Subtipificação molecular do vírus da imunodeficiência felina em Portugal Continental e Açores
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2015 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/10400.5/10770 |
Resumo: | Dissertação de Mestrado Integrado em Medicina Veterinária |
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Subtipificação molecular do vírus da imunodeficiência felina em Portugal Continental e Açoresanálise filogenéticaAçoresdiversidade genéticafelinosPortugal Continentalvírus da imunodeficiência felinasubtipificação molecularsubtiposAzorescatsfeline immunodeficiency virusgenetic diversitymainland Portugalmolecular subtypingphylogenetic analysissubtypesDissertação de Mestrado Integrado em Medicina VeterináriaObjetivo: Determinar a diversidade genética do vírus da imunodeficiência felina (FIV) numa amostra populacional de felinos seropositivos de Portugal Continental e Açores. Métodos: O DNA proviral de 82 amostras de sangue total de felinos seropositivos foi isolado e posteriormente amplificado um fragmento correspondente aos domínios mais variáveis do gene env (V3-V5), pela técnica da reação em cadeia pela polimerase (polimerase chain reaction, PCR). A amplificação foi confirmada pela visualização do fragmento em géis de eletroforese. Os produtos purificados foram diretamente sequenciados. Foi realizada uma análise filogenética, comparando as novas sequências obtidas com sequências representativas dos diferentes subtipos. Resultados: A região V3-V5 foi amplificada e sequenciada com sucesso em 49 amostras, das quais 31 agruparam no subtipo B, 11 no subtipo A, 6 no subtipo E e 1 no subtipo F. Conclusão: O subtipo B é o mais comum em Portugal e o único detetado nos Açores. A diversidade genética entre subtipos e dentro do subtipo B é crescente. Este é o primeiro estudo que relata a presença do subtipo E no país. Estudos posteriores noutros centros urbanos e ilhas poderão fornecer mais informação útil sobre a diversidade filogenética de FIV em Portugal.ABSTRACT - Objective: To determine the genetic diversity of feline immunodeficiency virus (FIV) in a sample of FIV-positive cats in mainland Portugal and Azores. Methods: Proviral DNA was isolated from 82 samples and subsequently amplified by polymerase chain reaction (PCR) to yield a fragment corresponding to the high variable regions of the env gene (V3-V5). Amplification was confirmed by the fragment visualization in electrophoresis gels. The purified products were directly sequenced. Phylogenetic analysis was performed and comparisons made with previously characterized sequences of the different subtypes. Results: The V3-V5 region was successfully amplified in 49 samples. The new sequences were found to cluster in 4 subtypes: 31 samples clustered with subtype B sequences, 11 with subtype A, 6 with subtype E and 1 with subtype F. Conclusions: Subtype B is the most common in Portugal and the only one detected in Azores. Genetic diversity between subtypes and within the subtype B is increasing. This is the first study that reports the presence of subtype E in Portugal. Further studies in other urban centers and islands may provide more useful information about the phylogenetic diversity of FIV in Portugal.Universidade de Lisboa. Faculdade de Medicina VeterináriaDuarte, Ana Isabel Simões PereiraRepositório da Universidade de LisboaLeal, Inês Pereira Marques2016-01-26T16:53:59Z2015-11-252015-11-25T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10400.5/10770TID:201127571porLeal, I.P.M. (2015). Subtipificação molecular do vírus da imunodeficiência felina em Portugal Continental e Açores. Dissertação de mestrado. Universidade de Lisboa, Faculdade de Medicina Veterinária, Lisboa.info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2023-03-06T14:41:04Zoai:www.repository.utl.pt:10400.5/10770Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-19T16:57:10.719398Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse |
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