Vírus de Genoma de RNA em mosquitos: deteção molecular, caracterização genética e isolamento em culturas de células de mosquito

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Silva, Manuel Tomás da
Data de Publicação: 2020
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10362/91830
Resumo: RESUMO: O Algarve é uma zona de confluência de diversos fatores, entre os quais o elevado interesse turístico, a proximidade ao norte de África e sul de Espanha e a presença de aves migratórias, que fazem dele um ponto de interesse para o estudo de arbovírus em Portugal. Para tal, foi rastreada a presença de Flavivirus, alguns Orthobunyavirus e Phlebovirus em mosquitos colhidos nesta região. Simultaneamente, numa colaboração com Moçambique, foi realizado um rastreio idêntico em diferentes populações de mosquitos naquele país. Dos 2.837 mosquitos capturados no Algarve, foram analisados 1.801, divididos em 50 lotes. Nestes foi possível identificar três amplicões compatíveis com a presença de Flavivirus, 11 com a presença de Phlebovirus mas nenhuma com a presença de Orthobunyavirus. A análise das sequências de flavivírus mostrou homologia com sequências de flavivírus específicos de insetos que se sabe circularem no Algarve. Contudo, uma vez feita a análise filogenética das sequências que aparentavam ter origem em Phlebovirus, foi constatado que não estavam incluídas neste género, mas sim num género por denominar, pertencente à família Phenuiviridae. Dos mosquitos provenientes de Moçambique, foi possível obter 20 amplicões compatíveis com a presença de Flavivirus, sete com a presença de Phlebovirus mas nenhuma com a presença de Orthobunyavirus. Uma vez realizada a análise filogenética das sequências originárias de flavivírus, foi possível verificar que todas elas pertenciam ao grupo monofilético dos flavivírus específicos de insetos clássicos. As sequências que se esperava derivarem de flebovírus agruparam fora deste género, estando distribuídas pela família Phenuiviridae. Por fim, de modo a tentar confirmar se as sequências obtidas no decorrer deste trabalho tiveram origem em vírus viáveis e de maneira a tentar obter o genoma completo dos vírus, estes foram tentativamente isolados em células C6/36. Contudo, embora tenham sido isolados vírus, destes pareceu corresponder aos detetados durante o rastreio efetuado.
id RCAP_b8aaf2d983b83ceb46a1696d1cd13222
oai_identifier_str oai:run.unl.pt:10362/91830
network_acronym_str RCAP
network_name_str Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
repository_id_str 7160
spelling Vírus de Genoma de RNA em mosquitos: deteção molecular, caracterização genética e isolamento em culturas de células de mosquitoArbovírusAlgarveMoçambiqueVírus de mosquitosArbovirusesMozambiqueAlgarveMosquito virosesCiências MédicasRESUMO: O Algarve é uma zona de confluência de diversos fatores, entre os quais o elevado interesse turístico, a proximidade ao norte de África e sul de Espanha e a presença de aves migratórias, que fazem dele um ponto de interesse para o estudo de arbovírus em Portugal. Para tal, foi rastreada a presença de Flavivirus, alguns Orthobunyavirus e Phlebovirus em mosquitos colhidos nesta região. Simultaneamente, numa colaboração com Moçambique, foi realizado um rastreio idêntico em diferentes populações de mosquitos naquele país. Dos 2.837 mosquitos capturados no Algarve, foram analisados 1.801, divididos em 50 lotes. Nestes foi possível identificar três amplicões compatíveis com a presença de Flavivirus, 11 com a presença de Phlebovirus mas nenhuma com a presença de Orthobunyavirus. A análise das sequências de flavivírus mostrou homologia com sequências de flavivírus específicos de insetos que se sabe circularem no Algarve. Contudo, uma vez feita a análise filogenética das sequências que aparentavam ter origem em Phlebovirus, foi constatado que não estavam incluídas neste género, mas sim num género por denominar, pertencente à família Phenuiviridae. Dos mosquitos provenientes de Moçambique, foi possível obter 20 amplicões compatíveis com a presença de Flavivirus, sete com a presença de Phlebovirus mas nenhuma com a presença de Orthobunyavirus. Uma vez realizada a análise filogenética das sequências originárias de flavivírus, foi possível verificar que todas elas pertenciam ao grupo monofilético dos flavivírus específicos de insetos clássicos. As sequências que se esperava derivarem de flebovírus agruparam fora deste género, estando distribuídas pela família Phenuiviridae. Por fim, de modo a tentar confirmar se as sequências obtidas no decorrer deste trabalho tiveram origem em vírus viáveis e de maneira a tentar obter o genoma completo dos vírus, estes foram tentativamente isolados em células C6/36. Contudo, embora tenham sido isolados vírus, destes pareceu corresponder aos detetados durante o rastreio efetuado.ABSTRACT:The Algarve is a point of convergence of factors that make it an important area for the study of arboviruses. These include a high amount of tourists, its proximity to North Africa and the south of Spain and the presence of migratory birds. With that in mind, we screened the presence of flaviviruses, part of the orthobunyaviruses genus and phleboviruses in mosquitoes collected in that region. At the same time, in a collaboration with Mozambique, the same taxa were screened in different populations of mosquitoes from this country. Amog the 2,837 mosquitoes collected in the Algarve, 1,801 were screened for viral genomes while divided into 50 pools. In these 50 pools, it was possible to obtain three amplicons compatible with the presence of Flavivirus, 11 with the presence of Phlebovirus, but none with the presence of Orthobunyavirus. The analysis of the sequences of Flavivirus showed homology with sequences of insect-specific