Recuperação de material biológico a partir do RapidHIT™ ID System
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2023 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/10362/163523 |
Resumo: | O RapidHIT™ ID, da Applied Biosystems, agiliza a análise forense de amostras de DNA e responde à necessidade de obtenção de resultados rápidos. O vestígio é colocado num cartridge de amostra, onde ocorre extração de DNA e amplificação por PCR. O RapidHIT™ ID realiza eletroforese capilar, obtendo-se perfis STR em 90-110 minutos. O presente projeto, realizado no setor de biologia do Laboratório da Polícia Científica da Polícia Judiciária, visava desenvolver um protocolo de recuperação de material biológico do cartridge do RapidHIT™ ID, para posterior processamento através do processamento analítico habitual, que inclui diversas etapas essenciais: Extração e purificação de DNA; Quantificação de DNA; Amplificação de DNA por PCR; Eletroforese capilar. Com o desenvolvimento deste protocolo de recuperação de material biológico, pretendia-se obter uma metodologia que per-mitisse obter perfis STR de boa qualidade, quando estes não foram obtidos através do Ra-pidHIT™ ID. Começou-se por entender o circuito interno do cartridge de amostra, e mapear a locali-zação de reagentes e componentes no seu interior. A identificação de locais de interesse per-mitiu a recolha de material biológico do cartridge, que foi determinante para desenvolver a etapa inicial de recuperação de material biológico, e estabelecer o tipo de amostras a recolher. Desenvolveram-se vários processamentos analíticos modificados, em que era alterada uma ou mais etapas do habitual processamento analítico, para melhorar a qualidade dos per-fis STR obtidos. Os resultados obtidos permitiram concluir que a extração e purificação, am-plificação por PCR e eletroforese capilar eram fundamentais para a obtenção de resultados. Também se evidenciou que a quantificação de algumas amostras recolhidas era incompatível com o equipamento de quantificação do LPC, pois não refletia a sua quantidade real de DNA. Numa última abordagem, através da diluição de amostras de DNA, melhorou-se considera-velmente a eficácia do protocolo de recuperação, traduzindo-se numa melhoria da qualidade dos perfis STR. |
id |
RCAP_cede2903e1ebbc3344da3dd8ed46a469 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:run.unl.pt:10362/163523 |
network_acronym_str |
RCAP |
network_name_str |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
repository_id_str |
7160 |
spelling |
Recuperação de material biológico a partir do RapidHIT™ ID SystemRapidHIT™ ID Systemcartridge de amostragenética forenseDNAextração de DNApurificação de DNADomínio/Área Científica::Engenharia e Tecnologia::Outras Engenharias e TecnologiasO RapidHIT™ ID, da Applied Biosystems, agiliza a análise forense de amostras de DNA e responde à necessidade de obtenção de resultados rápidos. O vestígio é colocado num cartridge de amostra, onde ocorre extração de DNA e amplificação por PCR. O RapidHIT™ ID realiza eletroforese capilar, obtendo-se perfis STR em 90-110 minutos. O presente projeto, realizado no setor de biologia do Laboratório da Polícia Científica da Polícia Judiciária, visava desenvolver um protocolo de recuperação de material biológico do cartridge do RapidHIT™ ID, para posterior processamento através do processamento analítico habitual, que inclui diversas etapas essenciais: Extração e purificação de DNA; Quantificação de DNA; Amplificação de DNA por PCR; Eletroforese capilar. Com o desenvolvimento deste protocolo de recuperação de material biológico, pretendia-se obter uma metodologia que per-mitisse obter perfis STR de boa qualidade, quando estes não foram obtidos através do Ra-pidHIT™ ID. Começou-se por entender o circuito interno do cartridge de amostra, e mapear a locali-zação de reagentes e componentes no seu interior. A identificação de locais de interesse per-mitiu a recolha de material biológico do cartridge, que foi determinante para desenvolver a etapa inicial de recuperação de material biológico, e estabelecer o tipo de amostras a recolher. Desenvolveram-se vários processamentos analíticos modificados, em que era alterada uma ou mais etapas do habitual processamento analítico, para melhorar a qualidade dos per-fis STR obtidos. Os resultados obtidos permitiram concluir que a extração e purificação, am-plificação por PCR e eletroforese capilar eram fundamentais para a obtenção de resultados. Também se evidenciou que a quantificação de algumas amostras recolhidas era incompatível com o equipamento de quantificação do LPC, pois não refletia a sua quantidade real de DNA. Numa última abordagem, através da diluição de amostras de DNA, melhorou-se considera-velmente a eficácia do protocolo de recuperação, traduzindo-se numa melhoria da qualidade dos perfis STR.The RapidHIT™ ID System, developed by Applied Biosystems, facilitates the speed up of forensic DNA sample analysis, addressing the need for obtaining results quickly. The DNA trace is placed inside sample cartridge, where DNA extraction and PCR amplification take place. The RapidHIT™ ID System performs capillary electrophoresis, generating STR profiles in 90-100 minutes. The current project, conducted in the biology sector of the Scientific Police Laboratory of the Judiciary Police, aimed to develop a protocol for recovering biological material from the cartridge for subsequent LPC standard analytical processing, which comprises several essen-tial steps: DNA extraction and purification; DNA quantification; DNA PCR amplification; Ca-pillary electrophoresis. The goal of this biological material recovery protocol was to obtain high-quality STR profiles when they couldn't be obtained using the RapidHIT™ ID System. The first step was to understand the internal circuit of the RapidHIT™ ID System sample cartridge and map the locations of reagents and components within it. Identifying areas of interest for collecting biological material was crucial in developing the initial stage of biologi-cal material recovery and determining which types of samples to recover. Several modified analytical processing workflows were developed, altering one or more steps of the standard analytical processing. The results obtained led to the conclusion that DNA extraction and purification, PCR DNA amplification, and capillary electrophoresis were fundamental steps to obtain results. It also became evident that some of the recovered sample types were incompatible with the LPC quantification equipment, because it did not accurately reflect the actual DNA quantity in those samples. In a final laboratory approach, through DNA sample dilution, the efficacy of the recovery protocol significantly improved, resulting in en-hanced STR profile quality.Ferreira, PauloBaptista, PedroRUNVieira, Beatriz Gameiro2024-02-14T16:20:07Z2023-122023-12-01T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10362/163523porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2024-03-11T05:47:07Zoai:run.unl.pt:10362/163523Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-20T03:59:26.906588Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse |
dc.title.none.fl_str_mv |
Recuperação de material biológico a partir do RapidHIT™ ID System |
title |
Recuperação de material biológico a partir do RapidHIT™ ID System |
spellingShingle |
Recuperação de material biológico a partir do RapidHIT™ ID System Vieira, Beatriz Gameiro RapidHIT™ ID System cartridge de amostra genética forense DNA extração de DNA purificação de DNA Domínio/Área Científica::Engenharia e Tecnologia::Outras Engenharias e Tecnologias |
title_short |
Recuperação de material biológico a partir do RapidHIT™ ID System |
title_full |
Recuperação de material biológico a partir do RapidHIT™ ID System |
title_fullStr |
Recuperação de material biológico a partir do RapidHIT™ ID System |
title_full_unstemmed |
Recuperação de material biológico a partir do RapidHIT™ ID System |
title_sort |
Recuperação de material biológico a partir do RapidHIT™ ID System |
author |
Vieira, Beatriz Gameiro |
author_facet |
Vieira, Beatriz Gameiro |
author_role |
author |
dc.contributor.none.fl_str_mv |
Ferreira, Paulo Baptista, Pedro RUN |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Vieira, Beatriz Gameiro |
dc.subject.por.fl_str_mv |
RapidHIT™ ID System cartridge de amostra genética forense DNA extração de DNA purificação de DNA Domínio/Área Científica::Engenharia e Tecnologia::Outras Engenharias e Tecnologias |
topic |
RapidHIT™ ID System cartridge de amostra genética forense DNA extração de DNA purificação de DNA Domínio/Área Científica::Engenharia e Tecnologia::Outras Engenharias e Tecnologias |
description |
O RapidHIT™ ID, da Applied Biosystems, agiliza a análise forense de amostras de DNA e responde à necessidade de obtenção de resultados rápidos. O vestígio é colocado num cartridge de amostra, onde ocorre extração de DNA e amplificação por PCR. O RapidHIT™ ID realiza eletroforese capilar, obtendo-se perfis STR em 90-110 minutos. O presente projeto, realizado no setor de biologia do Laboratório da Polícia Científica da Polícia Judiciária, visava desenvolver um protocolo de recuperação de material biológico do cartridge do RapidHIT™ ID, para posterior processamento através do processamento analítico habitual, que inclui diversas etapas essenciais: Extração e purificação de DNA; Quantificação de DNA; Amplificação de DNA por PCR; Eletroforese capilar. Com o desenvolvimento deste protocolo de recuperação de material biológico, pretendia-se obter uma metodologia que per-mitisse obter perfis STR de boa qualidade, quando estes não foram obtidos através do Ra-pidHIT™ ID. Começou-se por entender o circuito interno do cartridge de amostra, e mapear a locali-zação de reagentes e componentes no seu interior. A identificação de locais de interesse per-mitiu a recolha de material biológico do cartridge, que foi determinante para desenvolver a etapa inicial de recuperação de material biológico, e estabelecer o tipo de amostras a recolher. Desenvolveram-se vários processamentos analíticos modificados, em que era alterada uma ou mais etapas do habitual processamento analítico, para melhorar a qualidade dos per-fis STR obtidos. Os resultados obtidos permitiram concluir que a extração e purificação, am-plificação por PCR e eletroforese capilar eram fundamentais para a obtenção de resultados. Também se evidenciou que a quantificação de algumas amostras recolhidas era incompatível com o equipamento de quantificação do LPC, pois não refletia a sua quantidade real de DNA. Numa última abordagem, através da diluição de amostras de DNA, melhorou-se considera-velmente a eficácia do protocolo de recuperação, traduzindo-se numa melhoria da qualidade dos perfis STR. |
publishDate |
2023 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2023-12 2023-12-01T00:00:00Z 2024-02-14T16:20:07Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
format |
masterThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://hdl.handle.net/10362/163523 |
url |
http://hdl.handle.net/10362/163523 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação instacron:RCAAP |
instname_str |
Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação |
instacron_str |
RCAAP |
institution |
RCAAP |
reponame_str |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
collection |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação |
repository.mail.fl_str_mv |
|
_version_ |
1799138173758996480 |