Caracterização da composição de exossomas excretados a partir de modelos celulares 2D e 3D derivados de células de carcinoma colorretal sensíveis ou resistentes à doxorrubicina
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2022 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/10362/132743 |
Resumo: | O cancro é uma doença que afeta em larga escala a população humana, sendo que um dos mais se destaca pela sua malignidade é o cancro colorretal devido à sua elevada incidência e mortalidade em ambos os géneros. Resultante de uma necessidade de identificação de biomarcadores para um diagnóstico precoce da doença ou biomarcadores de resistência a agentes quimioterapêuticos uma nova tecnologia de diagnostico tem surgido, as designadas biopsias líquidas, através das quais ocorre uma obtenção de amostras biológicas de uma forma não invasiva a partir da qual são analisados componentes derivados dos tumores. Um desses componentes são os exossomas, nanovesículas membranares excretadas por todo o tipo de células, que possuem um papel essencial na comunicação celular devido à sua capacidade de modular a resposta fenotípica das células recetoras através da transferência de biomoléculas ativas tais como proteínas, ácidos nucleicos e lípidos. A presente tese teve como objetivo principal uma caracterização da composição dos exossomas em termos proteicos e de RNA excretados a partir de modelos celulares 2D e 3D derivados de células de carcinoma colorretal sensíveis ou resistentes à doxorrubicina de modo a perceber se estas nanovesículas podem possuir um papel na indução ou manutenção da resistência a fármacos entre células. Um outro objetivo focava-se na perceção do efeito da maior complexidade dos modelos 3D na composição dos exossomas tendo em conta que estes permitem uma maior mimetização do microambiente tumoral in vivo. A análise dos conteúdos proteicos mostrou que as diferenças de expressão proteica estavam, de um modo geral, associadas à proliferação celular e a organização estrutural, quer do citoesqueleto quer da matriz extracelular. Por outro lado, a análise por RNA-seq permitiu observar variações entre as condições testadas maioritariamente associadas a processos metabólicos e ao ciclo celular. A partir da integração dos resultados da proteómica com os da transcritómica foi possível concluir que as principais variações no conteúdo dos exossomas provenientes das células sensíveis e resistentes à doxorrubicina (modelos 2D) estavam correlacionadas com o crescimento celular e com a resposta a compostos orgânicos. O aumento de determinados genes envolvidos com a resposta a compostos orgânicos, como é o caso do ALDH1A3, podem ser diretamente correlacionado com a presença e resistência ao composto orgânico. Já para o caso dos exossomas derivados da linha sensível em modelos 2 e 3D, as principais diferenças nos constituintes dos exossomas entre as condições estavam relacionadas com a matriz extracelular e com processos metabólicos, que podem ser explicadas pelas diferenças no crescimento e interação celular associada a cada modelo. |
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Caracterização da composição de exossomas excretados a partir de modelos celulares 2D e 3D derivados de células de carcinoma colorretal sensíveis ou resistentes à doxorrubicinaExossomasCancro colorretalProteínasRNADomínio/Área Científica::Engenharia e Tecnologia::Outras Engenharias e TecnologiasO cancro é uma doença que afeta em larga escala a população humana, sendo que um dos mais se destaca pela sua malignidade é o cancro colorretal devido à sua elevada incidência e mortalidade em ambos os géneros. Resultante de uma necessidade de identificação de biomarcadores para um diagnóstico precoce da doença ou biomarcadores de resistência a agentes quimioterapêuticos uma nova tecnologia de diagnostico tem surgido, as designadas biopsias líquidas, através das quais ocorre uma obtenção de amostras biológicas de uma forma não invasiva a partir da qual são analisados componentes derivados dos tumores. Um desses componentes são os exossomas, nanovesículas membranares excretadas por todo o tipo de células, que possuem um papel essencial na comunicação celular devido à sua capacidade de modular a resposta fenotípica das células recetoras através da transferência de biomoléculas ativas tais como proteínas, ácidos nucleicos e lípidos. A presente tese teve como objetivo principal uma caracterização da composição dos exossomas em termos proteicos e de RNA excretados a partir de modelos celulares 2D e 3D derivados de células de carcinoma colorretal sensíveis ou resistentes à doxorrubicina de modo a perceber se estas nanovesículas podem possuir um papel na indução ou manutenção da resistência a fármacos entre células. Um outro objetivo focava-se na perceção do efeito da maior complexidade dos modelos 3D na composição dos exossomas tendo em conta que estes permitem uma maior mimetização do microambiente tumoral in vivo. A análise dos conteúdos proteicos mostrou que as diferenças de expressão proteica estavam, de um modo geral, associadas à proliferação celular e a organização estrutural, quer do citoesqueleto quer da matriz extracelular. Por outro lado, a análise por RNA-seq permitiu observar variações entre as condições testadas maioritariamente associadas a processos metabólicos e ao ciclo celular. A partir da integração dos resultados da proteómica com os da transcritómica foi possível concluir que as principais variações no conteúdo dos exossomas provenientes das células sensíveis e resistentes à doxorrubicina (modelos 2D) estavam correlacionadas com o crescimento celular e com a resposta a compostos orgânicos. O aumento de determinados genes envolvidos com a resposta a compostos orgânicos, como é o caso do ALDH1A3, podem ser diretamente correlacionado com a presença e resistência ao composto orgânico. Já para o caso dos exossomas derivados da linha sensível em modelos 2 e 3D, as principais diferenças nos constituintes dos exossomas entre as condições estavam