Sequenciação de nova geração e efetividade da vacina antigripal: um estudo sobre o vírus da gripe A(H3), em doentes com síndroma gripal, épocas 2016/2017 e 2017/2018

• Autor(a) principal: Pechirra, Pedro
• Data de Publicação: 2018
• Outros Autores: Borges, Vítor, Cristóvão, Paula, Costa, Inês, Conde, Patrícia, Machado, Ausenda, Rodrigues, Ana Paula, Gomez, Verónica, Kislaya, Irina, Mendonça, Joana, Nunes, Baltazar, Gomes, João Paulo, Guiomar, Raquel
• Tipo de documento: Artigo
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10400.18/5694
• topic: Vírus da Gripe; Influenza; Vírus da Gripe A(H3); Vacina Antigripal; Efetividade da Vacina; Época 2016/2017; Época 2017/2018; Infecções Respiratórias; Doenças Infecciosas; Sequenciação de Nova Geração; Sequenciação do Genoma Completo; Vigilância Laboratorial; Saúde Pública; Portugal

A tecnologia de sequenciação de nova geração (NGS) permite uma análise genética do vírus da gripe muito mais profunda, quando comparada com a sequenciação pelo método de Sanger, pois permite a análise do genoma viral completo (e não apenas do gene da hemaglutinina). O presente estudo teve como objectivo realizar a análise filogenética e mutacional do vírus da gripe A(H3) de forma a pesquisar possíveis marcadores genéticos e padrões de recombinação que estejam relacionados com a efectividade vacinal. Foram obtidas sequências do genoma completo para 179 vírus A(H3), detectados em casos de síndroma gripal no âmbito do projecto EuroEVA/IMOVE+ durante duas épocas de gripe: 2016/2017 e 2017/2018. Dos vírus sequenciados, 28 pertenciam a vírus de casos vacinados (15,6%). Destes, apenas 16 apresentaram mutações não encontradas em casos não vacinados, no entanto, todas elas emergiram de forma esporádica. Foi revelada a existência de recombinação genómica intrasubtípica, e identificados 4 perfis distintos de recombinação. O grupo em que todos os segmentos genómicos são semelhantes a A/Singapore/INFIMH-16-0019/2016 foi o que registou uma maior percentagem de falhas da vacina (20,3%).