SARS-CoV-2 serological survey on Cascais :
| Autor(a) principal: | |
|---|---|
| Data de Publicação: | 2022 |
| Tipo de documento: | Dissertação |
| Idioma: | eng |
| Título da fonte: | Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
| Texto Completo: | http://hdl.handle.net/10451/58485 |
Resumo: | Tese de mestrado, Ciências Biofarmacêuticas, 2022, Universidade de Lisboa, Faculdade de Farmácia. |
| id |
RCAP_f1cfba9f3f271bdbcbf69c3d077e144c |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:repositorio.ul.pt:10451/58485 |
| network_acronym_str |
RCAP |
| network_name_str |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
| repository_id_str |
7160 |
| spelling |
SARS-CoV-2 serological survey on Cascais :a comparative study between migrants and nativesSerological surveySARS-CoV-2COVID-19AntibodiesMigrantsTeses de mestrado - 2022Ciências da SaúdeTese de mestrado, Ciências Biofarmacêuticas, 2022, Universidade de Lisboa, Faculdade de Farmácia.A pandemia causada pelo SARS-CoV-2, começou no final de 2019. Em pouco tempo, espalhou-se rapidamente por todo o mundo. Para avaliar o impacto da pandemia de SARS-CoV-2, foi realizado um inquérito serológico no concelho de Cascais e disponível para todos os residentes de Cascais. Neste inquérito serológico foi realizado um teste serológico por laboratórios privados de Cascais juntamente com um questionário sobre dados sociodemográficos, dados clínicos, sintomas e comportamentos relacionados com a COVID-19. O objetivo do estudo foi avaliar a seroprevalência de anticorpos para SARS-CoV-2 e identificar fatores sociodemográficos, clínicos e comportamentais associados à seropositividade para SARS-CoV-2 na população de residentes em Cascais. Neste estudo analisámos 4410 questionários obtidos entre 21 de Maio e 1 de Outubro de 2020, para os quais estava disponível informação sobre o país de origem. Desta forma foi conseguido avaliar a seroprevalência do SARS-CoV-2 nos migrantes e na população portuguesa residente em Cascais e estudar a associação entre a seroprevalência e história de doença crónica, sintomas reportados e teste PCR positivo, na população migrante e portuguesa. A seroprevalência entre a população de migrantes foi de 2,02% (IC 95%: 1,33 – 3,07%) e a abordagem Bayesiana corrigiu a seroprevalência, tendo em conta a sensibilidade e especificidade do teste serológico, corrigiu para 1,93% (IC 95%: 1,25 – 2,71%), a seroprevalência quando comparada com a população portuguesa. Encontrou-se uma associação estatisticamente significativa entre a seroprevalência e o agregado familiar. Em relação aos fatores sociodemográficos, como sexo, faixa etária, situação profissional, escolaridade, freguesias e histórico de viagens, não foram encontradas associações estatisticamente significativas. No que diz respeito ao histórico de doenças crónicas da população migrante, não foram encontradas diferenças estatisticamente significativas entre os doentes crónicos e os não doentes, embora a população que se referiu não ser doente crónico tenha apresentado uma seroprevalência maior em relação aos doentes crónicos. Em relação ao histórico de COVID-19, para os migrantes, houve uma associação estatisticamente significativa entre teste serológico positivo e ter realizado um teste PCR anterior ((odds ratio 3,43 (IC 95%: 1,39 – 8,71), valor de p <0,005 ) e ter relatado um teste PCR anterior positivo ((odds ratio 24,46 (IC 95%: 0,60 – 988,64), valor p <0,002). Em relação aos sintomas da COVID-19, a seroprevalência foi maior entre os participantes que reportaram ter tido febre, calafrios, dor no peito, cefaleia, dor abdominal, anosmia (perda do olfato) e ageusia (perda do paladar). Para os sintomas anosmia (perda do olfato) e ageusia (perda do paladar) houve associação estatisticamente significativa com testes serológicos positivos (odds ratio 4,40 (IC 95%: 0,62 – 16,69), p-valor <0,05) e (odds ratio 9,65 (IC 95%: 2,01 – 32,81), valor p <0,001), respetivamente. Cerca de 57,14% (IC 95%: 36,55 – 75,53%) da população migrante reportou não ter apresentado nenhum sintoma sugestivo de infeção por COVID-19. Com base na relação entre os sintomas reportados e a reatividade dos testes serológicos, os sintomas cefaleia, febre, ageusia (perda do paladar), tosse e congestão nasal foram os de maior sensibilidade. Em relação às implicações relacionadas com a COVID-19, na população migrante, a seroprevalência foi maior entre os participantes que não procuraram atendimento médico 5,17% (IC 95%: 2,39 – 10,83%) em comparação com os que procuraram. Em relação aos internamentos ou cuidados intensivos por implicações da COVID-19, não foi possível avaliar a seroprevalência devido ao pequeno tamanho da amostra. Na população migrante, a seroprevalência entre aqueles que faltaram ao trabalho ou à escola foi estatisticamente significativa sendo que aqueles que não faltaram ao trabalho ou à escola, apresentado uma maior seroprevalência na população que faltou ao trabalho ou à escola, (associação estatisticamente significativa, odds