzleri |
spellingShingle |
Contribuição de mutações genéticas no gene gyrA para a resistência a fluoroquinolonas por Arcobacter butzleri Alves, Ana Rita Martins Arcobacter Butzleri Dna Girase Fluoroquinolonas Mutações Gyra Resistência Domínio/Área Científica::Ciências Médicas::Ciências Biomédicas |
title_short |
Contribuição de mutações genéticas no gene gyrA para a resistência a fluoroquinolonas por Arcobacter butzleri |
title_full |
Contribuição de mutações genéticas no gene gyrA para a resistência a fluoroquinolonas por Arcobacter butzleri |
title_fullStr |
Contribuição de mutações genéticas no gene gyrA para a resistência a fluoroquinolonas por Arcobacter butzleri |
title_full_unstemmed |
Contribuição de mutações genéticas no gene gyrA para a resistência a fluoroquinolonas por Arcobacter butzleri |
title_sort |
Contribuição de mutações genéticas no gene gyrA para a resistência a fluoroquinolonas por Arcobacter butzleri |
author |
Alves, Ana Rita Martins |
author_facet |
Alves, Ana Rita Martins |
author_role |
author |
dc.contributor.none.fl_str_mv |
Ferreira, Susana Margarida Paraíso Domingues, Fernanda da Conceição uBibliorum |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Alves, Ana Rita Martins |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Arcobacter Butzleri Dna Girase Fluoroquinolonas Mutações Gyra Resistência Domínio/Área Científica::Ciências Médicas::Ciências Biomédicas |
topic |
Arcobacter Butzleri Dna Girase Fluoroquinolonas Mutações Gyra Resistência Domínio/Área Científica::Ciências Médicas::Ciências Biomédicas |
description |
Arcobacter butzleri é considerado o quarto agente de Campylobacter-like organism isolado a partir de amostras diarreicas em humanos. As fluoroquinolonas são normalmente utilizadas na primeira linha de tratamento de infeções severas causadas por Arcobacter spp.. A elevada frequência de resistência a esta classe de antibióticos observada em A. butzleri poderá constituir uma grande preocupação para a saúde pública. Assim, este trabalho tem como objetivo avaliar os mecanismos de resistência às fluoroquinolonas em A. butzleri, tendo como foco a contribuição de mutações espontâneas, bem como na sua diversidade, e no papel das bombas de efluxo. Inicialmente procedeu-se à determinação da concentração mínima inibitória (CMI) de estirpes suscetíveis a três fluoroquinolonas (ciprofloxacina, levofloxacina e moxifloxacina). Através do ensaio de flutuação foi determinada uma taxa média de mutação espontânea de 2.34x10-9 ± 1.72x10-9 para todas as estirpes de A. butzleri estudadas. Posteriormente, os mutantes foram avaliados pela determinação da concentração mínima inibitória e pela análise das mutações presentes na região determinante de resistência às quinolonas (RDRQ) dos genes gyrA e gyrB através da amplificação e sequenciação destas regiões. Todos os mutantes avaliados apresentaram resistência às fluoroquinolonas, tendo sido identificadas três mutações pontuais, uma já descrita para esta resistência em A. butzleri, a mutação Thr85Ile (C254T), e duas novas mutações nunca descritas em A. Butzleri, Asp89Asn e Asp89Gli (G265A e A266G respetivamente) na RDRQ da gyrA, associada à resistência, mas sem correlação com o valor de CMI. A influência do gene gyrB na resistência às fluoroquinolonas em A. butzleri foi também estudada, porém não foi verificada. Quando não foi observada relação entre resistência e mutação pontual no gene gyrA, os resultados sugerem um contributo das bombas de efluxo na resistência às fluoroquinolonas por parte de membros de A. butzleri. A transformação de uma estirpe suscetível permitiu validar o papel da mutação C254T na RDRQ do gene gyrA. Verificou-se ainda que a presença desta mutação, espontânea ou por transformação, parece não afetar a robustez de A. butzleri. Assim, os resultados sugerem que as mutações encontradas nos codões 85 e 89 da RDRQ da gyrA bem como a ação das bombas de efluxo estão na base da resistência às fluoroquinolonas. |
publishDate |
2018 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2018-11-05 2018-10-08 2018-11-05T00:00:00Z 2020-03-11T17:24:02Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
format |
masterThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://hdl.handle.net/10400.6/9993 TID:202353966 |
url |
http://hdl.handle.net/10400.6/9993 |
identifier_str_mv |
TID:202353966 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação instacron:RCAAP |
instname_str |
Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação |
instacron_str |
RCAAP |
institution |
RCAAP |
reponame_str |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
collection |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação |
repository.mail.fl_str_mv |
|
_version_ |
1799136390971129856 |