Development of a multiplex PCR tool for screening of pathogens in teleost farmed fish
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2015 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | eng |
Título da fonte: | Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/10400.8/1677 |
Resumo: | A aquacultura desempenha um papel cada vez mais importante na produção de alimentos em todo o mundo (Martins et al., 2015). Espécies dos géneros Aeromonas, Vibrio, Edwardsiella e Streptococcus são patógenos que infetam peixes (Zhang et al., 2014), causando elevadas perdas económicas em aquacultura. A corvina (Argyrosomus regius, Asso, 1801) é um dos maiores peixes da família Sciaenidae a nível mundial, e uma espécie de elevado valor comercial no Sudoeste da Europa, sendo neste momento objeto de grande interesse em todo o Mediterrâneo visando a sua produção comercial (Amoedo, 2011). Devido à sua elevada fertilidade, ampla distribuição e boa aceitação por parte dos consumidores torna-se um bom candidato à produção em aquacultura podendo atingir preços de mercado médio-altos (6 euros/kg, INE 2010). Como ainda não foram reportadas manifestações patológicas relevantes nesta espécie, o principal método de prevenção é o controlo da densidade nos tanques, sendo necessário pesquisar eventuais patógenos que afetem a corvina em diferentes estádios do seu ciclo e mesmo em condições de stress. O objetivo deste estudo foi o desenvolvimento de uma ferramenta de multiplex- PCR para a deteção precoce de Edwardsiella tarda, Photobacterium damselae subsp. piscicida, Vibrio alginolyticus, Vibrio anguillarum e Vibrio harveyi em peixes de aquacultura, incluindo a corvina, que permita de forma prática e eficiente a deteção destes patógenos. Concluiu-se que é possível através de ferramentas de multiplex-PCR, a deteção dos patogénicos Edwardsiella tarda, Vibrio alginolyticus, Vibrio anguillarum e Vibrio harveyi até um limite mínimo de 0,4 ng de DNA/μl para V. anguillarum; 0.5 ng/μl para E. tarda; 1.5 ng/μl para V. harveyi e 5.6 ng/μl para V. alginolyticus, podendo, no futuro, estas técnicas ter aplicação prática cada vez mais extensa. |
id |
RCAP_b4692d38f3ea3dbc4b017ba82ec555d0 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:iconline.ipleiria.pt:10400.8/1677 |
network_acronym_str |
RCAP |
network_name_str |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
repository_id_str |
7160 |
spelling |
Development of a multiplex PCR tool for screening of pathogens in teleost farmed fishArgyrosomus regiusAquaculturadiagnóstico de doençasmultiplex-PCRDomínio/Área Científica::Engenharia e TecnologiaA aquacultura desempenha um papel cada vez mais importante na produção de alimentos em todo o mundo (Martins et al., 2015). Espécies dos géneros Aeromonas, Vibrio, Edwardsiella e Streptococcus são patógenos que infetam peixes (Zhang et al., 2014), causando elevadas perdas económicas em aquacultura. A corvina (Argyrosomus regius, Asso, 1801) é um dos maiores peixes da família Sciaenidae a nível mundial, e uma espécie de elevado valor comercial no Sudoeste da Europa, sendo neste momento objeto de grande interesse em todo o Mediterrâneo visando a sua produção comercial (Amoedo, 2011). Devido à sua elevada fertilidade, ampla distribuição e boa aceitação por parte dos consumidores torna-se um bom candidato à produção em aquacultura podendo atingir preços de mercado médio-altos (6 euros/kg, INE 2010). Como ainda não foram reportadas manifestações patológicas relevantes nesta espécie, o principal método de prevenção é o controlo da densidade nos tanques, sendo necessário pesquisar eventuais patógenos que afetem a corvina em diferentes estádios do seu ciclo e mesmo em condições de stress. O objetivo deste estudo foi o desenvolvimento de uma ferramenta de multiplex- PCR para a deteção precoce de Edwardsiella tarda, Photobacterium damselae subsp. piscicida, Vibrio alginolyticus, Vibrio anguillarum e Vibrio harveyi em peixes de aquacultura, incluindo a corvina, que permita de forma prática e eficiente a deteção destes patógenos. Concluiu-se que é possível através de ferramentas de multiplex-PCR, a deteção dos patogénicos Edwardsiella tarda, Vibrio alginolyticus, Vibrio anguillarum e Vibrio harveyi até um limite mínimo de 0,4 ng de DNA/μl para V. anguillarum; 0.5 ng/μl para E. tarda; 1.5 ng/μl para V. harveyi e 5.6 ng/μl para V. alginolyticus, podendo, no futuro, estas técnicas ter aplicação prática cada vez mais extensa.Afonso, Clélia Paulete Correia NevesBaptista, Teresa Maria CoelhoIC-OnlinePinto, Micaela Ferreira2016-03-18T11:08:02Z2015-12-162015-12-16T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10400.8/1677TID:201089424enginfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2024-01-17T15:43:28Zoai:iconline.ipleiria.pt:10400.8/1677Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-20T01:46:14.325286Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse |
dc.title.none.fl_str_mv |
Development of a multiplex PCR tool for screening of pathogens in teleost farmed fish |
title |
Development of a multiplex PCR tool for screening of pathogens in teleost farmed fish |
spellingShingle |
Development of a multiplex PCR tool for screening of pathogens in teleost farmed fish Pinto, Micaela Ferreira Argyrosomus regius Aquacultura diagnóstico de doenças multiplex-PCR Domínio/Área Científica::Engenharia e Tecnologia |
title_short |
Development of a multiplex PCR tool for screening of pathogens in teleost farmed fish |
title_full |
Development of a multiplex PCR tool for screening of pathogens in teleost farmed fish |
title_fullStr |
Development of a multiplex PCR tool for screening of pathogens in teleost farmed fish |
title_full_unstemmed |
Development of a multiplex PCR tool for screening of pathogens in teleost farmed fish |
title_sort |
Development of a multiplex PCR tool for screening of pathogens in teleost farmed fish |
author |
Pinto, Micaela Ferreira |
author_facet |
Pinto, Micaela Ferreira |
author_role |
author |
dc.contributor.none.fl_str_mv |
Afonso, Clélia Paulete Correia Neves Baptista, Teresa Maria Coelho IC-Online |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Pinto, Micaela Ferreira |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Argyrosomus regius Aquacultura diagnóstico de doenças multiplex-PCR Domínio/Área Científica::Engenharia e Tecnologia |
topic |
Argyrosomus regius Aquacultura diagnóstico de doenças multiplex-PCR Domínio/Área Científica::Engenharia e Tecnologia |
description |
A aquacultura desempenha um papel cada vez mais importante na produção de alimentos em todo o mundo (Martins et al., 2015). Espécies dos géneros Aeromonas, Vibrio, Edwardsiella e Streptococcus são patógenos que infetam peixes (Zhang et al., 2014), causando elevadas perdas económicas em aquacultura. A corvina (Argyrosomus regius, Asso, 1801) é um dos maiores peixes da família Sciaenidae a nível mundial, e uma espécie de elevado valor comercial no Sudoeste da Europa, sendo neste momento objeto de grande interesse em todo o Mediterrâneo visando a sua produção comercial (Amoedo, 2011). Devido à sua elevada fertilidade, ampla distribuição e boa aceitação por parte dos consumidores torna-se um bom candidato à produção em aquacultura podendo atingir preços de mercado médio-altos (6 euros/kg, INE 2010). Como ainda não foram reportadas manifestações patológicas relevantes nesta espécie, o principal método de prevenção é o controlo da densidade nos tanques, sendo necessário pesquisar eventuais patógenos que afetem a corvina em diferentes estádios do seu ciclo e mesmo em condições de stress. O objetivo deste estudo foi o desenvolvimento de uma ferramenta de multiplex- PCR para a deteção precoce de Edwardsiella tarda, Photobacterium damselae subsp. piscicida, Vibrio alginolyticus, Vibrio anguillarum e Vibrio harveyi em peixes de aquacultura, incluindo a corvina, que permita de forma prática e eficiente a deteção destes patógenos. Concluiu-se que é possível através de ferramentas de multiplex-PCR, a deteção dos patogénicos Edwardsiella tarda, Vibrio alginolyticus, Vibrio anguillarum e Vibrio harveyi até um limite mínimo de 0,4 ng de DNA/μl para V. anguillarum; 0.5 ng/μl para E. tarda; 1.5 ng/μl para V. harveyi e 5.6 ng/μl para V. alginolyticus, podendo, no futuro, estas técnicas ter aplicação prática cada vez mais extensa. |
publishDate |
2015 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2015-12-16 2015-12-16T00:00:00Z 2016-03-18T11:08:02Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
format |
masterThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://hdl.handle.net/10400.8/1677 TID:201089424 |
url |
http://hdl.handle.net/10400.8/1677 |
identifier_str_mv |
TID:201089424 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
eng |
language |
eng |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação instacron:RCAAP |
instname_str |
Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação |
instacron_str |
RCAAP |
institution |
RCAAP |
reponame_str |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
collection |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação |
repository.mail.fl_str_mv |
|
_version_ |
1799136957843898368 |