ratio 3,91 (IC 95%: 0,83 – 12,81), valor p <0,05). Desde que a OMS declarou a COVID-19 como uma pandemia, os governos por todo o mundo impuseram limitações à mobilidade das suas populações, limitando a mobilidade das pessoas durante pelo menos 3 meses, começando no final do mês de Fevereiro até início do mês de Maio de 2020, causando consequências não apenas do ponto de vista da saúde física, mas também psicossocial da população. Contudo, as medidas de controle do COVID-19 podem não ter sido muito eficientes, devido a diversos fatores, tais como a transmissão de indivíduos assintomáticos. A aquisição de medidas de proteção individuais e coletivas são preponderantes para minimizar o impacto da doença na saúde pública global, contendo a propagação da doença COVID-19. Os inquéritos serológicos são abordagens importantes para identificar casos de infeção por SARS-CoV-2 não detetados anteriormente e para entender a duração dos anticorpos para SARS-CoV-2. Além disso, quando combinado com dados sociodemográficos e clínicos, permite compreender padrões de infeção por SARS-CoV-2 em diferentes grupos. Dada a grande quantidade de dados recolhidos em Cascais, este inquérito é um importante exemplo de uma iniciativa de um município que gerou uma grande quantidade de dados científicos que podem ser utilizados para orientar futuras medidas de prevençãoThe outbreak of 2019-novel coronavirus disease (COVID-19), caused by SARS-CoV-2, started in late 2019. In a short time, it spread rapidly all over the world. To assess the impact of SARS-CoV-2 pandemic, a serological survey was performed on the Cascais municipality and offered to all Cascais residents. In this serological survey, a serological test was offered by private labs in Cascais together with a questionnaire concerning socio-demographic, clinical, symptoms and COVID-19 related behavior. The aim of the study was to assess the seroprevalence of antibodies to SARS-CoV-2 and to identify sociodemographic, clinical, and behavioral factors associated with seropositivity for SARS-CoV-2 on the population of residents of Cascais. In this study we analyzed 4410 questionnaires obtained between May 21st and October 1st, 2020 for which information about country of origin was available, in order to evaluate the seroprevalence of SARS-CoV-2 in the migrants and Portuguese population residing in Cascais and to study the association between the seroprevalence and the history of chronic disease, symptoms reported and PCR positive test, among the Migrants and Portuguese population. We established the specific objectives of characterizing the socio-demographics and symptoms reported by the Migrants individuals and the Portuguese individuals, to verify a potential association between the occurrence of symptoms and the results of the serological test result and to assess the most prevalent symptoms reported and their chronic disease history on both categorized groups, migrants and Portuguese individuals, and their use of health care assistance. The Seroprevalence among the migrants population was estimated to be 2.02% (95% CI: 1.33 – 3.07%) and the Bayesian approach corrected the seroprevalence, knowing the sensitivity and specificity of the serological test, to 1.93% (95% CI: 1.25 – 2.71%), higher seroprevalence when compared to the portuguese population. A consistent statistically significant association was found between the seroprevalence and the household size. Regarding to the other sociodemographic factors such as sex, age group, employment status, educational level, parishes, and history of travel, no statistically significant associations were found. Concerning the history of chronic diseases of the migrants population, no statistically significant differences were found between the chronically ill and non-ill, although the population who reported to be non-chronic ill showed a higher seroprevalence compared to the chronically ill. Regarding to the COVID-19 history, and for the migrants, there was a statistically significant association between positive serological testing and having performed a previous PCR test ((odds ratio 3.43 (95% CI: 1.39 – 8.71), p-value <0.005) and having reported a previous positive PCR test ((odds ratio 24.46 (95% CI: 0.60 – 988.64), p-value <0.002). Concerning to the COVID-19 symptoms, the seroprevalence was higher among the participants who reported to have had fever, chills, chest pain, headache, abdominal pain, anosmia (loss of smell) and ageusia (loss of taste). For the symptoms anosmia (loss of smell) and ageusia (loss of taste) there was a statistically significant association with positive serological tests (odds ratio 4.40 (95% CI: 0.62 – 16.69), p-value <0.05) and (odds ratio 9.65 (95% CI: 2.01 – 32.81), p-value <0.001), respectively. About 57.14% (95% CI: 36.55 – 75.53%) of the migrant population reported to not have had any symptoms suggestive of COVID-19 infection. Based on the relation between reported symptoms and serological tests reactivity, the