relacionadas com a matriz extracelular e com processos metabólicos, que podem ser explicadas pelas diferenças no crescimento e interação celular associada a cada modelo.Cancer is a disease that affects the human population on a large scale, and one of the most prominent for its malignancy is colorectal cancer due to its high incidence and mortality in both genders. As a result of the need to identify biomarkers for an early diagnosis of the disease or biomarkers of resistance to chemotherapeutic agents, a new diagnostic technology has emerged, the so-called liquid biopsies, through which biological samples are obtained in a non-invasive way from which tumor-derived components are analyzed. One of these components are exosomes, membrane nanovesicles secreted by all types of cells, which play an essential role in cell communication due to their ability to modulate the phenotypic response of recipient cells through the transfer of active biomolecules such as proteins, nucleic acids and lipids. The main objective of the present thesis was to characterize the composition of exosomes in terms of proteins and RNA excreted from 2D and 3D cell models derived from colorectal carcinoma cells sensitive or resistant to doxorubicin in order to determine whether these nanovesicles can possess a role in the induction or maintenance of drug resistance among cells. Another objective focused on the perception of the effect of the greater complexity of 3D models on the composition of exosomes, considering that they allow a greater mimicry of the tumor microenvironment in vivo. An analysis of protein contents shown as differences in protein expression were generally associated with cell proliferation and structural organization of both the cytoskeleton and the extracellular matrix. On the other hand, an analysis of ribonucleic contents indicates variations between the conditions tested, mostly associated with metabolic processes and the cell cycle. From the integration of proteomics with transcriptomics, it was possible to conclude that the main variations in the content of exosomes from doxorubicin-sensitive and resistant cells (2D models) were correlated with cell growth and with response to organic compounds. The increase in certain genes involved in the response to organic compounds, such as ALDH1A3, can be directly correlated with the presence and resistance to the organic compound. As for the case of exosomes derived from the sensitive line in 2 and 3D models, the main differences in the constituents of exosomes between conditions were related to ECM and metabolic processes, which can be explained by differences in growth and cell interaction associated with each model.Rodrigues, CatarinaFernandes, Maria AlexandraRUNLuz, André Filipe Machado da2022-01-192024-09-01T00:00:00Z2022-01-19T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10362/132743porinfo:eu-repo/semantics/embargoedAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2024-03-11T05:11:27Zoai:run.unl.pt:10362/132743Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-20T03:47:35.420934Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse |
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O cancro é uma doença que afeta em larga escala a população humana, sendo que um dos mais se destaca pela sua malignidade é o cancro colorretal devido à sua elevada incidência e mortalidade em ambos os géneros. Resultante de uma necessidade de identificação de biomarcadores para um diagnóstico precoce da doença ou biomarcadores de resistência a agentes quimioterapêuticos uma nova tecnologia de diagnostico tem surgido, as designadas biopsias líquidas, através das quais ocorre uma obtenção de amostras biológicas de uma forma não invasiva a partir da qual são analisados componentes derivados dos tumores. Um desses componentes são os exossomas, nanovesículas membranares excretadas por todo o tipo de células, que possuem um papel essencial na comunicação celular devido à sua capacidade de modular a resposta fenotípica das células recetoras através da transferência de biomoléculas ativas tais como proteínas, ácidos nucleicos e lípidos. A presente tese teve como objetivo principal uma caracterização da composição dos exossomas em termos proteicos e de RNA excretados a partir de modelos celulares 2D e 3D derivados de células de carcinoma colorretal sensíveis ou resistentes à doxorrubicina de modo a perceber se estas nanovesículas podem possuir um papel na indução ou manutenção da resistência a fármacos entre células. Um outro objetivo focava-se na perceção do efeito da maior complexidade dos modelos 3D na composição dos exossomas tendo em conta que estes permitem uma maior mimetização do microambiente tumoral in vivo. A análise dos conteúdos proteicos mostrou que as diferenças de expressão proteica estavam, de um modo geral, associadas à proliferação celular e a organização estrutural, quer do citoesqueleto quer da matriz extracelular. Por outro lado, a análise por RNA-seq permitiu observar variações entre as condições testadas maioritariamente associadas a processos metabólicos e ao ciclo celular. A partir da integração dos resultados da proteómica com os da transcritómica foi possível concluir que as principais variações no conteúdo dos exossomas provenientes das células sensíveis e resistentes à doxorrubicina (modelos 2D) estavam correlacionadas com o crescimento celular e com a resposta a compostos orgânicos. O aumento de determinados genes envolvidos com a resposta a compostos orgânicos, como é o caso do ALDH1A3, podem ser diretamente correlacionado com a presença e resistência ao composto orgânico. Já para o caso dos exossomas derivados da linha sensível em modelos 2 e 3D, as principais diferenças nos constituintes dos exossomas entre as condições estavam relacionadas com a matriz extracelular e com processos metabólicos, que podem ser explicadas pelas diferenças no crescimento e interação celular associada a cada modelo. |
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