Epidemiologia molecular e estudos filogenéticos de fungos dermatófitos de origem animal e humana

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Faria, Mariana Mendes
Data de Publicação: 2022
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10348/11830
Resumo: Os dermatófitos são um grupo de fungos patogénicos filamentosos que invadem e infetam tecidos queratinizados. Estes provocam dermatofitoses, que apresentam uma prevalência global de cerca de 20-25%. Este estudo tem como principal objetivo a deteção, identificação e caraterização a nível microbiológico, molecular e filogenético de dermatófitos em diferentes amostras. As amostras foram recolhidas utilizando a técnica de Mackenzie e enviadas para o Laboratório de Microbiologia Médica da UTAD, onde posteriormente foram inoculadas em Dermathophyte Test Medium (DTM) e Potato Dextrose Agar (PDA). Neste estudo, foram analisadas um total de 40 amostras, 38 amostras de origem animal e 2 de origem humana. Através da aplicação da técnica do Lactofenol com Azul de Algodão foi possível a identificação de 6 destas amostras como sendo dermatófitos (prevalência de cerca de 15%), mais especificamente da espécie Nannizzia nana e Microsporum canis. Nannizzia nana é um fungo dermatófito zoofílico e geofílico que afeta animais, principalmente suínos, enquanto, Microsporum canis é um fungo dermatófito zoofílico, frequentemente encontrado em cães e gatos, sendo os gatos considerados os hospedeiros mais importantes. Só se conseguiu isolar em cultura pura as 4 amostras de N. nana, que foram depois transferidas para água destilada esterilizada para mais tarde proceder à sua análise molecular no laboratório de Genética Molecular Aplicada da UTAD. A extração de DNA das amostras foi realizada utilizando o kit Plant/Fungi DNA Isolation Kit. De seguida foi realizada uma PCR, utilizando 14 “primers” ISSRs. Os resultados revelaram uma percentagem de polimorfismo total, de cerca de 59%, sendo que, os “primers” que apresentaram maior número de bandas foram o UBC888 e UBC889, e que um “primer” obteve 100% de polimorfismo, o UBC808. Foi também elaborado um dendrograma, a análise deste permitiu perceber que, apesar de todas as amostras serem da mesma espécie, há uma elevada variabilidade genética com uma separação evidente das 4 amostras em dois grupos principais com um coeficiente de correlação de cerca de 0,62. Este estudo permitiu aumentar os conhecimentos a nível filogenético e epidemiológico desta espécie em amostras de animais. Numa perspetiva futura, seria interessante a realização de uma identificação molecular das amostras, com recurso a sequenciação, e aumentar o número de amostras.
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Através da aplicação da técnica do Lactofenol com Azul de Algodão foi possível a identificação de 6 destas amostras como sendo dermatófitos (prevalência de cerca de 15%), mais especificamente da espécie Nannizzia nana e Microsporum canis. Nannizzia nana é um fungo dermatófito zoofílico e geofílico que afeta animais, principalmente suínos, enquanto, Microsporum canis é um fungo dermatófito zoofílico, frequentemente encontrado em cães e gatos, sendo os gatos considerados os hospedeiros mais importantes. Só se conseguiu isolar em cultura pura as 4 amostras de N. nana, que foram depois transferidas para água destilada esterilizada para mais tarde proceder à sua análise molecular no laboratório de Genética Molecular Aplicada da UTAD. A extração de DNA das amostras foi realizada utilizando o kit Plant/Fungi DNA Isolation Kit. De seguida foi realizada uma PCR, utilizando 14 “primers” ISSRs. Os resultados revelaram uma percentagem de polimorfismo total, de cerca de 59%, sendo que, os “primers” que apresentaram maior número de bandas foram o UBC888 e UBC889, e que um “primer” obteve 100% de polimorfismo, o UBC808. Foi também elaborado um dendrograma, a análise deste permitiu perceber que, apesar de todas as amostras serem da mesma espécie, há uma elevada variabilidade genética com uma separação evidente das 4 amostras em dois grupos principais com um coeficiente de correlação de cerca de 0,62. Este estudo permitiu aumentar os conhecimentos a nível filogenético e epidemiológico desta espécie em amostras de animais. Numa perspetiva futura, seria interessante a realização de uma identificação molecular das amostras, com recurso a sequenciação, e aumentar o número de amostras.Dermatophytes are a group of filamentous pathogenic fungi that invade and infect keratinized tissues. These cause dermatophytosis, which have an overall prevalence of around 20-25%. The main objective of this study is the detection, identification and characterization at the microbiological, molecular and phylogenetic level of dermatophytes in different samples. The samples were collected using the Mackenzie technique and sent to the Laboratory of Medical Microbiology at UTAD, where they were later inoculated into Dermathophyte Test Medium (DTM) and Potato Dextrose Agar (PDA). In this study, a total of 40 samples were analyzed, 38 samples of animal origin and 2 of human origin. Through the application of the Lactophenol with cotton blue technique, it was possible to identify 6 of these samples as being dermatophytes (prevalence of about 15%), more specifically of the Nannizzia nana and Microsporum canis species. Nannizzia nana is a zoophilic and geophilic dermatophyte fungus that affects animals, mainly pigs, while Microsporum canis is a zoophilic dermatophyte fungus, often found in dogs and cats, with cats considered the most important hosts. Only the 4 samples of N. nana could be isolated in pure culture, they were then transferred to sterilized distilled water to later carry out their molecular analysis in the laboratory of Applied Molecular Genetics at UTAD. DNA extraction from the samples was performed using the Plant/Fungi DNA Isolation Kit. Then, a PCR was performed, using 14 primers ISSRs. The results revealed a percentage of total polymorphism of 59%, and the "primers" that represented the highest number of bands were UBC888 and UBC889, and that UBC808 obtained 100% of polymorphism. A dendrogram was also prepared, the analysis of which showed that, despite all the samples being of the same species, there is a high genetic variability with an evident separation of the 4 samples into two main groups with a correlation coefficient of about 0.62. This study allowed increasing the knowledge at the phylogenetic and epidemiological level of this species in animal samples. From a future perspective, it would be interesting to carry out a molecular identification of the samples, using sequencing, and increase the number of samples.2023-10-24T10:00:30Z2022-07-20T00:00:00Z2022-07-20info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10348/11830pormetadata only accessinfo:eu-repo/semantics/openAccessFaria, Mariana Mendesreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2024-02-02T12:57:07Zoai:repositorio.utad.pt:10348/11830Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-20T02:06:35.061761Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse
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