symptoms headache, fever, ageusia (loss of taste), cough and nasal congestion were the ones with higher sensitivity. Regarding to COVID-19 related implications, on the migrants population, the seroprevalence among the participants who sought medical assistance was higher compared to those who did not seek medical assistance, being 5.17% (95% CI: 2.39 – 10.83%) for those who sought. Regarding to the hospitalizations or intensive care due to COVID-19 implications, it was not possible to assess the seroprevalence due to the small sample size. On the migrant population, the seroprevalence among those who missed work or school was significantly different from those who did not miss work or school and estimated to be 5.88% (95% CI: 2.02 – 15.92), (statistically significant association, odds ratio 3.91 (95% CI: 0.83 – 12.81), p-value <0.05). After the WHO declared the COVID-19 as a pandemic, governments across the globe mandated lockdowns on their population, limiting people’s mobility during at least 3 months from the end of February to beginning of May, causing consequences not only from the health point of view, but also psychosocial. However, the measures to control the COVID-19 cannot be very efficient, due to several factors such as transmission from asymptomatic individuals. The acquisition of individual and collective protection measures are preponderant to minimize the impact of the disease on global public health, mitigating the spread of COVID-19 disease. Serological surveys are important approaches to identify previously undetected cases of SARS-CoV-2 infection and to understand the duration of antibodies to SARS-CoV-2. Furthermore, when combined with socio-demographic and clinical data, it allows to understand patterns of infection with SARS-CoV-2 in different groups. Given the large amount of data collected in Cascais, this survey is an important example of a municipality initiative that generated a large amount of scientific data that can be used to guide future prevention measures.Instituto Higiene e Medicina Tropical (IHMT-NOVA); Município de Cascais; Germano de Sousa; Joaquim Chaves.Abecasis, Ana B.Seabra, SofiaBártolo, Inês Isabel FernandesRepositório da Universidade de LisboaMerca, Francisco José dos Santos2023-07-06T13:57:10Z2022-09-232022-10-242022-09-23T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10451/58485TID:203082400enginfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2023-11-08T17:07:02Zoai:repositorio.ul.pt:10451/58485Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-19T22:08:33.977224Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse |
| dc.title.none.fl_str_mv |
SARS-CoV-2 serological survey on Cascais : a comparative study between migrants and natives |
| title |
SARS-CoV-2 serological survey on Cascais : |
| spellingShingle |
SARS-CoV-2 serological survey on Cascais : Merca, Francisco José dos Santos Serological survey SARS-CoV-2 COVID-19 Antibodies Migrants Teses de mestrado - 2022 Ciências da Saúde |
| title_short |
SARS-CoV-2 serological survey on Cascais : |
| title_full |
SARS-CoV-2 serological survey on Cascais : |
| title_fullStr |
SARS-CoV-2 serological survey on Cascais : |
| title_full_unstemmed |
SARS-CoV-2 serological survey on Cascais : |
| title_sort |
SARS-CoV-2 serological survey on Cascais : |
| author |
Merca, Francisco José dos Santos |
| author_facet |
Merca, Francisco José dos Santos |
| author_role |
author |
| dc.contributor.none.fl_str_mv |
Abecasis, Ana B. Seabra, Sofia Bártolo, Inês Isabel Fernandes Repositório da Universidade de Lisboa |
| dc.contributor.author.fl_str_mv |
Merca, Francisco José dos Santos |
| dc.subject.por.fl_str_mv |
Serological survey SARS-CoV-2 COVID-19 Antibodies Migrants Teses de mestrado - 2022 Ciências da Saúde |
| topic |
Serological survey SARS-CoV-2 COVID-19 Antibodies Migrants Teses de mestrado - 2022 Ciências da Saúde |
| description |
Tese de mestrado, Ciências Biofarmacêuticas, 2022, Universidade de Lisboa, Faculdade de Farmácia. |
| publishDate |
2022 |
| dc.date.none.fl_str_mv |
2022-09-23 2022-10-24 2022-09-23T00:00:00Z 2023-07-06T13:57:10Z |
| dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| format |
masterThesis |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://hdl.handle.net/10451/58485 TID:203082400 |
| url |
http://hdl.handle.net/10451/58485 |
| identifier_str_mv |
TID:203082400 |
| dc.language.iso.fl_str_mv |
eng |
| language |
eng |
| dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
| dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação instacron:RCAAP |
| instname_str |
Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação |
| instacron_str |
RCAAP |
| institution |
RCAAP |
| reponame_str |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
| collection |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
| repository.name.fl_str_mv |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação |
| repository.mail.fl_str_mv |
|
| _version_ |
1799134640554901504 |