flaviviruses that are known to be present in the Algarve. Nonetheless, the analysis of the putative phleboviruses showed that the sequences were part of an unnamed genus in the Phenuiviridae family. Among the mosquitoes captured in Mozambique, 20 amplicons suggested the presence of Flavivirus, seven with the presence of Phlebovirus and none with the presence of Orthobunyavirus. The analysis of the flaviviruses sequences showed they all belong in the monophyletic group of insect-specific flaviviruses, while the putative “phleboviruses” were, in fact, distributed throughout the Phenuiviridae family. In order to confirm the origin of the sequences obtained in this work and to try and get the full genome of the viruses, C6/36 cells were used to isolate the viruses. However, and while some virus isolates were, indeed, obtained, these did not correspond found as a result of the molecular screening.Parreira, RicardoAlmeida, Paulo Gouveia deRUNSilva, Manuel Tomás da2022-10-14T00:31:22Z2020-01-062020-01-272020-01-06T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10362/91830TID:202367002porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2024-03-11T04:40:54Zoai:run.unl.pt:10362/91830Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-20T03:37:25.747614Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse
dc.title.none.fl_str_mv Vírus de Genoma de RNA em mosquitos: deteção molecular, caracterização genética e isolamento em culturas de células de mosquito
title Vírus de Genoma de RNA em mosquitos: deteção molecular, caracterização genética e isolamento em culturas de células de mosquito
spellingShingle Vírus de Genoma de RNA em mosquitos: deteção molecular, caracterização genética e isolamento em culturas de células de mosquito
Silva, Manuel Tomás da
Arbovírus
Algarve
Moçambique
Vírus de mosquitos
Arboviruses
Mozambique
Algarve
Mosquito viroses
Ciências Médicas
title_short Vírus de Genoma de RNA em mosquitos: deteção molecular, caracterização genética e isolamento em culturas de células de mosquito
title_full Vírus de Genoma de RNA em mosquitos: deteção molecular, caracterização genética e isolamento em culturas de células de mosquito
title_fullStr Vírus de Genoma de RNA em mosquitos: deteção molecular, caracterização genética e isolamento em culturas de células de mosquito
title_full_unstemmed Vírus de Genoma de RNA em mosquitos: deteção molecular, caracterização genética e isolamento em culturas de células de mosquito
title_sort Vírus de Genoma de RNA em mosquitos: deteção molecular, caracterização genética e isolamento em culturas de células de mosquito
author Silva, Manuel Tomás da
author_facet Silva, Manuel Tomás da
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Parreira, Ricardo
Almeida, Paulo Gouveia de
RUN
dc.contributor.author.fl_str_mv Silva, Manuel Tomás da
dc.subject.por.fl_str_mv Arbovírus
Algarve
Moçambique
Vírus de mosquitos
Arboviruses
Mozambique
Algarve
Mosquito viroses
Ciências Médicas
topic Arbovírus
Algarve
Moçambique
Vírus de mosquitos
Arboviruses
Mozambique
Algarve
Mosquito viroses
Ciências Médicas
description RESUMO: O Algarve é uma zona de confluência de diversos fatores, entre os quais o elevado interesse turístico, a proximidade ao norte de África e sul de Espanha e a presença de aves migratórias, que fazem dele um ponto de interesse para o estudo de arbovírus em Portugal. Para tal, foi rastreada a presença de Flavivirus, alguns Orthobunyavirus e Phlebovirus em mosquitos colhidos nesta região. Simultaneamente, numa colaboração com Moçambique, foi realizado um rastreio idêntico em diferentes populações de mosquitos naquele país. Dos 2.837 mosquitos capturados no Algarve, foram analisados 1.801, divididos em 50 lotes. Nestes foi possível identificar três amplicões compatíveis com a presença de Flavivirus, 11 com a presença de Phlebovirus mas nenhuma com a presença de Orthobunyavirus. A análise das sequências de flavivírus mostrou homologia com sequências de flavivírus específicos de insetos que se sabe circularem no Algarve. Contudo, uma vez feita a análise filogenética das sequências que aparentavam ter origem em Phlebovirus, foi constatado que não estavam incluídas neste género, mas sim num género por denominar, pertencente à família Phenuiviridae. Dos mosquitos provenientes de Moçambique, foi possível obter 20 amplicões compatíveis com a presença de Flavivirus, sete com a presença de Phlebovirus mas nenhuma com a presença de Orthobunyavirus. Uma vez realizada a análise filogenética das sequências originárias de flavivírus, foi possível verificar que todas elas pertenciam ao grupo monofilético dos flavivírus específicos de insetos clássicos. As sequências que se esperava derivarem de flebovírus agruparam fora deste género, estando distribuídas pela família Phenuiviridae. Por fim, de modo a tentar confirmar se as sequências obtidas no decorrer deste trabalho tiveram origem em vírus viáveis e de maneira a tentar obter o genoma completo dos vírus, estes foram tentativamente isolados em células C6/36. Contudo, embora tenham sido isolados vírus, destes pareceu corresponder aos detetados durante o rastreio efetuado.
publishDate 2020
dc.date.none.fl_str_mv 2020-01-06
2020-01-27
2020-01-06T00:00:00Z
2022-10-14T00:31:22Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10362/91830
TID:202367002
url http://hdl.handle.net/10362/91830
identifier_str_mv TID:202367002
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
instacron:RCAAP
instname_str Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
instacron_str RCAAP
institution RCAAP
reponame_str Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
collection Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
repository.name.fl_str_mv Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1799137991146340352